CYFIP1 - CYFIP1 - Wikipedia

CYFIP1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3P8C, 4N78
Identifikátory
Aliasy	CYFIP1, P140SRA-1, SHYC, SRA-1, SRA1, cytoplazmatický FMR1 interagující protein 1
Externí ID	OMIM: 606322 MGI: 1338801 HomoloGene: 22628 Genové karty: CYFIP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 15 (lidský)
Konec	22,981,063 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	55,932,602 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktinová vazba; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu; • vazba aktinového vlákna; • Rac GTPase vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba víčka RNA na 7-methylguanosin; • činnost regulačního orgánu překladu;
Buněčná složka	• extracelulární exosom; • cytoplazma; • synapse; • buněčná projekce; • buněčné spojení; • cytosol; • SCAR komplex; • ohnisková adheze; • lamellipodium; • perinukleární oblast cytoplazmy; • prohrábnout; • komplex vázající se na víčko mRNA; • neuronová projekce; • extracelulární oblast; • hrot filopodia; • lumen sekreční granule; • specifický lumen granule; • tělo neuronových buněk; • terminální tlačítko; • dendritická páteř; • dendritický růstový kužel; • axonální růstový kužel; • excitační synapse; • centrální oblast růstového kuželu; • okrajová oblast růstového kužele; • lumen terciární granule; • postsynapse;
Biologický proces	• Transdukce signálu proteinu Rac; • poznání; • Signální dráha receptoru Fc-gama zapojená do fagocytózy; • vývoj mnohobuněčných organismů; • organizovat volánky; • prodloužení axonu; • signální dráha receptoru pro vaskulární endoteliální růstový faktor; • vývoj nervového systému; • regulace tvaru buňky; • diferenciace buněk; • pozitivní regulace nukleace aktinu zprostředkovaná komplexem Arp2 / 3; • sestava lamellipodium; • buněčná odpověď na inzulínový stimul; • degranulace neutrofilů; • pozitivní regulace prodloužení axonu; • pozitivní regulace axonogeneze; • reakce na elektrický podnět; • pozitivní regulace vývoje dendritů; • pozitivní regulace sestavení volánku; • negativní regulace recyklace synaptických vezikul; • vývoj neuronové projekce; • pozitivní regulace signální dráhy neurotropinového TRK receptoru; • přípona dendrite; • regulace překladu; • modifikace synaptické struktury; • buněčná morfogeneze; • axonové vedení; • sestava projekce buněk; • regulace překladu v postsynapse, modulační synaptický přenos; • regulace modifikace postsynaptického aktinového cytoskeletu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23191
	20430
	ENSG00000280618; ENSG00000273749
	ENSMUSG00000030447
	Q7L576
	Q7TMB8
NM_001033028; NM_001287810; NM_014608; NM_001324119; NM_001324120;
	NM_001324122; NM_001324123; NM_001324124; NM_001324125; NM_001324126
	NM_001164661; NM_001164662; NM_011370
NP_001028200; NP_001274739; NP_001311048; NP_001311049; NP_001311051;
	NP_001311052; NP_001311053; NP_001311054; NP_001311055; NP_055423
	NP_001158133; NP_001158134; NP_035500
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Cytoplazmatický protein interagující s FMR1 1 je protein že u lidí je kódován CYFIP1 gen.^[5]^[6]

Interakce

CYFIP1 bylo prokázáno komunikovat s FMR1,^[5] s vyloučením FXR1 a FXR2.^[5] Je také součástí Regulační komplex WAVE (WRC),^[7] a na základě krystalové struktury WRC se předpokládá, že CYFIP1 poskytuje vazebné místo pro komplex Rac1.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000273749 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000280618, ENSG00000273749 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030447 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C Schenck A, Bardoni B, Moro A, Bagni C, Mandel JL (červenec 2001). „Vysoce konzervovaná rodina proteinů interagující s křehkým X mentálním retardačním proteinem (FMRP) a vykazující selektivní interakce s proteiny FXR1P a FXR2P souvisejícími s FMRP“. Proc Natl Acad Sci U S A. 98 (15): 8844–9. doi:10.1073 / pnas.151231598. PMC 37523. PMID 11438699.
^ „Entrez Gene: CYFIP1 cytoplazmatický FMR1 interagující protein 1“.
^ Chen Z, Borek D, Padrick SB, Gomez TS, Metlagel Z, Ismail AM, Umetani J, Billadeau DD, Otwinowski Z, Rosen MK (25. listopadu 2010). "Struktura a řízení aktinového regulačního komplexu WAVE". Příroda. 468 (7323): 533–8. doi:10.1038 / nature09623. PMC 3085272. PMID 21107423.
^ Koronakis V, Hume PJ, Humphreys D, Liu T, Hørning O, Jensen ON, McGhie EJ (30. srpna 2011). „Aktivace regulačního komplexu WAVE spoluprací GTPasy Arf a Rac1“. Proc Natl Acad Sci U S A. 108 (35): 14449–54. doi:10.1073 / pnas.1107666108. PMC 3167530. PMID 21844371.

