Běžná varianta onemocnění - Common disease-common variant - Wikipedia
The běžná varianta onemocnění (často zkráceno CD-CV) hypotéza předpovídá, že běžné vyvolávání nemocí alely nebo varianty, budou nalezeny ve všech lidských populacích, u kterých se projeví dané onemocnění. Je známo, že v kódujících a regulačních sekvencích genů existují běžné varianty (které nemusí nutně způsobovat onemocnění). Podle hypotézy CD-CV vedou některé z těchto variant k náchylnosti ke komplexním polygenním onemocněním. Každá varianta v každém genu ovlivňující komplexní onemocnění bude mít malý aditivní nebo multiplikativní účinek na fenotyp onemocnění. Tato onemocnění nebo znaky jsou z evolučního hlediska částečně neutrální, protože na tyto vlastnosti vplývá tolik genů. Hypotéza platí pro případ domnělých kauzálních variant v apolipoprotein E, včetně APOE ε4, spojené s Alzheimerova choroba.[1] IL23R bylo zjištěno, že je spojen s Crohnova nemoc; alela v riziku má v obecné populaci frekvenci 93%[Citace je zapotřebí ].
Jedna běžná forma variace napříč lidskými genomy se nazývá a polymorfismus jednoho nukleotidu (SNP). Jak naznačuje název, SNP jsou změny jedné báze v DNA. Varianty SNP bývají běžné u různých lidských populací. Tyto polymorfismy byly cenné jako genomické ukazatele nebo „markery“ při hledání běžných variant, které ovlivňují náchylnost k běžným chorobám. Výzkum spojil běžné SNP s chorobami, jako je diabetes typu 2, Alzheimerova choroba, schizofrenie a hypertenze.[2][3][4][5][6]
Viz také
Reference
- ^ Rozšířená genetická studie s vysokým rozlišením 109 švédských rodin s Alzheimerovou chorobou, Anna Sillén, Jorge Andrade, Lena Lilius, Charlotte Forsell, Karin Axelman, Jacob Odeberg, Bengt Winblad a Caroline Graff, European Journal of Human Genetics (2008) 16, 202– 208; doi:10.1038 / sj.ejhg.5201946; zveřejněno online 24. října 2007
- ^ Duerr, R. H .; Taylor, K. D .; Brant, S. R .; Rioux, J. D .; Silverberg, M. S .; Daly, M. J.; Steinhart, A. H .; Abraham, C .; Regueiro, M .; Griffiths, A .; Dassopoulos, T .; Bitton, A .; Yang, H .; Targan, S .; Datta, L. W .; Kistner, E.O .; Schumm, L. P .; Lee, A. T .; Gregersen, P. K .; Barmada, M. M .; Rotter, J. I .; Nicolae, D. L .; Cho, J. H. (2006). „Asociační studie na celém genomu identifikuje IL23R jako gen zánětlivého onemocnění střev“. Věda. 314 (5804): 1461–1463. doi:10.1126 / science.1135245. ISSN 0036-8075. PMC 4410764. PMID 17068223.
- ^ Levy, Daniel; Ehret, Georg B; Rice, Kenneth; Verwoert, Germaine C; Launer, Lenore J; Dehghan, Abbas; Glazer, Nicole L; Morrison, Alanna C; Johnson, Andrew D; Aspelund, Thor; Aulchenko, Yurii; Lumley, Thomas; Köttgen, Anna; Vasan, Ramachandran S; Rivadeneira, Fernando; Eiriksdottir, Gudny; Guo, Xiuqing; Arking, Dan E; Mitchell, Gary F; Mattace-Raso, Francesco USA; Smith, Albert V; Taylor, Kent; Scharpf, Robert B; Hwang, Shih-Jen; Sijbrands, Eric J. G.; Bis, Joshua; Harris, Tamara B; Ganesh, Santhi K; O'Donnell, Christopher J; Hofman, Albert; Rotter, Jerome I; Coresh, Josef; Benjamin, Emelia J; Uitterlinden, André G; Heiss, Gerardo; Fox, Caroline S; Witteman, Jacqueline CM; Boerwinkle, Eric; Wang, Thomas J; Gudnason, Vilmundur; Larson, Martin G; Chakravarti, Aravinda; Psaty, Bruce M; van Duijn, Cornelia M (2009). „Celomanomová asociační studie krevního tlaku a hypertenze“. Genetika přírody. 41 (6): 677–687. doi:10,1038 / ng.384. ISSN 1061-4036. PMC 2998712. PMID 19430479.
