Hyperbolastické funkce - Hyperbolastic functions - Wikipedia







The hyperbolastické funkce, také známý jako hyperbolastické růstové modely, jsou matematické funkce které se používají v lékařství statistické modelování. Tyto modely byly původně vyvinuty k zachycení dynamiky růstu mnohobuněčných nádorových sfér a byly představeny v roce 2005 Mohammadem Tabatabai, Davidem Williamsem a Zoranem Bursacem.[1] Přesnost hyperbolastických funkcí při modelování problémů v reálném světě je poněkud způsobena jejich flexibilitou v jejich inflexním bodě.[1] Tyto funkce lze použít v nejrůznějších modelových problémech, jako je růst nádoru, kmenová buňka proliferace, farmaceutická kinetika, růst rakoviny, funkce aktivace sigmoidů v EU neuronové sítě a progrese nebo regrese epidemiologické choroby.[1][2][3]
The hyperbolastické funkce může modelovat křivky růstu i rozpadu, dokud nedosáhne nosnost. Díky své flexibilitě mají tyto modely různá použití v lékařské oblasti se schopností zachytit progresi nemoci intervenční léčbou. Jak ukazují čísla, hyperbolastické funkce se vejde a sigmoidální křivka což naznačuje, že nejpomalejší rychlost se vyskytuje v počáteční a pozdní fázi. Kromě současných sigmoidálních tvarů může pojmout také dvoufázové situace, kdy lékařské zákroky zpomalují nebo zvracejí progresi onemocnění; ale jakmile účinek léčby zmizí, onemocnění zahájí druhou fázi svého postupu, dokud nedosáhne své horizontální asymptoty.
Jednou z hlavních charakteristik těchto funkcí je, že nemohou odpovídat pouze sigmoidálním tvarům, ale mohou také modelovat dvoufázové růstové vzorce, které jiné klasické sigmoidální křivky nemohou adekvátně modelovat. Tento rozlišovací znak má výhodné aplikace v různých oblastech včetně medicíny, biologie, ekonomiky, strojírenství, agronomie a teorie systémů podporovaných počítačem.[4][5][6][7][8]
Funkce H1
The hyperbolastická rychlostní rovnice typu I, označený H1, je dán vztahem:
kde je jakékoli skutečné číslo a je velikost populace v . Parametr představuje nosnost a parametry a společně představují míru růstu. Parametr udává vzdálenost od symetrické sigmoidální křivky. Řešení hyperbolastické rychlostní rovnice typu I pro dává:
kde je inverzní hyperbolický sinus funkce. Pokud si přejete použít počáteční podmínku , pak lze vyjádřit jako:
- .
Li , pak snižuje na:
- .
The hyperbolastická funkce typu I. zobecňuje logistická funkce. Pokud parametry , pak by se z toho stala logistická funkce. Tato funkce je hyperbolastická funkce typu I.. The standardní hyperbolastická funkce typu I. je
- .
Funkce H2
The hyperbolastická rychlostní rovnice typu II, označený H2, je definován jako:
kde je hyperbolická tečna funkce, je nosnost a obojí a společně určit míru růstu. Kromě toho parametr představuje zrychlení v časovém průběhu. Řešení funkce hyperbolastické rychlosti typu II pro dává:
- .
Pokud si přejete použít počáteční podmínku pak lze vyjádřit jako:
- .
Li , pak snižuje na:
- .
The standardní hyperbolastická funkce typu II je definován jako:
- .
Funkce H3
Rovnice hyperbolastické rychlosti typu III je označena H3 a má tvar:
- ,
kde > 0. Parametr představuje nosnost a parametry a společně určit míru růstu. Parametr představuje zrychlení časové stupnice, zatímco velikost představuje vzdálenost od symetrické sigmoidální křivky. Řešení diferenciální rovnice typu III je:
- ,
s původním stavem můžeme vyjádřit tak jako:
- .
