CSTF2 - CSTF2

CSTF2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1P1T, 2J8P
Identifikátory
Aliasy	CSTF2, CstF-64, podjednotka stimulačního faktoru štěpení 2
Externí ID	OMIM: 300907 MGI: 1343054 HomoloGene: 80171 Genové karty: CSTF2
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	100,840,932 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	134,086,819 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleové kyseliny; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • mRNA vazba; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• komplex štěpení mRNA a komplex polyadenylační specificity; • tělo štěpení; • nukleoplazma; • buněčné jádro; • jaderné těleso;
Biologický proces	• Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • ukončení transkripce RNA polymerázy II; • Zpracování mRNA; • Zpracování mRNA 3'-end; • pro polyadenylaci je vyžadováno štěpení pre-mRNA; • Sestřih tRNA prostřednictvím endonukleolytického štěpení a ligace; • mRNA polyadenylace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1478
	108062
	ENSG00000101811
	ENSMUSG00000031256
	P33240
	Q8BIQ5
	NM_001306206; NM_001306209; NM_001325
	NM_001290398; NM_001290399; NM_133196; NM_001359053; NM_001359054
	NP_001293135; NP_001293138; NP_001316; NP_001293135.1
	NP_001277327; NP_001277328; NP_573459; NP_001345982; NP_001345983
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor stimulace štěpení 64 kDa podjednotka je protein že u lidí je kódován CSTF2 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje jaderný protein RRM (RNA rozpoznávací motiv ) doména. Protein je členem faktor stimulace štěpení (CSTF) komplex, který se podílí na 3 'koncovém štěpení a polyadenylace z pre-mRNA. Konkrétně tento protein váže prvky bohaté na GU v rámci 3'-nepřekládaná oblast mRNA.^[6]

Interakce

CSTF2 bylo prokázáno komunikovat s CSTF3,^[7] SUB1,^[8] SYMPK,^[7] BARD1^[9]^[10] a BRCA1.^[9]^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101811 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031256 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Takagaki Y, MacDonald CC, Shenk T, Manley JL (březen 1992). „Lidský 64-kDa polyadenylylační faktor obsahuje vazebnou doménu RNA ribonukleoproteinového typu a neobvyklé pomocné motivy.“. Proc Natl Acad Sci U S A. 89 (4): 1403–7. Bibcode:1992PNAS ... 89.1403T. doi:10.1073 / pnas.89.4.1403. PMC 48459. PMID 1741396.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CSTF2 štěpný stimulační faktor, 3 'pre-RNA, podjednotka 2, 64 kDa“.
^ ^A ^b Takagaki, Y; Manley J L (březen 2000). „Komplexní proteinové interakce v rámci lidského polyadenylačního aparátu identifikují novou složku“. Mol. Buňka. Biol. 20 (5): 1515–25. doi:10.1128 / MCB.20.5.1515-1525.2000. ISSN 0270-7306. PMC 85326. PMID 10669729.
^ Calvo, O; Manley J L (květen 2001). "Evolučně konzervovaná interakce mezi CstF-64 a PC4 spojuje transkripci, polyadenylaci a ukončení". Mol. Buňka. 7 (5): 1013–23. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00236-2. ISSN 1097-2765. PMID 11389848.
^ ^A ^b Kleiman, FE; Manley J L (březen 2001). „Interakce BARD1-CstF-50 spojuje tvorbu 3 'konce mRNA s poškozením DNA a potlačením nádoru“. Buňka. 104 (5): 743–53. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00270-7. ISSN 0092-8674. PMID 11257228.
^ ^A ^b Kleiman, FE; Manley J L (září 1999). "Funkční interakce BRCA1 asociovaného BARD1 s polyadenylačním faktorem CstF-50". Věda. 285 (5433): 1576–9. doi:10.1126 / science.285.5433.1576. ISSN 0036-8075. PMID 10477523.