Další čtení

Nomura N, Nagase T, Miyajima N a kol. (1995). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. II. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0041-KIAA0080) odvozené analýzou klonů cDNA z lidské buněčné linie KG-1“. DNA Res. 1 (5): 223–9. doi:10.1093 / dnares / 1.5.223. PMID 7584044.
Kobayashi K, Kuroda S, Fukata M a kol. (1998). „p140Sra-1 (konkrétně protein asociovaný s Rac1) je nový specifický cíl pro malou GTPázu Rac1“. J. Biol. Chem. 273 (1): 291–5. doi:10.1074 / jbc.273.1.291. PMID 9417078.
Witke W, Podtelejnikov AV, Di Nardo A a kol. (1998). "V myším mozku se profilin I a profilin II spojují s regulátory endocytické dráhy a sestavy aktinu". EMBO J.. 17 (4): 967–76. doi:10.1093 / emboj / 17.4.967. PMC 1170446. PMID 9463375.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Chai JH, Locke DP, Greally JM a kol. (2003). „Identifikace čtyř vysoce konzervovaných genů mezi aktivními body zlomu BP1 a BP2 oblasti vypouštění syndromů Prader-Willi / Angelman, které prošly evoluční transpozicí zprostředkovanou doprovodnými duplikáty“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 73 (4): 898–925. doi:10.1086/378816. PMC 1180611. PMID 14508708.
Brajenovic M, Joberty G, Küster B a kol. (2004). „Komplexní proteomická analýza lidských proteinových komplexů Par odhaluje vzájemně propojenou proteinovou síť“. J. Biol. Chem. 279 (13): 12804–11. doi:10,1074 / jbc.M312171200. PMID 14676191.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Innocenti M, Zucconi A, Disanza A a kol. (2004). „Abi1 je nezbytný pro vznik a aktivaci signalizačního komplexu WAVE2“. Nat. Cell Biol. 6 (4): 319–27. doi:10.1038 / ncb1105. PMID 15048123.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Kawano Y, Yoshimura T, Tsuboi D a kol. (2005). „CRMP-2 se účastní transportu komplexu Sra-1 / WAVE1 a tvorby axonů závislého na kinesinu-1“. Mol. Buňka. Biol. 25 (22): 9920–35. doi:10.1128 / MCB.25.22.9920-9935.2005. PMC 1280248. PMID 16260607.
Bittel DC, Kibiryeva N, Butler MG (2006). „Exprese 4 genů mezi hraničními hodnotami 1 a 2 chromozomu 15 a výsledky chování u Prader-Williho syndromu“. Pediatrie. 118 (4): e1276–83. doi:10.1542 / peds.2006-0424. PMC 5453799. PMID 16982806.
Chen Z, Borek D, Padrick SB, Gomez TS, Metlagel Z, Ismail AM, Umetani J, Billadeau DD, Otwinowski Z, Rosen MK (25. listopadu 2010). "Struktura a řízení aktinového regulačního komplexu WAVE". Příroda. 468 (7323): 533–8. doi:10.1038 / nature09623. PMC 3085272. PMID 21107423.
Koronakis V, Hume PJ, Humphreys D, Liu T, Hørning O, Jensen ON, McGhie EJ (30. srpna 2011). „Aktivace regulačního komplexu WAVE spoluprací GTPasy Arf a Rac1“. Proc Natl Acad Sci U S A. 108 (35): 14449–54. doi:10.1073 / pnas.1107666108. PMC 3167530. PMID 21844371.

externí odkazy

Člověk CYFIP1 umístění genomu a CYFIP1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Člověk SRA1 umístění genomu a SRA1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 15 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000273749 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000280618, ENSG00000273749 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030447 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11438699-5] A ^b ^C Schenck A, Bardoni B, Moro A, Bagni C, Mandel JL (červenec 2001). „Vysoce konzervovaná rodina proteinů interagující s křehkým X mentálním retardačním proteinem (FMRP) a vykazující selektivní interakce s proteiny FXR1P a FXR2P souvisejícími s FMRP“. Proc Natl Acad Sci U S A. 98 (15): 8844–9. doi:10.1073 / pnas.151231598. PMC 37523. PMID 11438699.

[entrez-6] „Entrez Gene: CYFIP1 cytoplazmatický FMR1 interagující protein 1“.

[pmid21107423-7] Chen Z, Borek D, Padrick SB, Gomez TS, Metlagel Z, Ismail AM, Umetani J, Billadeau DD, Otwinowski Z, Rosen MK (25. listopadu 2010). "Struktura a řízení aktinového regulačního komplexu WAVE". Příroda. 468 (7323): 533–8. doi:10.1038 / nature09623. PMC 3085272. PMID 21107423.

[pmid21844371-8] Koronakis V, Hume PJ, Humphreys D, Liu T, Hørning O, Jensen ON, McGhie EJ (30. srpna 2011). „Aktivace regulačního komplexu WAVE spoluprací GTPasy Arf a Rac1“. Proc Natl Acad Sci U S A. 108 (35): 14449–54. doi:10.1073 / pnas.1107666108. PMC 3167530. PMID 21844371.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]