Cytochrom f - Cytochrome f
Apocytochr_F_C | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
cytochrom f z komplexu b6f Phormidium laminosum | |||||||||
Identifikátory | |||||||||
Symbol | Apocytochr_F_C | ||||||||
Pfam | PF01333 | ||||||||
Pfam klan | CL0105 | ||||||||
InterPro | IPR002325 | ||||||||
STRÁNKA | PDOC00169 | ||||||||
SCOP2 | 1ctm / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
TCDB | 3.D.3 | ||||||||
OPM nadčeleď | 92 | ||||||||
OPM protein | 3h1j | ||||||||
|
Cytochrom F je největší podjednotkou cytochrom b6F komplex (plastochinol - plastocyanin reduktáza; ES 1.10.99.1 ). Ve své struktuře a funkcích má komplex cytochromu b6f rozsáhlou analogii s komplex cytochromu bc1 z mitochondrie a fotosyntetické fialové bakterie. Cytochrom f (cyt f) hraje roli podobnou cytochromu c1, a to navzdory jejich odlišnosti struktur.[1]
3D struktura Brassica rapa (Tuřín ) byl stanoven cyt f.[2] Segment lumen na straně cyt f zahrnuje dva strukturální domény: malý nad větším, který je naopak na vrcholu připojení k membránové doméně. Velká doména se skládá z antiparalelního beta sendviče a krátkého hem vázajícího peptidu, který tvoří třívrstvý struktura. Malá doména je vložena mezi beta řetězce F a G velké domény a je doménou all-beta. Hem se hnízdí mezi dvěma krátkými šroubovice na N konci cyt f. Během druhé spirála je sekvenční motiv pro cytochromy typu c, CxxCH (zbytky 21-25), což je kovalentně připojený k hemu přes thioether vazby na Cys-21 a Cys-24. His-25 je pátý haem žehlička ligand. Šestý hem železa ligand je alfa-aminoskupina Tyr-1 v první šroubovici.[2] Cyt f má interní síť voda molekuly, které mohou fungovat jako protonový drát.[2] Voda řetěz se zdá být a konzervovaný rys cyt f.
Reference
- ^ Prince RC, George GN (červen 1995). "Cytochrom f odhalen". Trends Biochem. Sci. 20 (6): 217–8. doi:10.1016 / S0968-0004 (00) 89018-0. PMID 7631417.
- ^ A b C Martinez SE, Huang D, Ponomarev M, Cramer WA, Smith JL (červen 1996). „Hemově redoxní centrum chloroplastového cytochromu f je spojeno se zakopaným řetězcem pěti vod“. Protein Sci. 5 (6): 1081–92. doi:10.1002 / pro.5560050610. PMC 2143431. PMID 8762139.
Další čtení
- Bendall, D.S. (2004). „Nedokončený příběh cytochromu F". Fotosyntéza. Res. 80 (1–3): 265–276. doi:10.1023 / B: PRES.0000030454.23940.f9. PMID 16328825.
- Cramer, W. A.; Martinez, S.E .; Huang, D .; Tae, GS; Everly, R.M .; Heymann, J. B.; Cheng, R.H .; Baker, T.S. & Smith, J. L. (1994). „Strukturální aspekty cytochromu b6F komplex; struktura lumenové domény cytochromu F". J. Bioenerg. Biomembr. 26 (1): 31–47. doi:10.1007 / BF00763218. PMC 4167668. PMID 8027021.
externí odkazy
- Cytochrom + f v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)