externí odkazy

Člověk CSTF2 umístění genomu a CSTF2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Takagaki Y, Manley JL (1992). „Lidský polyadenylační faktor je homolog beta podjednotky G proteinu“. J. Biol. Chem. 267 (33): 23471–4. PMID 1358884.
Murthy KG, Manley JL (1995). „160-kD podjednotka lidských faktorů štěpení-polyadenylační specificity koordinuje pre-mRNA 3'-konec formace“. Genes Dev. 9 (21): 2672–83. doi:10,1101 / gad. 9.21.2672. PMID 7590244.
Takagaki Y, Manley JL (1994). „Podjednotka polyadenylačního faktoru je lidským homologem supresoru Drosophila vidlicového proteinu“. Příroda. 372 (6505): 471–4. Bibcode:1994 Natur.372..471T. doi:10.1038 / 372471a0. PMID 7984242.
Rüegsegger U, Beyer K, Keller W (1996). „Čištění a charakterizace lidského štěpného faktoru Im zapojeného do 3 'koncového zpracování prekurzorů messengerové RNA“. J. Biol. Chem. 271 (11): 6107–13. doi:10.1074 / jbc.271.11.6107. PMID 8626397.
Schul W, Groenhout B, Koberna K a kol. (1996). „Faktory štěpení RNA 3 'CstF 64 kDa a CPSF 100 kDa jsou koncentrovány v jaderných doménách úzce spojených se stočenými těly a nově syntetizovanou RNA.“. EMBO J.. 15 (11): 2883–92. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00649.x. PMC 450226. PMID 8654386.
Takagaki Y, Seipelt RL, Peterson ML, Manley JL (1997). „Polyadenylační faktor CstF-64 reguluje alternativní zpracování pre-mRNA těžkého řetězce IgM během diferenciace B buněk“. Buňka. 87 (5): 941–52. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 82000-0. PMID 8945520.
Takagaki Y, Manley JL (1997). "Rozpoznání RNA lidským polyadenylačním faktorem CstF". Mol. Buňka. Biol. 17 (7): 3907–14. doi:10.1128 / MCB.17.7.3907. PMC 232243. PMID 9199325.
Martincic K, Campbell R, Edwalds-Gilbert G a kol. (1998). „Zvýšení 64-kDa podjednotky stimulačního faktoru polyadenylace / štěpení během fázového přechodu G0 na S“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (19): 11095–100. Bibcode:1998PNAS ... 9511095M. doi:10.1073 / pnas.95.19.11095. PMC 21601. PMID 9736695.
Takagaki Y, Manley JL (1999). "Úrovně polyadenylačního faktoru CstF-64 kontrolují akumulaci mRNA těžkého řetězce IgM a další události spojené s diferenciací B buněk". Mol. Buňka. 2 (6): 761–71. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80291-9. PMID 9885564.
Kleiman FE, Manley JL (1999). "Funkční interakce BRCA1 asociovaného BARD1 s polyadenylačním faktorem CstF-50". Věda. 285 (5433): 1576–9. doi:10.1126 / science.285.5433.1576. PMID 10477523.
Takagaki Y, Manley JL (2000). „Komplexní proteinové interakce v rámci lidského polyadenylačního aparátu identifikují novou složku“. Mol. Buňka. Biol. 20 (5): 1515–25. doi:10.1128 / MCB.20.5.1515-1525.2000. PMC 85326. PMID 10669729.
Dass B, McMahon KW, Jenkins NA a kol. (2001). „Gen pro variantní formu polyadenylačního proteinu CstF-64 je na chromozomu 19 a je exprimován v pachytenových spermatocytech u myší“. J. Biol. Chem. 276 (11): 8044–50. doi:10,1074 / jbc.M009091200. PMID 11113135.
Kleiman FE, Manley JL (2001). „Interakce BARD1-CstF-50 spojuje tvorbu 3 'konce mRNA s poškozením DNA a potlačením nádoru“. Buňka. 104 (5): 743–53. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00270-7. PMID 11257228.
Calvo O, Manley JL (2001). "Evolučně konzervovaná interakce mezi CstF-64 a PC4 spojuje transkripci, polyadenylaci a ukončení". Mol. Buňka. 7 (5): 1013–23. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00236-2. PMID 11389848.
Bléoo S, Sun X, Hendzel MJ a kol. (2002). „Sdružení lidského DEAD box proteinu DDX1 s faktorem stimulace štěpení podílejícím se na 3'-konci zpracování pre-MRNA“. Mol. Biol. Buňka. 12 (10): 3046–59. doi:10,1091 / mbc. 12.10.3046. PMC 60154. PMID 11598190.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Pérez Cañadillas JM, Varani G (2003). "Rozpoznání polyadenylačních regulačních prvků bohatých na GU lidským proteinem CstF-64". EMBO J.. 22 (11): 2821–30. doi:10.1093 / emboj / cdg259. PMC 156756. PMID 12773396.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Xing H, Mayhew CN, Cullen KE a kol. (2004). „HSF1 modulace Hsp70 mRNA polyadenylace prostřednictvím interakce se symplekinem“. J. Biol. Chem. 279 (11): 10551–5. doi:10,1074 / jbc.M311719200. PMID 14707147.

Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101811 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031256 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1741396-5] Takagaki Y, MacDonald CC, Shenk T, Manley JL (březen 1992). „Lidský 64-kDa polyadenylylační faktor obsahuje vazebnou doménu RNA ribonukleoproteinového typu a neobvyklé pomocné motivy.“. Proc Natl Acad Sci U S A. 89 (4): 1403–7. Bibcode:1992PNAS ... 89.1403T. doi:10.1073 / pnas.89.4.1403. PMC 48459. PMID 1741396.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: CSTF2 štěpný stimulační faktor, 3 'pre-RNA, podjednotka 2, 64 kDa“.

[pmid10669729-7] A ^b Takagaki, Y; Manley J L (březen 2000). „Komplexní proteinové interakce v rámci lidského polyadenylačního aparátu identifikují novou složku“. Mol. Buňka. Biol. 20 (5): 1515–25. doi:10.1128 / MCB.20.5.1515-1525.2000. ISSN 0270-7306. PMC 85326. PMID 10669729.

[pmid11389848-8] Calvo, O; Manley J L (květen 2001). "Evolučně konzervovaná interakce mezi CstF-64 a PC4 spojuje transkripci, polyadenylaci a ukončení". Mol. Buňka. 7 (5): 1013–23. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00236-2. ISSN 1097-2765. PMID 11389848.

[pmid11257228-9] A ^b Kleiman, FE; Manley J L (březen 2001). „Interakce BARD1-CstF-50 spojuje tvorbu 3 'konce mRNA s poškozením DNA a potlačením nádoru“. Buňka. 104 (5): 743–53. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00270-7. ISSN 0092-8674. PMID 11257228.

[pmid10477523-10] A ^b Kleiman, FE; Manley J L (září 1999). "Funkční interakce BRCA1 asociovaného BARD1 s polyadenylačním faktorem CstF-50". Věda. 285 (5433): 1576–9. doi:10.1126 / science.285.5433.1576. ISSN 0036-8075. PMID 10477523.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]