Dokdonia donghaensis - Dokdonia donghaensis

Dokdonia donghaensis je přísně aerobní, gramnegativní, fototrofní bakterie, které se daří v mořském prostředí. Organismus může růst na médiu s mořskou vodou při širokém rozmezí teplot. Má schopnost formovat se biofilmy, což zvyšuje odolnost organismu vůči antimikrobiálním látkám, jako je tetracyklin.

Objev a izolace

Dokdonia donghaensis byl objeven a izolován od Japonské moře v Koreji z ostrova zvaného Dokdo,^[3] korejský název pro Liancourtské skály o které suverenitě je spor mezi Japonskem a Koreou; datum izolace není specifikováno. Fylogenetická analýza 16S ribozomální RNA Genová sekvence organismu odhalila dva blízce příbuzné kmeny, DSW-1T a DSW-21. Tyto kmeny jsou klasifikovány v Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroides (CFB), což jsou dominantní rody v mořském prostředí.^[4][5] Winogradsky poprvé popsáno Cytophaga-jako bakterie jako jednobuněčné, klouzavé, netvorící spory a Gramnegativní tyče, i když se tvar liší. Mnoho Cytophaga-jako bakteriální kolonie mají pigment kvůli pigmentům typu flexirubinu, které se nacházejí pouze v těchto bakteriích a flavobakteriích. Cytophaga – Flavobakterie jsou chemoorganotrofy a jsou schopné degradovat biopolymery, jako je chitin a celulóza.^[6]

Morfologie a genom

D. donghaensis je gramnegativní bakterie, která je ve tvaru tyče, nepohyblivá a nevyvolává spory. Bakterie jsou schopné růst na médiu s mořskou vodou s agarem, ve kterém jsou kolonie kruhové, mírně konvexní, lesklé, hladké, žluté a v průměru 1–2 mm. Kmen DSW-1T D. donghaensis má asi 3 923 666 párů bází genom.^[7] The DNA Obsah G + C pro D. donghaensis je 38%.

Je možné zobrazit obrázek fylogenetického stromu tady.

Patologie

D. donghaensis nebyl identifikován jako člověk patogen.^{[Citace je zapotřebí ]}

Metabolismus

D. donghaensis provádí transport sodíkových iontů na světlo. Toto protonové čerpadlo poháněné světlem se nazývá a proteorhodopsin, což zvyšuje míru přežití organismu, protože může přeměňovat světlo na energii, kterou organismus potřebuje k růstu.^[8] Protože organismus využívá světlo k energii, je to a fototrofní. D. donghaensis je schopen vylučovat enzymy jako např kataláza a oxidáza.^[9] Protože organismus je přísný aerobe, používal kyslík jako terminál akceptor elektronů. Organismus může růst na peptonu a tryptonu jako jediném zdroji uhlíku a dusíku. D. donghaensis nemůže růst v nepřítomnosti NaCl nebo když je vyšší než 7% (hmotn./obj.); růst je optimální při 2% (hmotn./obj.) NaCl. Organismus je citlivý na antibiotika tetracyklin a karbenicilin,^[10] ačkoli schopnost organismu tvořit biofilmy to ztěžuje antibiotika proniknout do viskózních vrstev.

Místo výskytu

D. donghaensis žije v halofilním mořském prostředí. Organismus může růst již od 4 ° C a až 35 ° C, i když optimální teplota pro růst je 30 ° C. Optimální pH pro růst je 7-8, i když růst lze pozorovat při pH již od 5,5.^[11]

Tvorba biofilmu

D. donghaensis je schopen tvořit biofilmy v mořských stanovištích, což je strategie přežití, která umožňuje organismu růst a zároveň je chráněn před stresy z prostředí. Tvorba biofilmu slouží účelu mořské bakterie v tom, že zvyšuje jejich odolnost vůči antimikrobiálním látkám, vysoušení a pastva.^{[12][13][14][15]} Biofilmy umožňují vylučování mikrobů k povrchům extracelulární polymerní látky (EPS). Mořské bakterie, které ulpívají na površích, vytvářejí hostitelské specifické a prostorově strukturované komunity, které jsou poměrně stabilní.^[16][17][18]

Reference

externí odkazy

• Typ kmene Dokdonia donghaensis ve společnosti BacPotápět - metadatabáze bakteriální rozmanitosti