Infekční virus hematopoetické nekrózy - Infectious hematopoietic necrosis virus

Lososovitý novirhabdovirus
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Negarnaviricota
Třída:Monjiviricetes
Objednat:Mononegavirales
Rodina:Rhabdoviridae
Rod:Novirhabdovirus
Druh:
Lososovitý novirhabdovirus
Synonyma
  • Infekční virus hematopoetické nekrózy

Infekční virus hematopoetické nekrózy (IHNV), je záporný smysl jednovláknový, ve tvaru kulky RNA virus který je členem Rhabdoviridae rodiny az rod Novirhabdovirus. Způsobuje onemocnění známé jako infekční hematopoetická nekróza v lososovitý Ryba jako pstruh a losos. Toto onemocnění může být označováno řadou dalších jmen, například Chinookova lososová choroba, Colemanova choroba, Columbia River sockeye nemoc, Cultus Lake virová choroba, Oregonská sockeye nemoc, Sacramento River Chinook nemoc a sockeye lososová virová choroba. IHNV se běžně vyskytuje v pobřeží Pacifiku Kanady a Spojených států a byl také nalezen v Evropa a Japonsko.[1][2][3] První hlášené epidemie IHNV se vyskytly ve Spojených státech v líhni ryb ve Washingtonu a Oregonu v padesátých letech minulého století.[4]IHNV je přenášeno Následující vylučování viru v výkaly, moč, sexuální tekutiny a vnější sliz a přímým kontaktem nebo těsným kontaktem s okolní vodou. Virus získává vstup do ryb na základně ploutve.[5]

Toto onemocnění je uvedeno jako netoxické onemocnění EU a je proto bedlivě sledován Referenční laboratoř Evropského společenství pro choroby ryb. Pro sledování distribuce různých genotypů IHNV byla volána databáze Fishpathogens.eu[6] byl vytvořen pro ukládání dat na různých Ryba patogeny (včetně IHNV) a jejich sekvence.

Klasifikace

IHNV je původcem infekční choroby krvetvorné nekrózy (IHN) ryb a jedná se o jednovláknový RNA virus negativního smyslu. IHNV je členem rod Novirhabdovirus,[7] patří do rodiny Rhabdoviridae. Severoamerické izoláty IHNV jsou seskupeny na základě parciálních genových sekvencí glykoproteinu (G).[8] Tři hlavní genoskupiny IHNV v Severní Americe jsou označeny jako U, M a L pro horní, střední a dolní část geografického rozsahu IHNV v Severní Americe. Japonské a korejské izoláty představují novou genoskupinu japonských pstruhů duhových.[2][9]

Virion

Viriony se skládají z obálky a nukleokapsidu. Viriony mají tvar kulky a měří průměr 45-100 nm a délku 100-430 nm.[10] Povrchové projekce jsou hustě rozptýlené, výrazné hroty, které pokrývají celý povrch kromě kvaziplanárního konce.

Organizace genomu

Rybí rhabdovirus IHNV má kulka ve tvaru virionu, který obsahuje nesegmentovaný, negativní řetězec, jednořetězcový RNA genom s přibližně 11 000 nukleotidy, které kódují šest proteinů v tomto pořadí: nukleoprotein (N), fosfoprotein (P), protein matrice (M), glykoprotein (G), nevirionový protein (NV) a polymeráza (L).[11]

K dnešnímu dni je úplná sekvence genomu k dispozici pouze pro tři izoláty IHNV.[12][13][14]

Dosud bylo identifikováno pět genotypů.[2][15] Jeden z nich se jeví jako jedinečný pro Japonsko.

Zdá se, že virus se vyvinul v Severní Americe. Zdá se, že evropské kmeny se vyvinuly z jediného genotypu (M), což naznačuje jedinou úvodní událost.[16]

Vývoj

Zdá se, že se tento virus vyvinul před padesátými léty, kdy byl poprvé hlášen.[15]

Cyklus replikace IHNV

K rhabdovirovému cyklu infekce dochází řadou událostí v tomto pořadí: adsorpce, penetrace a nepokrytí, transkripce, translace, replikace, shromáždění a pučící.

