Dvojmocný aniont-sodík - Divalent anion–sodium symporter

Identifikátory
SymbolDASS
PfamPF00939
TCDB2.A.47
OPM nadčeleď272
OPM protein4f35

Dvojmocný anion: Na+ sympatizanti byly nalezeny v bakteriích, archaea, rostlinné chloroplasty a zvířata.

Struktura

Liší se velikostí od 432 aminoacylových zbytků (M. jannaschii) na 923 zbytků (Saccharomyces cerevisiae ). Strom S. cerevisiae proteiny jsou velké (881-923 zbytků); živočišné proteiny jsou podstatně menší (539-616 zbytků) a bakteriální proteiny jsou stále menší (461-612 zbytků). Vykazují 11-14 putativních transmembránových α-šroubovicových klíčů (TMS). Byl navržen model 11 TMS pro zvířecí nosiče NaDC-1 a hNaSi-1.[1][2] Dva serinové zbytky v transportéru lidského síranu, hNaSi-1 (TC # 2.A.47.1.16; Q9BZW2 ), jeden v TMS 5 a jeden v TMS 6, jsou vyžadovány pro transport síranů.[1] První nosič a další izoformy NaDC kotransportují 3 Na+ s každým dikarboxylát. Protonované trikarboxyláty jsou také kotransportovány s 3 Na+. Několik organismů vlastní více paralogů rodiny DASS (např. 4 pro E-coli; 2 pro H. influenzae, 3 pro S. cerevisiaea nejméně 4 pro C. elegans ).

Homologie

Proteiny rodiny DASS jsou rozděleny do dvou skupin transportérů se zřetelnými aniontovými specifikami: Na+- síranové (NaS) kotransportéry a Na+-karboxylátové (NaC) kotransportéry. Savčími členy této rodiny jsou: SLC13A1 (NaS1), SLC13A2 (NaC1), SLC13A3 (NaC3), SLC13A4 (NaS2) a SLC13A5 (NaC2).[3] Proteiny rodiny DASS kódují plazmatické membránové polypeptidy s 8-13 domnělými transmembránovými doménami a jsou exprimovány v různých tkáních. Všichni jsou Na+- vázaní sympatizanti. Pak+: poměr aniontové vazby je 3: 1, což svědčí o elektrogenních vlastnostech. Mají preferenci substrátu pro dvojmocné anionty, které zahrnují tetra-oxyanionty pro kotransportéry NaS nebo meziprodukty Krebsova cyklu (včetně mono-, di- a trikarboxylátů) pro kotransportéry NaC. Byly přezkoumány molekulární a buněčné mechanismy, které jsou základem biochemických, fyziologických a strukturních vlastností členů rodiny DASS.[3]

Fylogenetický strom pro rodinu DASS odhaluje šest klastrů následovně:

  1. všechny zvířecí homology;
  2. všechny kvasinkové proteiny;
  3. funkčně necharakterizovaný protein z Ralstonia eutrophus;
  4. tři E-coli bílkoviny plus jeden z H. influenzae a jeden ze špenátových chloroplastů (sodná sůl oxoglutarátu: malátový translokátor);
  5. an E-coli Orf, který se volně shlukuje s proteinem Synechocystis regulovaným deprivací síry, a
  6. an M. jannaschii protein, který se volně shlukuje s H. influenzae Orf.

Vzdálené homology proteinů rodiny DASS mohou zahrnovat členy Ars (vývozce arzenitu) (TC # 3.A.4 ) rodina i NhaB (TC # 2.A.34 ) a NhaC (TC # 2.A.35 ) Na+/ H+ antiporter rodiny. Rodina DASS je proto členem nadrodina iontových transportérů (IT).[4]

Funkce

Funkčně charakterizované proteiny rodiny DASS (nazývané také Rodina SLC13 ) doprava:

  1. organické di- a trikarboxyláty Krebsův cyklus stejně jako dikarboxylátová aminokyselina,
  2. anorganický síran a (3) fosfát.

Generalizovaná transportní reakce katalyzovaná proteiny rodiny DASS je pravděpodobně:

Anion2− (out) + nM+ [Na+ nebo H+] (ven) → Anion2− (v) + nM+ (v).

Viz také

Reference

  1. ^ A b Li H, Pajor AM (září 2003). „Seriny 260 a 288 se podílejí na transportu síranů hNaSi-1“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (39): 37204–12. doi:10,1074 / jbc.M305465200. PMID  12857732.
  2. ^ Pajor AM (01.01.1999). "Transportéry vázané na sodík pro meziprodukty Krebsova cyklu". Roční přehled fyziologie. 61: 663–82. doi:10,1146 / annurev.fyziol.61.1.663. PMID  10099705.
  3. ^ A b Markovich D (01.01.2012). "Kotransportéry síranu sodného / karboxylátu (SLC13)". Aktuální témata v oblasti membrán. 70: 239–56. doi:10.1016 / B978-0-12-394316-3.00007-7. ISBN  9780123943163. PMID  23177988.
  4. ^ Rabus R, Jack DL, Kelly DJ, Saier MH (prosinec 1999). „TRAP transportéry: prastará rodina sekundárních aktivních transportérů závislých na extracytoplazmatickém rozpustném receptoru“. Mikrobiologie. 145 (Pt 12) (12): 3431–45. doi:10.1099/00221287-145-12-3431. PMID  10627041.