ETOX - eTOX - Wikipedia

Tento článek je o toxikologickém konsorciu. Výrobce automobilů viz Etox.

eTOX
Část Iniciativa pro inovativní léčiva
IMI eTOX toxikologické konsorcium logo.png
Klíčová slovaObjevování drog, vývoj léků
Typ projektuSpolečná technologická iniciativa
Finanční agenturaSedmý rámcový program
Evropská federace farmaceutického průmyslu a asociací (EFPIA)
ObjektivníVyvíjejte in silico strategie a softwarové nástroje pro predikci toxikologických profilů malých molekul
Koordinátor projektuNovartis, Bayer
ÚčastníciEFPIA: AstraZeneca, Boehringer Ingelheim, Esteve, GlaxoSmithKline, Janssen Pharmaceutica, Lundbeck, Pfizer, Hoffmann-La Roche, UCB, Sanofi, Sluha

Akademie: Erasmus Universitair Medisch Centrum, Fraunhofer Gesellschaft, Fundació Institut Mar d'Investigacions Médiques, Fundación Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas Carlos III, Evropská laboratoř molekulární biologie, Liverpool John Moores University, Technická univerzita v Dánsku Universitat Politècnica de Valencia, University of Leicester, Universität Wien, VU University Amsterdam

SME: Lhasa Limited, Inte: Ligand, Molecular Networks, Chemotargets, Lead Molecular Design, Synapse Research Management Partners
Rozpočet
  • Celkem: 6,9 milionu EUR
  • Financování: 18,7 milionu EUR
Doba trvání2010 – 2016
webová stránkawww.e-tox.síť

eTOX je dočasný konsorcium založena v roce 2010 ke sdílení a používání toxikologie data. Jedná se o předsoutěžní spolupráci, jejímž hlavním cílem je vytvořit a distribuovat nástroje pro předvídání vedlejších účinků léků na základě předklinických experimentů. Cíle jsou lepší in silico předvídatelnost potenciálních nežádoucích účinků a snížení používání zvířat v toxikologickém výzkumu. eTOX je financován z Iniciativa pro inovativní léčiva (IMI).[1]

Cíle

Oficiální název konsorcia je „Integrace bioinformatických a chemoinformatických přístupů pro vývoj expertních systémů umožňujících in silico predikci toxicit (eTOX)“. Cílem eTOX je vytvořit in silico nástroje pro předpovídání toxicity malých molekul během raných fází vývoje léků.[2] Konsorcium sestavuje prediktivní model založený na souboru toxikologických zpráv sestavených farmaceutickými společnostmi, které se do konsorcia připojily. V duchu IMI sdružuje eTOX soukromé společnosti produkující preklinická data a odborníky na akademické partnery cheminformatika, bioinformatika a zpracování přirozeného jazyka. Příspěvek k veřejné doméně algoritmů,[3][4][5] software a ontologie[6] je součástí plánu.

Organizace

K dosažení tohoto cíle bylo vytvořeno konsorcium sdružující 25 farmaceutických společností, biotechnologických společností a univerzity. Projekt byl zahájen v roce 2010, původně byl financován po dobu 5 let partnery konsorcia a Evropská unie. Konsorcium využilo výhody rozšíření ENSO a bude pokračovat až do konce roku 2016. Celkový odhadovaný rozpočet je 18,7 milionu EUR.

Partneři

eTOX spolupracuje s OpenPHACTS, další konsorcium IMI k opětovnému použití veřejně dostupných klinických údajů. V roce 2014 bylo zahájeno konsorcium IMI iPiE (Intelligence-Led Assessment of Pharmaceuticals in the Environment), cíle jsou podobné jako eTOX, ale surová data pocházejí z chemických látek shromážděných v souladu s DOSÁHNOUT[7] Evropské nařízení. Bylo dohodnuto, že bude probíhat úzká spolupráce při vývoji databází, prediktivních systémů a otázkách duševního vlastnictví.

