KMT5A - KMT5A

KMT5A
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1 ZKK, 2BQZ, 3F9W, 3F9X, 3F9Y, 3F9Z, 4IJ8, 5HQ2
Identifikátory
Aliasy	KMT5A, PR-Set7, SET07, SET8, SETD8, lysinmethyltransferáza 5A, PR / SET07
Externí ID	OMIM: 607240 MGI: 1915206 HomoloGene: 41372 Genové karty: KMT5A
EC číslo	2.1.1.354
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	123,409,353 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	124,462,308 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita protein-lysin N-methyltransferázy; • aktivita methyltransferázy; • GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106; • vazba p53; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita transferázy; • aktivita lysin-N-methyltransferázy; • aktivita histon-lysin N-methyltransferázy; • aktivita histonmethyltransferázy (specifická pro H4-K20);
Buněčná složka	• buněčné jádro; • nukleoplazma; • chromozóm; • cytosol;
Biologický proces	• methylace; • regulace transkripce, DNA-šablony; • monometylace peptidyl-lysinu; • buněčný cyklus; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace transkripce, DNA-šablony; • buněčné dělení; • transkripce, chráněná DNA; • regulace reakce poškození DNA, transdukce signálu mediátorem třídy p53; • methylace histon-lysin; • regulace přenosu signálu mediátorem třídy p53; • methylace histonu H4-K20; • organizace chromatinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	387893
	67956
	ENSG00000183955
	ENSMUSG00000049327
	Q9NQR1
	Q2YDW7
NM_020382; NM_001324504; NM_001324505; NM_001324506; NM_001367386;
	NM_001367388; NM_001367389
	NM_030241; NM_001310723; NM_001310725; NM_001310727
NP_001311433; NP_001311434; NP_001311435; NP_065115; NP_001354315;
	NP_001354317; NP_001354318
	NP_001297652; NP_001297654; NP_001297656; NP_084517
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

N-lysin methyltransferáza KMT5A je enzym že u lidí je kódován KMT5A gen.^[5]^[6]^[7]^[8] Enzym je a histon methyltransferáza, SET obsahující doménu a specifickou pro lysin. Enzym přenáší jeden methylová skupina na histon H4 lysin zbytek v poloze 20. S-Adenosyl methionin (SAM) je obojí kofaktor a donor methylové skupiny. Lysinový zbytek se převede na N⁶-methyllysin zbytek.

Vlevo: postranní řetězec lysinu. Další: N⁶-methyllysinový postranní řetězec.

Tato histonová modifikace je často zkrácena H4K20me1:

H4 - typ histonu
K - symbol lysinu
20 - poloha modifikovaného zbytku lysinu
me - zkratka pro methylovou skupinu
1 - počet přenesených methylových skupin

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000183955 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000049327 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Couture JF, Collazo E, Brunzelle JS, Trievel RC (červen 2005). "Strukturální a funkční analýza SET8, histon H4 Lys-20 methyltransferázy". Geny a vývoj. 19 (12): 1455–65. doi:10.1101 / gad.1318405. PMC 1151662. PMID 15933070.
^ Nishioka K, Rice JC, Sarma K, Erdjument-Bromage H, Werner J, Wang Y, Chuikov S, Valenzuela P, Tempst P, Steward R, Lis JT, Allis CD, Reinberg D (červen 2002). „PR-Set7 je nukleosomově specifická methyltransferáza, která modifikuje lysin 20 histonu H4 a je spojena s tichým chromatinem“. Molekulární buňka. 9 (6): 1201–13. doi:10.1016 / S1097-2765 (02) 00548-8. PMID 12086618.
^ Fang J, Feng Q, Ketel CS, Wang H, Cao R, Xia L, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Simon JA, Zhang Y (červenec 2002). „Čištění a funkční charakterizace SET8, methyltransferázy specifické pro nukleosomální histon H4-lysin 20“. Aktuální biologie. 12 (13): 1086–99. doi:10.1016 / S0960-9822 (02) 00924-7. PMID 12121615. S2CID 15504308.
^ "Entrezův gen: KMT5A lysinmethyltransferáza 5A [Homo sapiens (člověk)]" ".