Hyperbolastická distribuce typu III je tříparametrová rodina spojitých rozdělení pravděpodobnosti s parametry měřítka > 0 a ≥ 0 a parametr jako parametr tvaru. Když parametr = 0, hyperbolastická distribuce typu III je snížena na Weibullova distribuce.[9] Hyperbolastický kumulativní distribuční funkce typu III je dán vztahem:
- ,
a jeho odpovídající funkce hustoty pravděpodobnosti je:
- .
The nebezpečná funkce (nebo míra selhání) je dána vztahem:
The funkce přežití darováno:
Standardní hyperbolastická kumulativní distribuční funkce typu III je definována jako:
- ,
a odpovídající funkce hustoty pravděpodobnosti je:
- .
Vlastnosti
Pokud si někdo přeje vypočítat bod kde populace dosahuje procenta své únosnosti , pak lze vyřešit rovnici:
pro , kde . Například poloviční bod lze najít nastavením .
Aplikace

Podle výzkumníků kmenových buněk v McGowan Institute for Regenerative Medicine na University of Pittsburgh „je novější model [nazývaný hyperbolastický typ III nebo] H3 diferenciální rovnice který také popisuje buněčný růst. Tento model umožňuje mnohem více variací a bylo prokázáno, že lépe předpovídá růst. “[10]
Pro analýzu růstu pevných látek byly použity hyperbolastické růstové modely H1, H2 a H3 Ehrlichův karcinom pomocí různých způsobů léčby.[11]
Ve vědě o zvířatech[12] hyperbolastické funkce byly použity pro modelování růstu kuřat brojlerů.[13] K určení velikosti zotavující se rány byl použit hyperbolastický model typu III.[14]
V oblasti hojení ran hyperbolastické modely přesně představují časový průběh hojení. Tyto funkce byly použity ke zkoumání variací rychlosti hojení mezi různými druhy ran a v různých fázích procesu hojení s přihlédnutím k oblastem stopových prvků, růstových faktorů, diabetických ran a výživy.[15][16]
Další aplikace hyperbolastických funkcí je v oblasti stochastická difúze proces, jehož střední funkcí je hyperbolastická křivka typu I. Jsou studovány hlavní charakteristiky procesu a odhad maximální věrohodnosti pro parametry procesu se uvažuje.[17]Za tímto účelem je použit metaheuristický optimalizační algoritmus světlušky po ohraničení parametrického prostoru fázovým postupem. Tento vývoj ilustrují některé příklady založené na simulovaných vzorových cestách a skutečných datech. Ukázková cesta a difúzní proces modeluje trajektorii částice vložené do tekoucí tekutiny a vystavené náhodným posunům v důsledku kolizí s jinými částicemi, která se nazývá Brownův pohyb.[18][19][20][21] K modelování proliferace u dospělých byla použita hyperbolastická funkce typu III mezenchymální a embryonální kmenové buňky;[22][23][24][25] a při modelování byl použit hyperbolastický smíšený model typu II rakovina děložního hrdla data.[26] Hyperbolastické křivky mohou být důležitým nástrojem při analýze buněčného růstu, přizpůsobení biologických křivek a růstu fytoplankton.[27][28]
v ekologie lesa a management, hyperbolastické modely byly použity k modelování vztahu mezi DBH a výškou.[29]
Multivariační hyperbolastický model typu III byl použit k analýze dynamiky růstu fytoplanktonu s přihlédnutím ke koncentraci živin.[30]
Hyperbolastické regrese


Hyperbolastické regrese jsou statistické modely které využívají standard hyperbolatické funkce modelovat a dichotomický výsledná proměnná. Účelem binární regrese je předpovědět binární výslednou (závislou) proměnnou pomocí sady vysvětlujících (nezávislých) proměnných. Binární regrese se běžně používá v mnoha oblastech, včetně lékařských, veřejného zdraví, zubních a biomedicínských věd. K předpovědi byla použita binární regresní analýza endoskopický léze při nedostatku železa anémie.[31] Navíc byla použita binární regrese k rozlišení mezi maligním a benigním adnexální hmota před operací.[32]
Hyperbolastická regrese typu I.
