Lautropia mirabilis - Lautropia mirabilis
Lautropia mirabilis | |
---|---|
Vědecká klasifikace | |
Království: | |
Kmen: | |
Třída: | |
Objednat: | |
Rodina: | |
Rod: | |
Druh: | L. mirabilis |
Binomické jméno | |
Lautropia mirabilis Gerner-Smidt a kol. 1995[1] | |
Typ kmene | |
AB2188, ATCC 51599, CCM 4470, CCUG 34794, CIP 106317, DSM 11362, NCTC 12852[2] |
Lautropia mirabilis je Gramnegativní fakultativně anaerobní, oxidáza - a kataláza -pozitivní, pohyblivý bakterie z rod Lautropia a rodina Burkholderiaceae, izolovaný z úst dětí, které byly infikovány virus lidské imunodeficience.[3][4][5]
Popis a význam
Lautropia mirabilis je gramnegativní, polymorfní, pohyblivá, kokcidní bakterie,[6] který se nejčastěji vyskytuje v lidské ústní dutině a horních dýchacích cestách. Poprvé byl izolován v roce 1930 a byl identifikován jako Sarcina mirabilis. Jeho status jedinečného druhu však byl navržen až v roce 1994, kdy byl znovu objeven ve vzorcích z gingivální marže zdravých lidských pacientů.[6] Jeho status jako nový druh byl v roce 1995 potvrzen International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology.[7]
L. mirabilis lze pěstovat na všech neselektivních média kromě vaječného žloutku. Kromě toho, když L. mirabilis je naočkován na selektivní médium, nelze pozorovat žádný růst. Když se pěstují v kultivační půdě, jsou granule obvykle pozorovány volně přiléhající k straně zkumavky. Druh je a mezofil, s optimálním růstem omezeným mezi 30 a 44 ° C. Jako fakultativní anaerob, L. mirabilis je schopen růst v aerobních i anaerobních podmínkách; nejlépe však roste za aerobních podmínek.
Při kultivaci bakterií na pevném médiu lze pozorovat tři morfologie kolonií. Mladší kolonie mají tendenci tvořit ploché a suché kruhové tvarosloví. Po jednom dni však převládající formou je větší a více vrásčitá morfologie. Třetí typ kolonie je hladký, lesklý a kulatý a obklopuje ho sliznice.
Pod světelný mikroskop, lze pozorovat tři buněčné morfologie L mirabilis. První, a zapouzdřený koky přibližně 1 až 2 um v průměru, je nejběžnější morfologií, nezávislou na věku kultury. Druhým je pohyblivý koky, který má také průměr 1 až 2 um. Obvykle se vyskytuje na okraji kolonie po jednom dni kultivace. Tři a devět bičíků vyčnívá z buněčné stěny v a lophotrichous móda. A konečně, třetí morfologie je podobná sphaeroblastu. Má průměr 5 až 10 µm a obvykle se vyskytuje ve starších kulturách.
L. mirabilis byl izolován z dutin dětí infikovaných virem lidské imunodeficience [8] a sputum z cystická fibróza pacientů.[9] Navzdory těmto zjištěním četné studie také zjistily, že bakterie se častěji vyskytuje u zdravějších pacientů ve srovnání s pacienty s paradentóza.[10][11][12] Tyto studie naznačují L. mirabilis hraje roli při mnoha lidských nemocech; k pochopení funkční a mechanické role tohoto mikroorganismu při těchto onemocněních je však zapotřebí dalšího výzkumu.
