Otevřená databáze krystalografie - Crystallography Open Database - Wikipedia

Otevřená databáze krystalografie (COD)
Obsah
Popis	Krystal struktury a platforma pro celosvětovou spolupráci
Kontakt
Výzkumné centrum	Vilniuská univerzita
Autoři	Saulius Gražulis
Primární citace	Gražulis & al. (2012)
Datum vydání	2004
Přístup
Datový formát	Krystalografický informační soubor (.cif)
webová stránka	http://www.crystallography.net
Veřejnost SQL přístup	http://wiki.crystallography.net/howtoquerycod/

The Otevřená databáze krystalografie (TRESKA) je databáze krystal struktur.^[1] Na rozdíl od podobných krystalografie databáze, databáze je zcela otevřená a registrovaní uživatelé mohou do databáze přispívat publikovanými i nepublikovanými strukturami malých molekul a krystalů malých a středních buněk. K květnu 2016 má databáze více než 360 000 záznamů.^[2] Databáze má různé přispěvatele a obsahuje Krystalografické informační soubory jak je definováno v Mezinárodní unie krystalografie (IUCr). V současné době existuje po celém světě pět webů, které tuto databázi zrcadlí. 3D struktury sloučenin lze převést na vstupní soubory pro 3D tiskárny.^[3]

Viz také

Reference

^ ^A ^b Gražulis, Saulius; Daškevič Adriana; Merkys Andrius; Chateigner Daniel; Lutterotti Luca; Quirós Miguel; Serebryanaya Nadezhda R; Moeck Peter; Downs Robert T; Le Bail Armel (leden 2012). „Otevřená databáze krystalografie (COD): kolekce otevřených přístupů křišťálových struktur a platforma pro celosvětovou spolupráci“. Nucleic Acids Res. Anglie. 40 (Problém s databází): D420-7. doi:10.1093 / nar / gkr900. PMC 3245043. PMID 22070882.
^ Oxford Journal - Výzkum nukleových kyselin Otevřená databáze krystalografie (COD): otevřená kolekce krystalových struktur a platforma pro celosvětovou spolupráci5. října 2011
^ Scalfani, Vincent F .; Williams, Antony J .; Tkachenko, Valery; Karapetyan, Karen; Pshenichnov, Alexey; Hanson, Robert M .; Liddie, Jahred M .; Bara, Jason E. (23. listopadu 2016). "Programový převod krystalických struktur do 3D souborů pro tisk pomocí Jmol". Journal of Cheminformatics. 8 (1). doi:10.1186 / s13321-016-0181-z. PMC 5122160.

externí odkazy

[pmid22070882-1] A ^b Gražulis, Saulius; Daškevič Adriana; Merkys Andrius; Chateigner Daniel; Lutterotti Luca; Quirós Miguel; Serebryanaya Nadezhda R; Moeck Peter; Downs Robert T; Le Bail Armel (leden 2012). „Otevřená databáze krystalografie (COD): kolekce otevřených přístupů křišťálových struktur a platforma pro celosvětovou spolupráci“. Nucleic Acids Res. Anglie. 40 (Problém s databází): D420-7. doi:10.1093 / nar / gkr900. PMC 3245043. PMID 22070882.

[2] Oxford Journal - Výzkum nukleových kyselin Otevřená databáze krystalografie (COD): otevřená kolekce krystalových struktur a platforma pro celosvětovou spolupráci5. října 2011

[3] Scalfani, Vincent F .; Williams, Antony J .; Tkachenko, Valery; Karapetyan, Karen; Pshenichnov, Alexey; Hanson, Robert M .; Liddie, Jahred M .; Bara, Jason E. (23. listopadu 2016). "Programový převod krystalických struktur do 3D souborů pro tisk pomocí Jmol". Journal of Cheminformatics. 8 (1). doi:10.1186 / s13321-016-0181-z. PMC 5122160.

[1]

[2]

[3]