Nechat být proměnnou binárního výsledku, která může nabývat jedné ze dvou vzájemně se vylučujících hodnot, úspěchu nebo neúspěchu Pokud kódujeme úspěch jako a selhání jako , pravděpodobnost hyperbolastického úspěchu typu I jako funkce vysvětlující proměnné darováno:
- ,
kde jsou parametry modelu. Šance na úspěch je poměr pravděpodobnosti úspěchu k pravděpodobnosti neúspěchu. U hyperbolastické regrese typu I je pravděpodobnost úspěchu označena a vyjádřeno rovnicí:
- .
Logaritmus se nazývá logit hyperbolastu typu I. Logická transformace je označena a lze jej zapsat jako:
- .
Hyperbolastická regrese typu II
Pro proměnnou binárního výsledku , pravděpodobnost hyperbolastického úspěchu typu II jako funkce vysvětlující proměnné je:
- ,
U hyperbolastické regrese typu II je pravděpodobnost úspěchu označena a je dána:
Logitová transformace je označena a je dána:
Reference
- ^ A b C Tabatabai, Mohammad; Williams, David; Bursac, Zoran (2005). „Hyperbolastické růstové modely: teorie a aplikace“. Teoretická biologie a lékařské modelování. 2: 14. doi:10.1186/1742-4682-2-14. PMC 1084364. PMID 15799781.
- ^ Q. Ashton Acton P. Buňky - pokroky ve výzkumu a aplikaci. [Internet]. Atlanta: ScholarlyMedia LLC; 2012 [citováno 2020 27. dubna]. Dostupný z: https://public.ebookcentral.proquest.com/choice/publicfullrecord.aspx?p=4973379
- ^ Wadkin, L. E.; Orozco-Fuentes, S .; Neganova, I .; Lako, M .; Parker, N.G .; Shukurov, A. (2020). "Úvod do matematického modelování iPSC". Nedávné pokroky v technologii iPSC. 5.
- ^ Neysens, Patricia; Messens, Winy; Gevers, Dirk; Houpačky, Jean; De Vuyst, Luc (2003). „Dvoufázová kinetika růstu a produkce bakteriocinu u Lactobacillus amylovorus DCE 471 se vyskytuje za stresových podmínek“. Mikrobiologie. 149 (4): 1073–1082. doi:10,1099 / mic. 0,25880-0. PMID 12686649.
- ^ Chu, Charlene; Han, Christina; Shimizu, Hiromi; Wong, Bonnie (2002). „Vliv fruktózy, galaktózy a glukózy na indukci β-galaktosidázy v Escherichia coli" (PDF). Journal of Experimental Microbiology and Immunology. 2: 1–5.
- ^ Tabatabai, M. A .; Eby, W. M .; Singh, K. P .; Bae, S. (2013). „T model růstu a jeho aplikace v systémech imunomodynamiky nádorů“. Matematické biologické vědy a inženýrství. 10 (3): 925–938. doi:10,3934 / mbe.2013.10.925. PMC 4476034. PMID 23906156.
- ^ Parmoon, Ghasem; Moosavi, Seyed; Poshtdar, Adel; Siadat, Seyed (2020). "Účinky toxicity kadmia na klíčení sezamových semen vysvětleny různými nelineárními modely růstu". Olejnatá semena a tuky Plodiny a lipidy. 27 (57). doi:10.1051 / ocl / 2020053.
- ^ Teorie systémů podporovaných počítačem - EUROCAST 2019. Přednášky z informatiky. 12013. 2020. doi:10.1007/978-3-030-45093-9. ISBN 978-3-030-45092-2.
- ^ Kamar SH, Msallam BS. Srovnávací studie mezi zobecněnou maximální entropií a Bayesovými metodami pro odhad Weibullova růstového modelu se čtyřmi parametry. Journal of Probability and Statistics. 2020 14. ledna; 2020: 1–7.