Struktura genomu
Lineární DNA genom z Lautropia mirabilis kmen ATCC 51599 je zcela sekvenován. Je jen jeden chromozóm který má délku přibližně 3,15 Mb,[13] a žádná plazmidy byly objeveny.[6] Tato velikost genomu je ve srovnání s jinými druhy ve stejném pořadí, jako je Burkholderiales, malá, což může vysvětlovat jeho symbiontový vztah s lidmi.[14] Genom má celkem 2 498 protein kódování geny a Obsah GC tvoří 65,5%.[13] Existuje 41 tRNA a 51 pseudo geny byly identifikovány.[13]
Struktura buněk a metabolismus
Jako gram negativní bakterie, tenká peptidoglykan vrstvu obloženou třemi vrstvami na obou stranách lze pozorovat pomocí elektronový mikroskop.[6][8] Kromě toho většina bakterií v zavedené kolonii má membránovou vrstvu, která existuje mezi buňkami. V bakteriích lze obvykle pozorovat mnoho jemných elektronově hustých granulí.[8]
L. mirabilis je normálně izolován od člověka zubní plak. V těchto placích bakterie obvykle žijí s řadou dalších bakterií v supragingiválním nebo subgingiválním biofilm. Ačkoli počty gramnegativních bakterií začínají dominovat s rozvojem zánětu dásní, L. mirabilis čísla klesají.[12]
L. mirabilis zobrazuje pleomorfní povahu, která zahrnuje morfologie s bičíkem a bez bičíku. Ukázalo se, že bakterie zahrnují tři až devět bičíků vyčnívajících z jediného bodu buněčná stěna.[6] Tato morfologie je v souladu s bakteriemi s lophotrichous flagella, které ji používají pro pohyblivý transport.[15] Nebyl proveden žádný výzkum, který by objasnil užitečnost bičíku nebo jeho nedostatek.
L. mirabilis je fakultativně anaerobní. Je schopen kvasící glukóza, fruktóza, sacharóza a mannitol.[16] Bakterie rostou nejlépe za aerobních podmínek; nebyl však proveden žádný výzkum na aerobně specifických dýchacích cestách. Bakterie jsou pozitivní na oxidáza, kataláza a ureáza. Kromě toho je schopen snižování dusičnan a dusitany.[6]
Ekologie
The místo výskytu z L. mirabilis je gingivální okraj lidské ústní dutiny. Jako fakultativní anaerob je schopen žít na jakémkoli místě biofilmu. Zdá se, že mikrob je výlučný pro lidský orální mikrobiom. Vztah je potenciálně symbiotický kvůli jeho přítomnosti v zubním plaku, jakož i jeho významné přítomnosti u typicky zdravých pacientů.
Patologie
Přítomnost někoho L. mirabilis byla spojena s HIV pozitivními dětmi i se sputem jednoho pacienta s cystickou fibrózou. Použití antibiotika prokázal, že účinně snižuje růst bakterií v ústní dutině.
Aplikace na biotechnologii
V současné době nejsou žádné biotechnologické aplikace pro tyto mikroorganismy. Je známo, že organismus aktivně produkuje polysacharid po naočkování na misky se sacharosovým agarem.[6]
Aktuální výzkum
Nedávno nebyl proveden žádný výzkum, na který by se zaměřoval L. mirabilis. Existuje však řada nedávných studií, které identifikovaly bakterie u zdravých pacientů bez paradentózy a gingivitidy.
Reference
- ^ Seznam bakteriálních jmen se stojatými v nomenklatuře https://lpsn.dsmz.de/genus/lautropia
- ^ Kmenové informace o Lautropia mirabilis http://www.straininfo.net/strains/125224
- ^ Gerner-Smidt, P; Keizer-Nielsen, H; Dorsch, M; Stackebrandt, E; Ursing, J; Blom, J; Christensen, AC; Christensen, JJ; Frederiksen, W; Hoffmann, S (červenec 1994). „Lautropia mirabilis gen. Nov., Sp. Nov., Gramnegativní pohyblivý kokk s neobvyklou morfologií izolovaný z lidských úst“. Mikrobiologie. 140 (7): 1787–97. doi:10.1099/13500872-140-7-1787. PMID 8075812.
- ^ UTHealth http://digitalcommons.library.tmc.edu/uthdb_docs/2/
- ^ Prohlížeč taxonomie http://www.ccug.se/exlink/taxon_browser.cfm?search=Lautropia%20mirabilis
- ^ A b C d E F G GERNER-SMIDT, P .; KEIZER-NIELSEN, H .; DORSCH, M .; STACKEBRANDT, E .; URSING, J .; BLOM, J .; CHRISTENSEN, A. C .; CHRISTENSEN, J. J .; FREDERIKSEN, W. (1994). „Lautropia mirabilis gen. Nov., Sp. Nov., Gramnegativní pohyblivý kokk s neobvyklou morfologií izolovaný z lidských úst“. Mikrobiologie. 140 (7): 1787–1797. doi:10.1099/13500872-140-7-1787. PMID 8075812.
