Collaborative Drug Discovery - Collaborative Drug Discovery
Soukromé | |
Průmysl | Humanitní vědy, informatika |
Založený | 2004 |
Hlavní sídlo | Burlingame, Kalifornie |
produkty | CDD Vault, CDD Collaborate, Veřejné CDD |
webová stránka | www.collaborativedrug.com |
Collaborative Drug Discovery (CDD) je softwarová společnost založená v roce 2004 jako spin-out společnosti Eli Lilly Barry Bunin, PhD. CDD nabízí webové databázové řešení pro správu objev drog data, primárně kolem malých molekul a související data biologických testů.
produkty
CDD Vault[1][2] je úplná informatika webová platforma Collaborative Drug Discovery. Obsahuje několik modulů pro spolupracující projektové týmy pro správu, analýzu a sdílení soukromých i veřejných dat. Používají jej biotechnologické společnosti, CRO, akademické laboratoře, výzkumné nemocnice, společnosti zabývající se agrochemickým a spotřebním zbožím. CDD Vault je moderní webová aplikace pro chemická registrace, správa dat analýzy a SAR analýza. Je navržen tak, aby se snadno používal a byl extrémně bezpečný.
Moduly Vault CDD | Typ | Popis |
---|---|---|
Aktivita a registrace[3] | Systém registrace chemikálií | Webová aplikace v CDD Vault pro registraci chemikálií, správu dat analýzy a analýzu SAR. |
Vizualizace[4] | Vědecká vizualizace | Webová aplikace v CDD Vault umožňující vykreslování a analýzu velkých datových sad za účelem nalezení zajímavých vzorů, aktivních hotspotů a odlehlých hodnot. |
ELN[5] | Elektronický laboratorní notebook | Webová aplikace v rámci CDD Vault, která integruje úplné analytické a vizualizační prostředí s datovými úložišti chemických a biologických testů. |
Inventář[6] | Software pro správu zásob | Webová aplikace integrovaná do CDD Vault pro sledování dodávek a umístění sloučenin a činidel. |
Veřejné CDD[7] | Chemická databáze | Bezplatná databáze také integrovaná do CDD Vault pro podporu otevřené spolupráce obsahující více než 3 miliony molekul přístupných všem v komunitě objevujících léky. |
Spolupráce
Schopnost spolupráce mezi skupinami přitahovala pozornost od Bill & Melinda Gates Foundation, který v roce 2008 udělil CDD grant ve výši dvou milionů dolarů, který byl použit na podporu boje výzkumných pracovníků tuberkulóza.[8]
V roce 2010, GlaxoSmithKline uvolnilo 13 471 molekul testovaných na aktivitu proti malárie veřejnosti. Tyto molekuly a jejich související screeningová data jsou k dispozici prostřednictvím CDD Public, stejně jako v Národní lékařská knihovna PubChem a Evropský institut pro bioinformatiku ChEMBL databáze.[9] Tato data sloužila jako základ pro několik cheminformatika analýzy.[10][11][12]
V únoru 2011 se společnost CDD začala účastnit kolaborativního projektu MM4TB vedeného Stewartem Colem[13] a včetně účastníků z AstraZeneca a Sanofi Aventis.[14]
Viz také
- Software pro spolupráci
- Seznam softwarových balíků elektronických laboratorních notebooků
- Soupravy nástrojů pro cheminformatiku
Reference
- ^ http://tsdr.uspto.gov/documentviewer?caseId=sn77791158&docId=ORC20101207004753#docIndex=6&page=1
- ^ https://www.collaborativedrug.com/benefits/
- ^ https://www.collaborativedrug.com/benefits/activity-registration/
- ^ https://www.collaborativedrug.com/benefits/visualization/
- ^ https://www.collaborativedrug.com/benefits/eln/
- ^ https://www.collaborativedrug.com/benefits/inventory/
- ^ https://www.collaborativedrug.com/public-access/
- ^ „Collaborative Drug Discovery dostává grant na podporu rozvoje databáze pro urychlení objevování nových terapií proti tuberkulóze“. Archivovány od originál dne 06.07.2010. Citováno 2010-08-24.
- ^ Nový výzkum identifikuje slibné vodítka, která budou následovat při hledání léků na boj proti malárii Archivováno 01.06.2010 na Wayback Machine
- ^ Sean Ekins a Antony John Williams „Když farmaceutické společnosti zveřejní velké datové soubory: hojnost bohatství nebo bláznivé zlato? Drug Disc Today, 15; 812-815, 2010
- ^ Ekins S a Williams AJ „Metaanalýza vzorců molekulárních vlastností a filtrování veřejných datových souborů antimalarických„ nálezů “a drog, MedChemComm, 1: 325-330, 2010
- ^ Ekins S, Kaneko T, Lipinski CA, Bradford J, Dole K, Spektor A, Gregory K, Blondeau D, Ernst S, Yang J, Goncharoff N, Hohman M a Bunin BA, Analýza a filtrování zásahů velmi velké knihovny sloučenin prověřovaných proti Mycobacterium tuberculosis, Mol Biosyst, 6: 2316-2324, 2010
- ^ http://cole-lab.epfl.ch/
- ^ http://mm4tb.org/