Další čtení

{{PBB_Další_čtení | citace =

Mizzen CA, Yang XJ, Kokubo T, Brownell JE, Bannister AJ, Owen-Hughes T, Workman J, Wang L, Berger SL, Kouzarides T, Nakatani Y, Allis CD (prosinec 1996). "TAF (II) 250 podjednotka TFIID má aktivitu histon acetyltransferázy". Buňka. 87 (7): 1261–70. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81821-8. PMID 8980232. S2CID 18409257.
Rice JC, Nishioka K, Sarma K, Steward R, Reinberg D, Allis CD (září 2002). „Mitoticky specifická metylace histonu H4 Lys 20 sleduje zvýšenou expresi PR-Set7 a její lokalizaci na mitotické chromozomy“. Geny a vývoj. 16 (17): 2225–30. doi:10.1101 / gad.1014902. PMC 186671. PMID 12208845.
Schlisio S, Halperin T, Vidal M, Nevins JR (listopad 2002). „Interakce YY1 s E2F zprostředkovaná RYBP poskytuje mechanismus pro specifičnost funkce E2F“. Časopis EMBO. 21 (21): 5775–86. doi:10.1093 / emboj / cdf577. PMC 131074. PMID 12411495.
Xiao B, Jing C, Wilson JR, Walker PA, Vasisht N, Kelly G, Howell S, Taylor IA, Blackburn GM, Gamblin SJ (únor 2003). "Struktura a katalytický mechanismus lidské histonmethyltransferázy SET7 / 9" (PDF). Příroda. 421 (6923): 652–6. doi:10.1038 / nature01378. PMID 12540855. S2CID 4423407.
Xiao B, Jing C, Kelly G, Walker PA, Muskett FW, Frenkiel TA, Martin SR, Sarma K, Reinberg D, Gamblin SJ, Wilson JR (červen 2005). "Specifičnost a mechanismus histonmethyltransferázy Pr-Set7". Geny a vývoj. 19 (12): 1444–54. doi:10.1101 / gad.1315905. PMC 1151661. PMID 15933069.
Yin Y, Liu C, Tsai SN, Zhou B, Ngai SM, Zhu G (srpen 2005). „SET8 rozpoznává sekvenci RHRK20VLRDN na N konci histonu H4 a mono-methyláty lysinu 20“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (34): 30025–31. doi:10,1074 / jbc.M501691200. PMID 15964846.
Shi X, Kachirskaia I, Yamaguchi H, West LE, Wen H, Wang EW, Dutta S, Appella E, Gozani O (srpen 2007). „Modulace funkce p53 metylací zprostředkovanou SET8 na lysinu 382“. Molekulární buňka. 27 (4): 636–46. doi:10.1016 / j.molcel.2007.07.012. PMC 2693209. PMID 17707234.
Tanaka H, Takebayashi SI, Sakamoto A, Igata T, Nakatsu Y, Saitoh N, Hino S, Nakao M (únor 2017). „Methyltransferáza SETD8 / PR-Set7 funguje jako bariéra pro prevenci metabolické remodelace spojené se stárnutím“. Zprávy buněk. 18 (9): 2148–2161. doi:10.1016 / j.celrep.2017.02.021. PMID 28249161.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000183955 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000049327 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid15933070-5] Couture JF, Collazo E, Brunzelle JS, Trievel RC (červen 2005). "Strukturální a funkční analýza SET8, histon H4 Lys-20 methyltransferázy". Geny a vývoj. 19 (12): 1455–65. doi:10.1101 / gad.1318405. PMC 1151662. PMID 15933070.

[pmid12086618-6] Nishioka K, Rice JC, Sarma K, Erdjument-Bromage H, Werner J, Wang Y, Chuikov S, Valenzuela P, Tempst P, Steward R, Lis JT, Allis CD, Reinberg D (červen 2002). „PR-Set7 je nukleosomově specifická methyltransferáza, která modifikuje lysin 20 histonu H4 a je spojena s tichým chromatinem“. Molekulární buňka. 9 (6): 1201–13. doi:10.1016 / S1097-2765 (02) 00548-8. PMID 12086618.

[pmid12121615-7] Fang J, Feng Q, Ketel CS, Wang H, Cao R, Xia L, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Simon JA, Zhang Y (červenec 2002). „Čištění a funkční charakterizace SET8, methyltransferázy specifické pro nukleosomální histon H4-lysin 20“. Aktuální biologie. 12 (13): 1086–99. doi:10.1016 / S0960-9822 (02) 00924-7. PMID 12121615. S2CID 15504308.

[entrez-8] "Entrezův gen: KMT5A lysinmethyltransferáza 5A [Homo sapiens (člověk)]" ".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]