OpenPHACTS - OpenPHACTS

Otevřete FAKTY
Formace2011
TypPartnerství veřejného a soukromého sektoru
ÚčelSémantická interoperabilita pro objev drog přes Otevřená inovace
Členství
27 členských organizací
Klíčoví lidé
webová stránka

Otevřete FAKTY (Otevřená farmakologická koncepce Triple Store ) je evropská iniciativa partnerství veřejného a soukromého sektoru mezi akademickou obcí, vydavateli, podniky, farmaceutické společnosti a další organizace usilující o lepší, levnější a rychlejší objev drog.[1][2][3][4] Bylo financováno z Iniciativa pro inovativní léčiva,[5] vybráno jako součást tří projektů na „návrh metod pro společné standardy a sdílení údajů pro účinnější vývoj léků a léčbu pacientů v budoucnosti“.[6][7]

Partnerství

V současné době je zapojeno celkem 27 partnerů, včetně:

Objev drog

Otevřený farmakologický prostor vytvořený konsorciem má podporovat otevřená inovace a interní neveřejný výzkum objevů drog[8] odstraněním úzkých míst vývoj léků.[9][10] Zdroje z projektu jsou veřejně dostupné na GitHub.[11]

K omezení překážek objevování drog v průmyslu, akademické sféře a pro malé podniky vytvořilo konsorcium Open PHACTS platformu Open PHACTS Discovery Platform. Tato platforma je volně dostupná, integruje farmakologické údaje z různých informačních zdrojů a poskytuje nástroje a služby pro zpochybňování těchto integrovaných údajů na podporu farmakologického výzkumu.

Reference

  1. ^ Williams, A. J.; Harland, L .; Groth, P .; Pettifer, S.; Chichester, C .; Willighagen, E. L .; Evelo, C. T .; Blomberg, N .; Ecker, G.; Goble, C.; Mons, B. (2012). „Otevřené FAKTY: Sémantická interoperabilita pro objevování drog“. Objev drog dnes. 17 (21–22): 1188–1198. doi:10.1016 / j.drudis.2012.05.016. PMID  22683805.
  2. ^ Ecker, G. F .; Williams-Jones, B. (2012). „Otevřená inovace v objevování drog“. Molekulární informatika. 31 (8): 519. doi:10,1002 / min. 201280004.
  3. ^ Gray, Alasdair J.G .; Groth, Paul; Loizou, Antonis; Askjaer, Sune; Brenninkmeijer, Christian; Burger, Kees; Chichester, Christine; Evelo, Chris T .; Goble, Carole; Harland, Lee; Pettifer, Steve; Thompson, Mark; Waagmeester, Andra; Williams, Antony John (2014). "Uplatnění propojených datových přístupů ve farmakologii: architektonická rozhodnutí a implementace". Sémantický web. 5 (2): 101–113. arXiv:1005.2643. doi:10.3233 / SW-2012-0088.
  4. ^ Ciccarese, P; Soiland-Reyes, S; Belhajjame, K; Gray, A. J .; Goble, C; Clark, T (2013). „PAV ontologie: Provenience, tvorba a správa verzí“. Časopis biomedicínské sémantiky. 4 (1): 37. arXiv:1304.7224. doi:10.1186/2041-1480-4-37. PMC  4177195. PMID  24267948.
  5. ^ „Open PHACTS at IMI - The Innovative Medicines Initiative“.
  6. ^ Watson, R. (2011). „Evropa poskytuje 172 mil. EUR na výzkum inovativních léčiv“. BMJ. 342: d1577. doi:10.1136 / bmj.d1577. PMID  21393337.
  7. ^ Goble, C.; Gray, A. J. G .; Harland, L .; Karapetyan, K .; Loizou, A .; Mikhailov, I .; Rankka, Y. N .; Senger, S .; Tkachenko, V .; Williams, A. J.; Willighagen, E. L. (2013). „Začlenění komerčních a soukromých dat do otevřené propojené datové platformy pro objevování drog“. Sémantický web - ISWC 2013. Přednášky z informatiky. 8219. p. 65. doi:10.1007/978-3-642-41338-4_5. ISBN  978-3-642-41337-7.
  8. ^ Müller, S .; Weigelt, J. (2010). „Otevřená partnerství veřejného a soukromého sektoru umožňující objevování drog - nové přístupy“. IDrugs: vyšetřovací časopis o drogách. 13 (3): 175–180. PMID  20191434.
  9. ^ Dalgleish, R .; Molero, E .; Kidd, R .; Jansen, M .; Minulost, D .; Robl, A .; Mons, B .; Diaz, C .; Mons, A .; Brookes, A. J. (2012). "Řešení úzkých míst ve sdílení dat ve vědách o živé přírodě". Lidská mutace. 33 (10): 1494–1496. doi:10,1002 / humu.22123. PMID  22623360.
  10. ^ Mons, B.; Van Haagen, H .; Chichester, C .; Hoen, P. B. 'T .; Den Dunnen, J. T .; Van Ommen, G .; Van Mulligen, E .; Singh, B .; Hooft, R .; Roos, M .; Hammond, J .; Kiesel, B .; Giardine, B .; Velterop, J.; Groth, P .; Schultes, E. (2011). Msgstr "Hodnota dat". Genetika přírody. 43 (4): 281–283. doi:10.1038 / ng0411-281. PMID  21445068.
  11. ^ „Open PHACTS on GitHub“. Citováno 2012-07-10.