DEP doména - DEP domain
| Doména nalezená v Disheveled, Egl-10 a Pleckstrin (DEP) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 strukturální základna rozpoznání rozcuchané dep domény v signální cestě wnt | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | DEP | ||||||||
| Pfam | PF00610 | ||||||||
| InterPro | IPR000591 | ||||||||
| CDD | cd04371 | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii se DEP doména (Dskosený, Egl-10 a Pleckstrin doména) je globulární proteinová doména asi 80 aminokyseliny který se nachází ve více než 50 bílkoviny zahrnutý do něčeho, zůčastnit se čeho G-protein signální dráhy. Bylo pojmenováno po třech bílkoviny původně byl nalezen v:
- Rozcuchaný (Dsh a Dvl), která hraje klíčovou roli v transdukce signálu Wg / Wnt z buňka povrch k jádro; to je protein polarity segmentu požadováno k vytvoření koherentního pole polarizovaných buněk a segmentů v embrya, a hraje roli v bezkřídlý signalizace.
- Egl-10, který reguluje G-protein signalizace v centrální nervový systém v RGS9.[1]
- Pleckstrin, hlavní Podklad z protein kináza C. v krevní destičky; Pleckstrin obsahuje dva PH domén lemující doménu DEP.
Savčí regulátory signalizace G-proteinu také obsahují tyto domény a regulují signální transdukce zvýšením GTPáza aktivita alfa podjednotek G-proteinu, čímž se dostává do jejich neaktivní formy vázané na GDP. Bylo navrženo, aby doména DEP mohla hrát selektivní roli při cílení na doménu DEP obsahující bílkoviny na konkrétní subcelulární membránová místa, možná dokonce na konkrétní Vazba na G protein signální dráhy.[2][3] Jaderná magnetická rezonance spektroskopie odhalila, že doména DEP zahrnuje svazek se třemi šroubovicemi, beta-vlásenkové „rameno“ složené ze dvou beta-řetězců a dvou krátkých beta-řetězců v C-koncové oblasti.[3]
Reference
- ^ Masuho, I .; Wakasugi-Masuho, H .; Posokhova, E. N .; Patton, J. R .; Martemyanov, K. A. (2011). "Proteinová podjednotka typu 5 G (G 5) řídí interakci regulátoru signalizace G proteinu 9 (RGS9) s membránovými kotvami". Journal of Biological Chemistry. 286 (24): 21806–21813. doi:10.1074 / jbc.M111.241513. PMC 3122235. PMID 21511947.
- ^ Burchett SA (říjen 2000). "Regulátory signalizace G proteinu: bestiář modulárních domén vázajících protein". J. Neurochem. 75 (4): 1335–51. doi:10.1046 / j.1471-4159.2000.0751335.x. PMID 10987813.
- ^ A b Wong HC, Mao J, Nguyen JT, Srinivas S, Zhang W, Liu B, Li L, Wu D, Zheng J (prosinec 2000). „Strukturální základna rozpoznání rozcuchané DEP domény v signální cestě Wnt“. Nat. Struct. Biol. 7 (12): 1178–84. doi:10.1038/82047. PMC 4381838. PMID 11101902.