DEPTOR - DEPTOR

DEPTOR
Identifikátory
Aliasy	DEPTORDEP.6, DEPDC6, doména DEP obsahující protein interagující s MTOR, doména DEP obsahující protein interagující s MTOR
Externí ID	OMIM: 612974 MGI: 2146322 HomoloGene: 32551 Genové karty: DEPTOR
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	120,050,918 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	55,259,271 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• intracelulární; • cytoplazma;
Biologický proces	• GO: 0007243 transdukce intracelulárního signálu; • regulace vnější apoptotické signální dráhy; • negativní regulace velikosti buněk; • negativní regulace aktivity proteinkinázy; • negativní regulace TOR signalizace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	64798
	97998
	ENSG00000155792
	ENSMUSG00000022419
	Q8TB45
	Q570Y9
	NM_022783; NM_001283012
	NM_001037937; NM_145470
	NP_001269941; NP_073620
	NP_001033026; NP_663445
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein interagující s mTOR obsahující DEP doménu (DEPTOR) také známý jako Protein obsahující DEP doménu 6 (DEPDC6) je protein že u lidí je kódován DEPTOR gen.^[5]

Struktura

Gen DEPTOR lze nalézt pouze u obratlovců. V člověku DEPTOR gen lokalizuje na chromozomu 8, 8q24.12 s velikostí proteinu 409 a.a.^[6] Human DEPTOR obsahuje dva N-terminál DEP domény a a C-terminál Doména PDZ.^[7]

Funkce

DEPTOR je zapojen do Signální dráha mTOR jako endogenní regulátor. Byla ukázána přímá interakce mezi DEPTOREM a mTOR.^[7] Nadměrná exprese DEPTORU reguluje aktivitu mTORC1 a mTORC2 in vitro. mTORC1 a mTORC2 mohou oba inhibovat DEPTOR fosforylace.^[7]

Metabolismus

Buňka DEPTOR reguluje autonomně adipogeneze.^[8] Ve svalu podporuje Baf60c přechod z oxidativního na glykolytický typ myofibre prostřednictvím DEPTORU Akt / PKB aktivace.^[9] V mozku je DEPTOR vysoce exprimován v hipokampus, medio-bazální hypotalamus a cirkumventrikulární orgány.^[10] Nadměrná exprese DEPTORU v medio-bazálním hypotalamu chrání myši před dietou vyvolanou vysokým obsahem tuku obezita modulací Akt / PKB signalizace.^[11]

