Chematica - Chematica - Wikipedia
 | tento článek obsahuje obsah, který je napsán jako reklama. (Září 2014) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony) |
| Vývojáři | Elizabeth Wylie, Matthew Wampler-Doty, Ling Su, Andrea Cadeddu, Aaron Oppenheimer, Patrick Fuller, Malous Kossarian, Chris Gothard, Nosheen Gothard, Kamel Meguellati, Mikolaj Kowalik, Kyle Bishop, Bartosz Grzybowski |
|---|---|
| První vydání | N / A |
| Napsáno | Krajta, Jáva, C ++, Coffeescript |
| Plošina | Cross-platform |
| K dispozici v | Angličtina |
| Typ | Počítačová algebra, numerické výpočty, Informační vizualizace, statistika, vytvoření uživatelského rozhraní |
| Licence | Proprietární |
Chematica je software / databáze, která používá algoritmy a kolektivní databázi 250 let informací o organických chemických látkách k předpovídání a poskytování cest syntézy molekul. Vývoj softwaru vedený Bartoszem A. Grzybowskim probíhal desetiletí, kdy byl v srpnu 2012 konečně zveřejněn.
V roce 2017 byl software a databáze zcela zakoupeny společností Merck KGaA | MRK.[1][2] Software je komerčně dostupný od akvizice jako Synthia.[3]
Funkce
The software byl navržen tak, aby kombinoval dlouhé cesty syntézy do kratších a ekonomičtějších cest. Tento software má potenciál vylepšit hledání chemiků objev drog a další průmyslově důležité chemikálie. Odhaduje se, že sedm milionů chemikálií souvisí s počtem reakcí a katalogy 86 000 chemických pravidel.[4]Tento software doplňuje další pokusy, jako je manuální vyhledávání nebo poloautomatické vyhledávací nástroje, které pomocí zpětného sledování hodnotí každý možný krok. Bylo zjištěno, že zpětné sledování je neúčinné, protože i pětistupňová syntéza činí 1019 možné cesty.[5]
Lze určit molekulu několika způsoby, včetně vyhledávání podle Registrační číslo Beilstein, Registrační číslo CAS, chemický název, ÚSMĚVY strukturou nebo nakreslením samotného molekulárního diagramu.[6] Podporuje optimalizaci reakcí podle nákladů. Lze škálovat velikosti uzlů podle molekulové hmotnosti, výskytu produktu a výskytu reaktantu. Program také podporuje 3D modelování jednotlivých molekul a značení funkčních skupin.[6]
Program také zaznamenává regulované a neregulované sloučeniny a používá specializované algoritmy, které se jim vyhýbají. Rovněž uvádí klasifikaci a důvody regulace.[6]
Reakce v jedné nádobě
Tento software má potenciál určit cesty syntézy, které mohou probíhat reakcí „jedné nádoby“, kdy se všechny výchozí chemikálie smíchají současně, aby se získal konečný produkt, čímž se eliminuje jakékoli čištění a potřeba více kroků.[4]
Reference
- ^ Merck KGaA koupí Chematica Andy Extance ve společnosti ChemistryWorld; zveřejněno 12. května 2017; vyvoláno 1. ledna 2019
- ^ Klucznik, Tomasz; Mikulak-Klucznik, Barbara; McCormack, Michael P .; Lima, Heather; Szymkuć, Sara; Bhowmick, Manishabrata; Molga, Karol; Zhou, Yubai; Rickershauser, Lindsey; Gajewska, Ewa P .; Toutchkine, Alexei (březen 2018). „Efektivní syntéza různých, medicínsky relevantních cílů plánovaných počítačem a realizovaných v laboratoři“. Chem. 4 (3): 522–532. doi:10.1016 / j.chempr.2018.02.002. ISSN 2451-9294.
- ^ Synthia
- ^ A b Fellman, Megan. „Severozápadní vědci vytvářejí chemický mozek“. Northwestern University Press. Citováno 25. srpna 2012.
- ^ Grzybowski, Bartosz A .; Kyle J. M. Bishop; Mikołaj Kowalik; Chris M. Gothard; Aaron M. Drews; Nosheen A. Gothard; Alex Weckiewicz; Patrick E. Fuller (srpen 2012). „Paralelní optimalizace syntetických drah v síti organické chemie“. Angew. Chem. Int. Vyd. 51 (32): 7928–7932. doi:10,1002 / anie.201202209. PMID 22807100.
- ^ A b C Demonstrace Chematica. Květen 2012. Citováno 2013-04-09.