Přenos

Nádrže IHNV jsou klinicky infikované ryby a skryté nosiče mezi kultivovanými, divokými. nebo divoké ryby. Viry se vylučují močí, pohlavními tekutinami a z vnějšího hlenu, zatímco ledviny, slezina a další vnitřní orgány jsou místa, kde je virus v průběhu zjevné infekce nejhojnější.[17] Hmyz, kroužkovci a korýši mohou působit jako virové vektory. Potenciál epizootiky je nejvyšší při 10 ° C a choroba se nevyskytuje přirozeně nad 15 ° C.[18]

Klinické příznaky

Klinické příznaky infekce s IHNV zahrnují břišní distenze, vypoulené oči, ztmavnutí kůže, neobvyklé chování, anémie a vyblednutí žábry. Infikované ryby běžně krvácení v několika oblastech - ústa a za hlavou, prsní ploutve, svaly poblíž řiť a (na smažení) žloutkový váček. Nemocné ryby oslabují a nakonec se vznášejí „po břiše“ na hladině vody.

Nekróza je běžné v ledviny a slezina, a někdy v játra.[19] Úmrtnost je u mladých ryb velmi vysoká.

Některé ryby se stávají skrytými nosiči viru, pokud přežijí infekci.

Diagnóza

Klinické příznaky a historie předchozích ohnisek mohou naznačovat IHN. K potvrzení diagnózy lze použít techniky stafylokokové aglutinace, neutralizace viru (VN), nepřímé testování fluorescenčních protilátek, metody ELISA, PCR a DNA sondy. Zlatým standardem je neutralizace virů. Alternativně lze k diagnostice infekce použít identifikaci degenerace a nekrózy granulárních buněk v lamina propria, stratum compactum a stratum granulosum gastrointestinálního traktu na histopatologii.

Léčba a kontrola

Žádná léčba se zatím neukázala jako účinná. Aby se zabránilo onemocnění, měly by být zavedeny přísné postupy izolace, hygieny a testování.

Dějiny

Tento virus byl poprvé hlášen v Evropě v roce 1987 ve Francii a Itálii. Bylo hlášeno v roce 1992 v Německu.

V dubnu 2018 podle objevu vědců Juvenile Salmon a Steelhead v povodí řeky Columbia na severozápadě Pacifiku zabraňují uvolňování a šíření nemocí v oceánu.[20]