- ^ Roehrs T, Bogdan P, Gharaibeh B a kol. (n.d.). „Proliferativní heterogenita v populacích kmenových buněk“. Laboratoř zobrazování živých buněk, McGowan Institute for Regenerative Medicine. Citovat deník vyžaduje
| deník =
(Pomoc) - ^ Eby, Wayne M .; Tabatabai, Mohammad A .; Bursac, Zoran (2010). „Hyperbolastické modelování růstu nádoru kombinovanou léčbou jodoacetátem a dimethylsulfoxidem“. Rakovina BMC. 10: 509. doi:10.1186/1471-2407-10-509. PMC 2955040. PMID 20863400.
- ^ Francie, James; Kebreab, Ermias, eds. (2008). Matematické modelování ve výživě zvířat. Wallingford: CABI. ISBN 9781845933548.
- ^ Ahmadi, H .; Mottaghitalab, M. (2007). „Hyperbolastické modely jako nový výkonný nástroj k popisu kinetiky růstu brojlerů“. Drůbeží věda. 86 (11): 2461–2465. doi:10.3382 / ps.2007-00086. PMID 17954598.
- ^ Choi, Taeyoung; Chin, Seongah (2014). „Nová syntéza obnovy rány v reálném čase pomocí rozptylu pod povrchem“. Vědecký světový deník. 2014: 1–8. doi:10.1155/2014/965036. PMC 4146479. PMID 25197721.
- ^ Tabatabai, M. A.; Eby, W.M .; Singh, K.P. (2011). "Hyperbolastické modelování hojení ran". Matematické a počítačové modelování. 53 (5–6): 755–768. doi:10.1016 / j.mcm.2010.10.013.
- ^ Ko, Ung Hyun; Choi, Jongjin; Choung, Jinseung; Měsíc, Sunghwan; Shin, Jennifer H. (2019). „Fyzikálně chemicky vyladěné myofibroblasty pro strategii hojení ran“. Vědecké zprávy. 9 (1): 16070. Bibcode:2019NatSR ... 916070K. doi:10.1038 / s41598-019-52523-9. PMC 6831678. PMID 31690789.
- ^ Barrera, Antonio; Román-Román, Patricia; Torres-Ruiz, Francisco (2020). "Difúzní procesy pro modely založené na Weibullovi". Teorie systémů podporovaných počítačem - EUROCAST 2019. Přednášky z informatiky. 12013. 204–210. doi:10.1007/978-3-030-45093-9_25. ISBN 978-3-030-45092-2.
- ^ Barrera, Antonio; Román-Román, Patricia; Torres-Ruiz, Francisco (2018). "Hyperbolastický difúzní proces typu I: Odhad parametrů pomocí algoritmu světlušky". Biosystémy. 163: 11–22. doi:10.1016 / j.biosystems.2017.11.001. PMID 29129822.
- ^ Barrera, Antonio; Román-Roán, Patricia; Torres-Ruiz, Francisco (2020). „Hyperbolastický difúzní proces typu III: Získání zobecněného Weibullova difúzního procesu“. Matematické biologické vědy a inženýrství. 17 (1): 814–833. doi:10,3934 / mbe.2020043. PMID 31731379.
- ^ Barrera, Antonio; Román-Román, Patricia; Torres-Ruiz, Francisco (2020). „Dvě stochastické diferenciální rovnice pro modelování chování typu oscilátoru“. Matematika. 8 (2): 155. doi:10,3390 / math8020155.
- ^ Stochastické procesy s aplikacemi. 2019. doi:10,3390 / books978-3-03921-729-8. ISBN 978-3-03921-729-8.
- ^ Tabatabai, Mohammad A .; Bursac, Zoran; Eby, Wayne M .; Singh, Karan P. (2011). "Matematické modelování množení kmenových buněk". Lékařské a biologické inženýrství a výpočetní technika. 49 (3): 253–262. doi:10.1007 / s11517-010-0686-r. PMID 20953843.