Výsledek a šíření

Projekt eTox aktuálně běží a jeho dokončení je plánováno na prosinec 2016. Interní práce se zvenčí pomalu zviditelňují: od srpna 2014 bylo ručně kurátorováno a uloženo do databáze 3046 zpráv ze 4291 studií na zvířatech.[8] Další dva tisíce jsou zpracovávány a bylo postaveno a ověřeno sedmdesát čtyři modelů, většinou na základě veřejných údajů.[8] Konsorcium začalo šířit informace a byl vydán revizní článek o projektu.[2]

Seznam vědeckých publikací (včetně článků a přednášek) je k dispozici na internetu eTOX veřejné webové stránky.

An externí zpravodaj[trvalý mrtvý odkaz ] je vydáván každé 3 měsíce s hlavními pokroky v projektu, od listopadu 2011.

Budoucnost

Spojené státy Úřad pro kontrolu potravin a léčiv se chystá požádat o elektronické předložení prvotních údajů ze studií na zvířatech pomocí Standard pro výměnu neklinických údajů napříště vyšetřovací nová droga a žádosti o biologickou licenci. To je obecně považováno za potenciální měnič hry pro toxikologickou disciplínu, kde výměna dat a těžba dat u velkých souborů dat není normou. Mohlo by to umožnit automatický import do databáze, jako je eTOX.

Viz také

Reference

  1. ^ „eTOX - IMI - Iniciativa pro inovativní léčiva“. europa.eu. Citováno 27. března 2015.
  2. ^ A b Briggs, K; Případy, M; Heard, D. J .; Pastor, M; Pognan, F; Sanz, F; Schwab, C. H .; Steger-Hartmann, T; Sutter, A; Watson, D. K .; Wichard, J. D. (2012). „Inroads to Predict in Vivo Toxicology - An Introduction to the eTOX Project“. International Journal of Molecular Sciences. 13 (3): 3820–46. doi:10,3390 / ijms13033820. PMC  3317745. PMID  22489185.
  3. ^ Carrió, P; Pinto, M; Ecker, G; Sanz, F; Pastor, M (2014). „Applicability Domain ANalysis (ADAN): a robust method for Assessing the reliability of drug property predictions“. Journal of Chemical Information and Modeling. 54 (5): 1500–11. doi:10.1021 / ci500172z. PMID  24821140.
  4. ^ Gautier, L; Taboureau, O; Audouze, K (2013). "Vliv síťové biologie na toxikologii léčiv". Názor odborníka na metabolismus a toxikologii drog. 9 (11): 1409–18. doi:10.1517/17425255.2013.820704. PMID  23937336.
  5. ^ Vazquez, Miguel; Krallinger, Martin; Leitner, Florian; Valencia, Alfonso (2011). "Těžba textu pro léky a chemické sloučeniny: metody, nástroje a aplikace". Molekulární informatika. 30 (6–7): 506–519. doi:10,1002 / min. 201100005.
  6. ^ Hardy, B; Apic, G; Carthew, P; Clark, D; Cook, D; Dix, já; Escher, S; Hastings, J; Heard, D. J .; Jeliazkova, N; Judson, P; Matis-Mitchell, S; Mitic, D; Myatt, G; Shah, já; Spjuth, O; Tcheremenskaia, O; Toldo, L; Watson, D; Bílá, A; Yang, C (2012). „Perspektivy toxikologické ontologie“. ALTEX. 29 (2): 139–56. doi:10.14573 / altex.2012.2.139. PMID  22562487.
  7. ^ Nicolotti, O; Benfenati, E; Carotti, A; Gadaleta, D; Gissi, A; Mangiatordi, G. F .; Novellino, E (2014). „REACH a metody in silico: atraktivní příležitost pro léčivé chemiky“. Objev drog dnes. 19: 1757–68. doi:10.1016 / j.drudis.2014.06.027. PMID  24998783.
  8. ^ A b Případy, M; Briggs, K; Steger-Hartmann, T; Pognan, F; Marc, P; Kleinöder, T; Schwab, C. H .; Pastor, M; Wichard, J; Sanz, F (2014). „Projekt sdílení dat eTOX s cílem pokročit v predikci toxicity vyvolané léky Silico“. International Journal of Molecular Sciences. 15 (11): 21136–54. doi:10,3390 / ijms151121136. PMC  4264217. PMID  25405742.

externí odkazy