Klinická rakovina

Ačkoli u většiny rakoviny je dráha mTOR konstitutivně aktivována a exprese DEPTOR je nízká, jedna studie zjistila, že DEPTOR je nadměrně exprimován mnohočetný myelom buněk a je nezbytný pro jejich přežití.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000155792 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000022419 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: DEPDC6 DEP doména obsahující 6“.
^ „Homo sapiens - rodiny proteinů Ensembl - gen: DEPTOR (ENSG00000155792)“. Prohlížeč genomu souboru 78.
^ ^A ^b ^C ^d Peterson TR, Laplante M, Thoreen CC, Sancak Y, Kang SA, Kuehl WM, Gray NS, Sabatini DM (květen 2009). „DEPTOR je inhibitor mTOR často nadměrně exprimovaný v buňkách mnohočetného myelomu a nezbytný pro jejich přežití“. Buňka. 137 (5): 873–86. doi:10.1016 / j.cell.2009.03.046. PMC 2758791. PMID 19446321.
^ Laplante M, Horvat S, Festuccia WT, Birsoy K, Prevorsek Z, Efeyan A, Sabatini DM (srpen 2012). „DEPTOR buňka autonomně podporuje adipogenezi a její exprese je spojena s obezitou“. Buněčný metabolismus. 16 (2): 202–12. doi:10.1016 / j.cmet.2012.07.008. PMC 3463374. PMID 22883231.
^ Meng ZX, Li S, Wang L, Ko HJ, Lee Y, Jung DY, Okutsu M, Yan Z, Kim JK, Lin JD (květen 2013). „Baf60c řídí glykolytický metabolismus ve svalu a zlepšuje systémovou homeostázu glukózy prostřednictvím Deptorem zprostředkované aktivace Akt“. Přírodní medicína. 19 (5): 640–5. doi:10,1038 / nm. 3144. PMC 3650110. PMID 23563706.
^ Caron A, Baraboi ED, Laplante M, Richard D (leden 2015). „Protein interagující s mTOR doménou DEP v mozku krysy: distribuce exprese a potenciální implikace“. The Journal of Comparative Neurology. 523 (1): 93–107. doi:10,1002 / cne.23668. PMID 25159114. S2CID 205683672.
^ Caron, Alexandre; Labbé, Sébastien M .; Lanfray, Damien; Blanchard, Pierre-Gilles; Villot, Romain; Roy, Christian; Sabatini, David M .; Richard, Denis; Laplante, Mathieu (2016). „Mediobazální hypothalamická nadměrná exprese Deptora chrání před obezitou vyvolanou stravou s vysokým obsahem tuku“. Molekulární metabolismus. 5 (2): 102–112. doi:10.1016 / j.molmet.2015.11.005. PMC 4735664. PMID 26909318.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Výzkum genomu. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Výzkum genomu. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (září 2000). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. Zprávy EMBO. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (říjen 2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Výzkum genomu. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (leden 2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000155792 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000022419 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: DEPDC6 DEP doména obsahující 6“.

[Ensembl-6] „Homo sapiens - rodiny proteinů Ensembl - gen: DEPTOR (ENSG00000155792)“. Prohlížeč genomu souboru 78.

[Peterson_2009-7] A ^b ^C ^d Peterson TR, Laplante M, Thoreen CC, Sancak Y, Kang SA, Kuehl WM, Gray NS, Sabatini DM (květen 2009). „DEPTOR je inhibitor mTOR často nadměrně exprimovaný v buňkách mnohočetného myelomu a nezbytný pro jejich přežití“. Buňka. 137 (5): 873–86. doi:10.1016 / j.cell.2009.03.046. PMC 2758791. PMID 19446321.

[8] Laplante M, Horvat S, Festuccia WT, Birsoy K, Prevorsek Z, Efeyan A, Sabatini DM (srpen 2012). „DEPTOR buňka autonomně podporuje adipogenezi a její exprese je spojena s obezitou“. Buněčný metabolismus. 16 (2): 202–12. doi:10.1016 / j.cmet.2012.07.008. PMC 3463374. PMID 22883231.

[9] Meng ZX, Li S, Wang L, Ko HJ, Lee Y, Jung DY, Okutsu M, Yan Z, Kim JK, Lin JD (květen 2013). „Baf60c řídí glykolytický metabolismus ve svalu a zlepšuje systémovou homeostázu glukózy prostřednictvím Deptorem zprostředkované aktivace Akt“. Přírodní medicína. 19 (5): 640–5. doi:10,1038 / nm. 3144. PMC 3650110. PMID 23563706.

[10] Caron A, Baraboi ED, Laplante M, Richard D (leden 2015). „Protein interagující s mTOR doménou DEP v mozku krysy: distribuce exprese a potenciální implikace“. The Journal of Comparative Neurology. 523 (1): 93–107. doi:10,1002 / cne.23668. PMID 25159114. S2CID 205683672.

[11] Caron, Alexandre; Labbé, Sébastien M .; Lanfray, Damien; Blanchard, Pierre-Gilles; Villot, Romain; Roy, Christian; Sabatini, David M .; Richard, Denis; Laplante, Mathieu (2016). „Mediobazální hypothalamická nadměrná exprese Deptora chrání před obezitou vyvolanou stravou s vysokým obsahem tuku“. Molekulární metabolismus. 5 (2): 102–112. doi:10.1016 / j.molmet.2015.11.005. PMC 4735664. PMID 26909318.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]