- ^ Eby, Wayne M .; Tabatabai, Mohammad A. (2014). "Metody v matematickém modelování pro kmenové buňky". Terapeutické aplikace při nemocech a úrazech. Kmenové buňky a rakovina Kmenové buňky. 12. 201–217. doi:10.1007/978-94-017-8032-2_18. ISBN 978-94-017-8031-5.
- ^ Wadkin, L. E.; Orozco-Fuentes, S .; Neganova, I .; Lako, M .; Shukurov, A .; Parker, N. G. (2020). „Nedávné pokroky v matematickém modelování lidských pluripotentních kmenových buněk“. SN Aplikované vědy. 2 (2). doi:10.1007 / s42452-020-2070-3.
- ^ Kmenové buňky a rakovina Kmenové buňky, svazek 12. Kmenové buňky a rakovina Kmenové buňky. 12. 2014. doi:10.1007/978-94-017-8032-2. ISBN 978-94-017-8031-5.
- ^ Tabatabai, Mohammad A .; Kengwoung-Keumo, Jean-Jacques; Eby, Wayne M .; Bae, Sejong; Guemmegne, Juliette T .; Manne, Upender; Fouad, Mona; Partridge, Edward E .; Singh, Karan P. (2014). „Rozdíly v míře úmrtnosti na rakovinu děložního čípku, jak je určeno modelem podélných hyperbolastických smíšených účinků typu II“. PLOS ONE. 9 (9): e107242. Bibcode:2014PLoSO ... 9j7242T. doi:10.1371 / journal.pone.0107242. PMC 4167327. PMID 25226583.
- ^ Veríssimo, André; Paixão, Laura; Neves, Ana; Vinga, Susana (2013). „BGFit: Správa a automatizované přizpůsobování biologických růstových křivek“. BMC bioinformatika. 14: 283. doi:10.1186/1471-2105-14-283. PMC 3848918. PMID 24067087.
- ^ Tabatabai, M. A .; Eby, W. M .; Bae, S .; Singh, K. P. (2013). „Flexibilní model s více proměnnými pro růst fytoplanktonu“. Matematické biologické vědy a inženýrství. 10 (3): 913–923. doi:10,3934 / mbe.2013.10.913. PMID 23906155.
- ^ Eby, Wayne M .; Oyamakin, Samuel O .; Chukwu, Angela U. (2017). "Nový nelineární model aplikovaný na vztah výška-DBH v Gmelina arborea". Ekologie a management lesů. 397: 139–149. doi:10.1016 / j.foreco.2017.04.015.
- ^ Tabatabai, M. A .; Eby, W. M .; Bae, S .; Singh, K. P. (2013). „Flexibilní model s více proměnnými pro růst fytoplanktonu“. Matematické biologické vědy a inženýrství. 10 (3): 913–923. doi:10,3934 / mbe.2013.10.913. PMID 23906155.
- ^ Majid, Shahid; Salih, Mohammad; Wasaya, Rozina; Jafri, Wasim (2008). "Prediktory gastrointestinálních lézí na endoskopii při anémii s nedostatkem železa bez gastrointestinálních příznaků". BMC gastroenterologie. 8: 52. doi:10.1186 / 1471-230X-8-52. PMC 2613391. PMID 18992171.
- ^ Timmerman, Dirk; Testa, Antonia C .; Bourne, Tom; Ferrazzi, Enrico; Ameye, Lieveke; Konstantinovic, Maja L .; Van Calster, Ben; Collins, William P .; Vergote, Ignace; Van Huffel, Sabine; Valentin, Lil (2005). „Logistický regresní model k rozlišení mezi benigní a maligní adnexální masou před operací: Multicentrická studie od Mezinárodní skupiny pro analýzu nádorů na vaječnících“. Journal of Clinical Oncology. 23 (34): 8794–8801. doi:10.1200 / JCO.2005.01.7632. PMID 16314639.