Reference

  1. ^ Rudáková, S.L .; Kurath, G .; Bochkova, E. V. (březen 2007). "Výskyt a genetické psaní infekčního viru hematopoetické nekrózy na Kamčatce v Rusku". Nemoci vodních organismů. 75 (1): 1–11. doi:10.3354 / dao075001. PMID  17523538.
  2. ^ A b C Nishizawa, T .; Kinoshita, S .; Kim, W. S .; Higashi, S .; Yoshimizu, M. (srpen 2006). „Nukleotidová rozmanitost japonských izolátů infekčního viru hematopoetické nekrózy (IHNV) na základě genu glykoproteinu“. Nemoci vodních organismů. 71 (3): 267–272. doi:10.3354 / dao071267. hdl:2115/43977. PMID  17058607.
  3. ^ Enzmann, P. J .; Kurath, G .; Fichtner, D .; Bergmann, S. M. (září 2005). „Infekční virus hematopoetické nekrózy: monofyletický původ evropských izolátů ze severoamerické genoskupiny M“. Nemoci vodních organismů. 66 (3): 187–195. doi:10.3354 / dao066187. PMID  16261933.
  4. ^ Rucker, R. R .; Whipple, W. J .; Parvin, J. R .; Evans, C. A. (1953). „Nakažlivá nemoc lososa pravděpodobně virového původu“. Bulletin o rybolovu. 76: 35–46.
  5. ^ Harmache, A .; LeBerre, M .; Droineau, S .; Giovannini, M .; Brémont, M. (duben 2006). „Bioluminiscenční zobrazování živě infikovaných lososovitých rostlin ukazuje, že základny ploutví jsou hlavním vstupním portálem pro Novirhabdovirus". Journal of Virology. 80 (7): 3655–3659. doi:10.1128 / JVI.80.7.3655-3659.2006. PMC  1440417. PMID  16537634.
  6. ^ „Databáze Fishpathogens.eu“. Epizone - referenční laboratoř Evropského společenství pro choroby ryb.
  7. ^ „Virový kód ICTVdB: 01.062.0.06.001“. Národní institut zdraví.
  8. ^ Kurath, G .; Garver, K. A .; Troyer, R. M .; Emmenegger, E. J .; Einer-Jensen, K .; Anderson, E. D. (duben 2003). „Fylogeografie infekčního viru hematopoetické nekrózy v Severní Americe“. The Journal of General Virology. 84 (4): 803–814. doi:10.1099 / vir.0.18771-0. PMID  12655081.
  9. ^ Kim, W. S .; Oh, M. J .; Nishizawa, T .; Park, J. W .; Kurath, G .; Yoshimizu, M. (2007). „Genotypizace korejských izolátů infekčního viru hematopoetické nekrózy (IHNV) na základě glykoproteinového genu“. Archivy virologie. 152 (11): 2119–2124. doi:10.1007 / s00705-007-1027-9. hdl:2115/32293. PMID  17668275.
  10. ^ Hill, B. J .; Underwood, B. O .; Smale, C. J .; Brown, F. (červen 1975). „Fyzikálně-chemická a sérologická charakterizace pěti rhabdovirů infikujících ryby“. The Journal of General Virology. 27 (3): 369–378. doi:10.1099/0022-1317-27-3-369. PMID  1170278.
  11. ^ Kurath, G .; Leong, J. C. (únor 1985). „Charakterizace druhů mRNA infekčního hematopoetického nekrotického viru odhaluje nevirionový protein rhabdoviru“. Journal of Virology. 53 (2): 462–468. PMC  254658. PMID  4038520.
  12. ^ Schütze, H .; Enzmann, P. J .; Kuchling, R .; Mundt, E .; Niemann, H .; Mettenleiter, T. C. (říjen 1995). „Kompletní genomová sekvence infekčního viru hematopoetické nekrózy ryb rhabdoviru“. The Journal of General Virology. 76 (10): 2519–2527. doi:10.1099/0022-1317-76-10-2519. PMID  7595355.
  13. ^ Morzunov, S. P .; Winton, J. R .; Nichol, S. T. (říjen 1995). „Kompletní struktura genomu a fylogenetický vztah infekčního viru hematopoetické nekrózy“. Virový výzkum. 38 (2–3): 175–192. doi:10.1016 / 0168-1702 (95) 00056-V. PMID  8578857.
  14. ^ Ammayappan, A .; LaPatra, S.E .; Vakharia, V. N. (2010). „Molekulární charakterizace virulentního infekčního kmene hematopoetické nekrózy (IHNV) 220-90“. Virology Journal. 7: 10. doi:10.1186 / 1743-422X-7-10. PMC  2820013. PMID  20085652.
  15. ^ A b On, Mei; Ding, Nai-Zheng; On, Cheng-Qiang; Yan, Xue-Chun; Teng, Chun-Bo (2013). „Datování divergence viru infekční nekrózy krvetvorné tkáně“. Infekce, genetika a evoluce. 18: 145–50. doi:10.1016 / j.meegid.2013.05.014. PMID  23722020.
  16. ^ Enzmann, PJ; Kurath, G; Fichtner, D; Bergmann, SM (2005). „Infekční virus hematopoetické nekrózy: monofyletický původ evropských izolátů ze severoamerické Genogroup M“. Nemoci vodních organismů. 66 (3): 187–95. doi:10.3354 / dao066187. PMID  16261933.
  17. ^ Amend, D. F. (říjen 1975). „Detekce a přenos infekčního viru hematopoetické nekrózy u pstruha duhového“. Journal of Wildlife Diseases. 11 (4): 471–478. doi:10.7589/0090-3558-11.4.471. PMID  1195486.
  18. ^ Amend, D. F. (1975). "Kontrola infekční choroby krvetvorné nekrózy zvýšením teploty vody". Journal of the Fisheries Research Board of Canada. 27 (2): 265–270. doi:10.1139 / f70-034.
  19. ^ „Infekční hematopoetická nekróza“ (PDF). Informační přehledy. Centrum pro bezpečnost potravin a veřejné zdraví, Iowa State University.
  20. ^ "Studujte stopy viru IHNV u lososa | mluvčí-recenze".

externí odkazy