CSTF3 - CSTF3 - Wikipedia

CSTF3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2, 2OOE
Identifikátory
Aliasy	CSTF3, CSTF-77, podjednotka stimulačního faktoru štěpení 3
Externí ID	OMIM: 600367 MGI: 1351825 HomoloGene: 1014 Genové karty: CSTF3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	33,162,371 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	104,665,429 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • mRNA vazba; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • ukončení transkripce RNA polymerázy II; • mRNA polyadenylace; • Štěpení mRNA; • Zpracování RNA; • Zpracování mRNA; • Zpracování mRNA 3'-end; • Zpracování RNA na 3'-konci;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1479
	228410
	ENSG00000176102
	ENSMUSG00000027176
	Q12996
	Q99LI7
	NM_001033505; NM_001033506; NM_001326
	NM_001037326; NM_145529; NM_177253
	NP_001028677; NP_001028678; NP_001317
	NP_001032403; NP_663504; NP_796227
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor stimulace štěpení 77 kDa podjednotka je protein že u lidí je kódován CSTF3 gen.^[5]^[6]

Protein kódovaný tímto genem je jedním ze tří (včetně CSTF1 a CSTF2 ) faktory stimulace štěpení, které se kombinují a tvoří faktor stimulace štěpení komplex (CSTF). Tento komplex je zapojen do polyadenylace a 3 'koncové štěpení pre-mRNA. Kódovaný protein funguje jako a homodimer a interaguje přímo s CSTF1 i CSTF2 v komplexu CSTF. Alternativní sestřih má za následek více variant přepisu kódujících různé izoformy.^[6]

Interakce

CSTF3 bylo prokázáno komunikovat s CSTF2.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000176102 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027176 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Takagaki Y, Manley JL (prosinec 1994). „Podjednotka polyadenylačního faktoru je lidským homologem supresoru Drosophila vidlicového proteinu“. Příroda. 372 (6505): 471–4. Bibcode:1994 Natur.372..471T. doi:10.1038 / 372471a0. PMID 7984242. S2CID 4329672.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CSTF3 štěpný stimulační faktor, 3 'pre-RNA, podjednotka 3, 77 kDa“.
^ Takagaki, Y; Manley J L (březen 2000). „Komplexní proteinové interakce v rámci lidského polyadenylačního aparátu identifikují novou složku. Mol. Buňka. Biol. 20 (5): 1515–25. doi:10.1128 / MCB.20.5.1515-1525.2000. ISSN 0270-7306. PMC 85326. PMID 10669729.

externí odkazy

Člověk CSTF3 umístění genomu a CSTF3 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Takagaki Y, Manley JL (1992). „Lidský polyadenylační faktor je homolog beta podjednotky G proteinu“. J. Biol. Chem. 267 (33): 23471–4. PMID 1358884.
Takagaki Y, MacDonald CC, Shenk T, Manley JL (1992). „Lidský 64-kDa polyadenylylační faktor obsahuje vazebnou doménu RNA ribonukleoproteinového typu a neobvyklé pomocné motivy.“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89 (4): 1403–7. Bibcode:1992PNAS ... 89.1403T. doi:10.1073 / pnas.89.4.1403. PMC 48459. PMID 1741396.
Murthy KG, Manley JL (1995). "160-kD podjednotka lidských faktorů štěpení-polyadenylační specificity koordinuje pre-mRNA 3'-konec formace". Genes Dev. 9 (21): 2672–83. doi:10,1101 / gad. 9.21.2672. PMID 7590244.
Takagaki Y, Manley JL (2000). „Komplexní proteinové interakce v rámci lidského polyadenylačního aparátu identifikují novou složku. Mol. Buňka. Biol. 20 (5): 1515–25. doi:10.1128 / MCB.20.5.1515-1525.2000. PMC 85326. PMID 10669729.
Emili A, Schieltz DM, Yates JR, Hartwell LH (2001). "Dynamická interakce proteinu kontrolního bodu poškození DNA Rad53 s faktorem sestavy chromatinu Asf1". Mol. Buňka. 7 (1): 13–20. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00150-2. PMID 11172707.
Benoit B, Juge F, Iral F a kol. (2002). "Chimérický lidský CstF-77 / Drosophila Supresor vidlicových proteinů záchranný supresor vidlicové mutantní letality a mRNA 3 'konec zpracování v Drosophila". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (16): 10593–8. Bibcode:2002PNAS ... 9910593B. doi:10.1073 / pnas.162191899. PMC 124984. PMID 12149458.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Kaufmann I, Martin G, Friedlein A a kol. (2005). „Human Fip1 je podjednotka CPSF, která se váže na prvky RNA bohaté na U a stimuluje poly (A) polymerázu“. EMBO J.. 23 (3): 616–26. doi:10.1038 / sj.emboj.7600070. PMC 1271804. PMID 14749727.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Kim J, Bhinge AA, Morgan XC, Iyer VR (2005). "Mapování interakcí DNA-protein ve velkých genomech analýzou sekvenčních značek genomového obohacení". Nat. Metody. 2 (1): 47–53. doi:10.1038 / nmeth726. PMID 15782160. S2CID 6135437.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Taylor TD, Noguchi H, Totoki Y a kol. (2006). „Sekvence DNA lidského chromozomu 11 a analýza včetně nové identifikace genu“. Příroda. 440 (7083): 497–500. Bibcode:2006 Natur.440..497T. doi:10.1038 / nature04632. PMID 16554811.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000176102 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027176 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7984242-5] Takagaki Y, Manley JL (prosinec 1994). „Podjednotka polyadenylačního faktoru je lidským homologem supresoru Drosophila vidlicového proteinu“. Příroda. 372 (6505): 471–4. Bibcode:1994 Natur.372..471T. doi:10.1038 / 372471a0. PMID 7984242. S2CID 4329672.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: CSTF3 štěpný stimulační faktor, 3 'pre-RNA, podjednotka 3, 77 kDa“.

[pmid10669729-7] Takagaki, Y; Manley J L (březen 2000). „Komplexní proteinové interakce v rámci lidského polyadenylačního aparátu identifikují novou složku. Mol. Buňka. Biol. 20 (5): 1515–25. doi:10.1128 / MCB.20.5.1515-1525.2000. ISSN 0270-7306. PMC 85326. PMID 10669729.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]