Irditoxin - Irditoxin - Wikipedia

Struktura irditoxinu, s podjednotkou A modře a podjednotkou B oranžově. V každé podjednotce intramolekulární disulfidové vazby jsou zobrazeny jako žluté tyčinky. Intramolekulární disulfidová vazba na rozhraní dimeru je zobrazena jako zelená a žlutá koule.[1]
Irditoxinová podjednotka A
Identifikátory
OrganismusBoiga nepravidelné
Symbol3 NBA
PDB2H7Z
UniProtA0S864
Irdixotinová podjednotka B
Identifikátory
OrganismusBoiga nepravidelné
Symbol3 NBB
PDB2H7Z
UniProtA0S865

Irditoxin je toxin pro tři prsty (3FTx) protein nalezen v jed z hnědý strom had (Boiga nepravidelné) a pravděpodobně u ostatních členů rod Boiga. Je to heterodimer složený ze dvou odlišných proteinových řetězců, z nichž každý je tříprstový proteinový záhyb, propojený mezimolekulou disulfidová vazba. Tato struktura je neobvyklá pro proteiny 3FTx, které jsou nejčastěji monomerní.[1][2][3]

Struktura

Toxin pro tři prsty (3FTx) proteiny kanonicky sestávají z přibližně 60-80 aminokyselinové zbytky které předpokládají strukturu se třemi „prsty“ beta řetězec -obsahující smyčky vyčnívající z jádra stabilizovaného čtyřmi intramolekulárními disulfidovými vazbami. Irditoxin je kovalentní heterodimer ve kterém jsou dvě podjednotky spojeny intermolekulárně disulfidová vazba. Každá podjednotka je z toxin pro tři prsty (3FTx) proteinová nadčeleď a nejtěsněji souvisí s „nekonvenční“ podtřídou 3FTx, charakterizovanou přítomností další disulfidové vazby v první z kanonických tří „prstových“ smyček. Každá podjednotka tedy obsahuje 11 cystein zbytky: osm kanonických zbytků, které tvoří disulfidové vazby jádra, dva v první smyčce tvořící nekonvenční disulfid a ten, který tvoří dimerní vazbu. Irditoxinové podjednotky A a B jsou 75 a 77 aminokyselinové zbytky dlouhý a každý má prodloužení o sedm zbytků s a kyselina pyroglutamová posttranslační modifikace na N-konec.[1][2]

Struktura Irditoxinu je v nadrodině 3FTx velmi neobvyklá.[2] Většina proteinů 3FTx jsou monomery. Nejlépe prostudovaná výjimka je kappa-bungarotoxin, nekovalentní homodimer s velmi odlišným interakce protein-protein povrch;[2] nedávno popsané alfa-cobratoxin také tvoří kovalentní homodimery a kovalentní heterodimery s nízkou abundancí s dalšími proteiny 3FTx nalezenými v monoklová kobra (Naja kaouthia) jed.[4] Dosud není jasné, jak dvě podjednotky irditoxinu přispívají k jeho biologickým aktivitám.[2]

Funkce

Irditoxin je hojný protein v jedu hada hnědého a tvoří asi 10% bílkoviny nalezené ve vzorcích jedu hnědých stromů hadů získaných z Guam, kde jsou invazivní druhy. Toxické účinky Irditoxinu jsou vysoce druhově závislé; při laboratorních testech je vysoce toxický ještěrky a ptactvo ale ne savci. I když molekulární mechanismus toxicity není jasný, irditoxin produkuje robustní post-synaptický blokáda signalizace u ptáků neuromuskulární spojení.[1]

Objev a nomenklatura

Irditoxin byl poprvé popsán v roce 2009 po izolaci ze vzorků jedu z hnědý strom had. Jeho jméno je kontrakce „B. irpravidelný dimeric toxin ".[1] jiný Boiga druhy a možná i jiné cobridní hadi, pravděpodobně vlastnit homologní bílkoviny.[5]:18

Reference

  1. ^ A b C d E Pawlak J, Mackessy SP, Sixberry NM, Stura EA, Le Du MH, Ménez R, Foo CS, Ménez A, Nirthanan S, Kini RM (únor 2009). „Irditoxin, nový kovalentně vázaný heterodimerní toxin pro tři prsty s vysokou taxotoxickou neurotoxicitou“. FASEB Journal. 23 (2): 534–45. doi:10.1096 / fj.08-113555. PMID  18952712.
  2. ^ A b C d E Kini RM, Doley R (listopad 2010). "Struktura, funkce a vývoj toxinů třemi prsty: mini proteiny s více cíli". Toxicon. 56 (6): 855–67. doi:10.1016 / j.toxicon.2010.07.010. PMID  20670641.
  3. ^ Doley R, Kini RM (září 2009). "Proteinové komplexy v hadím jedu". Buněčné a molekulární biologické vědy. 66 (17): 2851–71. doi:10.1007 / s00018-009-0050-2. PMID  19495561.
  4. ^ Osipov AV, Rucktooa P, Kasheverov IE, Filkin SY, Starkov VG, Andreeva TV, Sixma TK, Bertrand D, Utkin YN, Tsetlin VI (únor 2012). „Dimerní rentgenová struktura α-kobratoxinu: lokalizace intermolekulárních disulfidů a možný způsob vazby na nikotinové acetylcholinové receptory“. The Journal of Biological Chemistry. 287 (9): 6725–34. doi:10.1074 / jbc.M111.322313. PMC  3307301. PMID  22223648.
  5. ^ Mackessy SP (01.01.2010). Příručka o jedech a toxinech plazů. CRC Press. ISBN  9781420008661. OCLC  757355711.