- ^ „Ověření zveřejnění nových jmen a nových kombinací dříve účinně publikovaných mimo IJSB“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 45 (2): 418–419. 1995. doi:10.1099/00207713-45-2-418.
- ^ A b C Rossmann, S. N .; Wilson, P. H .; Hicks, J .; Carter, B .; Cron, S. G .; Simon, C .; Flaitz, C. M .; Demmler, G. J .; Shearer, W. T. (červen 1998). „Izolace Lautropia mirabilis z ústních dutin dětí infikovaných virem lidské imunodeficience“. Journal of Clinical Microbiology. 36 (6): 1756–1760. ISSN 0095-1137. PMC 104914. PMID 9620414.
- ^ Ben Dekhil, S. M .; Peel, M. M .; Lennox, V. A .; Stackebrandt, E .; Sly, L. I. (duben 1997). „Izolace Lautropia mirabilis ze sputy pacienta s cystickou fibrózou“. Journal of Clinical Microbiology. 35 (4): 1024–1026. ISSN 0095-1137. PMC 229729. PMID 9157124.
- ^ Shaddox, L.M .; Huang, H .; Lin, T .; Hou, W .; Harrison, P.L .; Aukhil, I .; Walker, C.B .; Klepac-Ceraj, V .; Paster, B.J. (2012-08-03). "Mikrobiologická charakterizace u dětí s agresivní parodontitidou". Journal of Dental Research. 91 (10): 927–933. doi:10.1177/0022034512456039. PMC 3446830. PMID 22863892.
- ^ Colombo, Ana Paula V .; Bennet, Susan; Cotton, Sean L .; Goodson, J. Max; Kent, Ralph; Haffajee, Anne D .; Socransky, Sigmund S .; Hasturk, Hatice; Van Dyke, Thomas E. (2012-02-10). „Dopad parodontální terapie na subgingivální mikroflóru těžké parodontitidy: Srovnání mezi osobami s dobrou odpovědí a jedinci se refrakterní parodontitidou pomocí mikročipu pro identifikaci lidského orálního mikrobu“. Časopis periodontologie. 83 (10): 1279–1287. doi:10.1902 / jop.2012.110566. ISSN 0022-3492. PMC 3971922. PMID 22324467.
- ^ A b Huang, Shi; Yang, Fang; Zeng, Xiaowei; Chen, Jie; Li, Rui; Wen, Ting; Li, Chun; Wei, Wei; Liu, Jiquan (12. 12. 2011). „Předběžná charakterizace orální mikrobioty dospělých Číňanů se zánětem dásní a bez něj“. BMC Orální zdraví. 11: 33. doi:10.1186/1472-6831-11-33. ISSN 1472-6831. PMC 3254127. PMID 22152152.
- ^ A b C "Lautropia mirabilis (ID 3166) - genom - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Citováno 2017-09-22.
- ^ Voronina, Olga L .; Kunda, Marina S .; Ryzhova, Natalia N .; Aksenova, Ekaterina I .; Semenov, Andrey N .; Lasareva, Anna V .; Amelina, Elena L .; Chuchalin, Alexandr G .; Lunin, Vladimir G. (2015). „Variabilita zástupců Order Burkholderiales ve zdravotnických jednotkách“. BioMed Research International. 2015: 680210. doi:10.1155/2015/680210. ISSN 2314-6133. PMC 4465658. PMID 26114111.
- ^ Kodaka, H .; Armfield, A. Y .; Lombard, G. L .; Dowell, V. R. (listopad 1982). „Praktický postup pro prokázání bakteriálních bičíků“. Journal of Clinical Microbiology. 16 (5): 948–952. ISSN 0095-1137. PMC 272507. PMID 6185531.
- ^ Daneshvar, M. I .; Douglas, M. P .; Weyant, R. S. (listopad 2001). "Složení buněčných mastných kyselin Lautropia mirabilis". Journal of Clinical Microbiology. 39 (11): 4160–4162. doi:10.1128 / JCM.39.11.4160-4162.2001. ISSN 0095-1137. PMC 88505. PMID 11682548.