- ^ Storey, John D .; Raychaudhuri, Soumya; Plenge, Robert M .; Rossin, Elizabeth J .; Ng, Aylwin C. Y .; Purcell, Shaun M .; Sklar, Pamela; Scolnick, Edward M .; Xavier, Ramnik J .; Altshuler, David; Daly, Mark J. (2009). „Identifikace vztahů mezi regiony genomických chorob: předpovídání genů u patogenních asociací SNP a vzácné delece“. Genetika PLoS. 5 (6): e1000534. doi:10.1371 / journal.pgen.1000534. ISSN 1553-7404. PMC 2694358. PMID 19557189.
- ^ Seshadri, Sudha (2010). „Analýza celého genomu genetických lokusů spojených s Alzheimerovou chorobou“. JAMA. 303 (18): 1832. doi:10.1001 / jama.2010.574. ISSN 0098-7484. PMC 2989531. PMID 20460622.
- ^ Zeggini, Eleftheria; Scott, Laura J; Saxena, Richa; Voight, Benjamin F; Marchini, Jonathan L; Hu, Tianle; de Bakker, Paul IW; Abecasis, Gonçalo R; Almgren, Peter; Andersen, Gitte; Ardlie, Kristin; Boström, Kristina Bengtsson; Bergman, Richard N; Bonnycastle, Lori L; Borch-Johnsen, Knut; Burtt, Noël P; Chen, Hong; Chines, Peter S; Daly, Mark J.; Deodhar, Parimal; Ding, Chia-Jen; Doney, Alex S F; Duren, William L; Elliott, Katherine S; Erdos, Michael R; Frayling, Timothy M; Freathy, Rachel M; Gianniny, Lauren; Grallert, Harald; Grarup, Niels; Groves, Christopher J; Guiducci, Candace; Hansen, Torben; Herder, Christian; Hitman, Graham A; Hughes, Thomas E; Isomaa, Bo; Jackson, Anne U; Jørgensen, Torben; Kong, Augustine; Kubalanza, Kari; Kuruvilla, Finny G; Kuusisto, Johanna; Langenberg, Claudia; Lango, Hana; Lauritzen, Torsten; Li, Yun; Lindgren, Cecilia M; Lyssenko, Valeriya; Marvelle, Amanda F; Meisinger, Christa; Midthjell, Kristian; Mohlke, Karen L; Morken, Mario A; Morris, Andrew D; Narisu, Narisu; Nilsson, Peter; Owen, Katharine R; Palmer, Colin NA; Payne, Felicity; Perry, John R B; Pettersen, Elin; Platou, Carl; Prokopenko, Inga; Qi, Lu; Qin, Li; Rayner, Nigel W; Rees, Matthew; Roix, Jeffrey J; Sandbæk, Anelli; Shields, Beverley; Sjögren, Markéta; Steinthorsdottir, Valgerdur; Stringham, Heather M; Swift, Amy J; Thorleifsson, Gudmar; Thorsteinsdottir, Unnur; Timpson, Nicholas J; Tuomi, Tiinamaija; Tuomilehto, Jaakko; Walker, Mark; Watanabe, Richard M; Weedon, Michael N; Willer, Cristen J; Illig, Thomas; Hveem, Kristian; Hu, Frank B; Laakso, Markku; Stefansson, Kari; Pedersen, Oluf; Wareham, Nicholas J; Barroso, Inês; Hattersley, Andrew T; Collins, Francis S; Groop, Leif; McCarthy, Mark I; Boehnke, Michael; Altshuler, David (2008). „Metaanalýza asociačních dat v celém genomu a replikace ve velkém měřítku identifikuje další lokusy citlivosti na diabetes 2. typu“. Genetika přírody. 40 (5): 638–645. doi:10,1038 / ng.120. ISSN 1061-4036. PMC 2672416. PMID 18372903.