COX6A1 - COX6A1
Cytochrom c oxidáza podjednotka 6A1, mitochondriální je protein že u lidí je kódován COX6A1 gen. Cytochrom c oxidáza 6A1 je podjednotkou cytochromu C oxidázový komplex, také známý jako Komplex IV, poslední enzym v mitochondriální elektronový transportní řetězec. A mutace genu COX6A1 je spojen s a recesivní axonální nebo smíšená forma Charcot-Marie-Tooth nemoc.[5][6]
Struktura
Gen COX6A1, umístěný na rameni q chromozom 12 na pozici 24,2, obsahuje 3 exony a je 2 653 základní páry v délce.[5] Protein COX6A1 váží 12 kDa a skládá se ze 109 aminokyseliny.[7][8] Protein je podjednotkou Komplex IV, a heteromerní komplex skládající se ze 3 katalytických podjednotek kódovaných mitochondriální geny a více strukturních podjednotek kódovaných jadernými geny. Tento jaderný gen kóduje polypeptid 1 (jaterní izoformu) podjednotky VIa a polypeptid 1 se nachází ve všech nesvalových tkáních. Polypeptid 2 (izoforma srdce / sval) podjednotky VIa je kódován jiným genem, COX6A2, a je přítomen pouze v pruhované svaly. Tyto dva polypeptidy sdílejí 66% identitu aminokyselinové sekvence.[5]
Funkce
Cytochrom C oxidáza (COX) je terminálním enzymem mitochondriální dýchací řetězec. Jedná se o komplex více podjednotkových enzymů, který spojuje přenos elektronů z cytochromu C na molekulární kyslík a přispívá k protonovému elektrochemickému gradientu přes vnitřní mitochondriální membránu k řízení ATP syntéza prostřednictvím protonmotivní síla. Mitochondriálně kódované podjednotky provádějí elektronový přenos aktivit čerpání protonů. Funkce jaderně kódovaných podjednotek nejsou známy, ale mohou hrát roli v regulaci a sestavení komplexu.[5]
Souhrnná reakce:
- 4 Fe2+-cytochrom C + 8 hodin+v + O.2 → 4 Fe3+-cytochrom C + 2 H2O + 4 H+ven[9]
Klinický význam
A mutace což vede k deleci 5 bázových párů v genu COX6A1 Charcot-Marie-Tooth nemoc (CMT). CMT je nejčastější zděděná neuropatie a může být výsledkem mutací ve více než 30 různých lokusech. Exprese COX6A1 je významně snížena u postižených jedinců.[10]
The Trans-aktivátor transkripčního proteinu (Tat) z virus lidské imunodeficience (HIV) inhibuje cytochrom C aktivita oxidázy (COX) v permeabilizovaných mitochondriích izolovaných ze vzorků jater, srdce a mozku myší i lidských. Rychlá ztráta membránový potenciál (ΔΨm) dochází při submikromolárních dávkách Tat a cytochromu C se uvolňuje z mitochondrií.[11]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000111775 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041697 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b C d „Entrez Gene: COX6A1 cytochrom c oxidáza podjednotka VIa polypeptid 1“.
- ^ Hej Y, Hoggard N, Burt E, James LA, Varley JM (září 1997). "Přiřazení COX6A1 k 6p21 a pseudogenu (COX6A1P) k 1p31.1 hybridizací in situ a hybridy somatických buněk". Cytogenetika a genetika buněk. 77 (3–4): 167–8. doi:10.1159/000134565. PMID 9284905.
- ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
- ^ "Cytochrom c oxidáza podjednotka 6A1, mitochondriální". Srdeční organelární proteinová atlasová znalostní databáze (COPaKB). Archivovány od originál dne 2018-07-20. Citováno 2018-07-18.
- ^ Voet D, Voet JG, Pratt CW (2013). „Kapitola 18“. Základy biochemie: život na molekulární úrovni (4. vydání). Hoboken, NJ: Wiley. str. 581–620. ISBN 978-0-470-54784-7.
- ^ Tamiya G, Makino S, Hayashi M, Abe A, Numakura C, Ueki M, Tanaka A, Ito C, Toshimori K, Ogawa N, Terashima T, Maegawa H, Yanagisawa D, Tooyama I, Tada M, Onodera O, Hayasaka K (Září 2014). „Mutace COX6A1 způsobuje recesivní axonální nebo smíšenou formu Charcot-Marie-Toothovy choroby“. American Journal of Human Genetics. 95 (3): 294–300. doi:10.1016 / j.ajhg.2014.07.013. PMC 4157141. PMID 25152455.
- ^ Lecoeur H, Borgne-Sanchez A, Chaloin O, El-Khoury R, Brabant M, Langonné A, Porceddu M, Brière JJ, Buron N, Rebouillat D, Péchoux C, Deniaud A, Brenner C, Briand JP, Muller S, Rustin P, Jacotot E (2012). „Protein HIV-1 Tat přímo indukuje permeabilizaci mitochondriální membrány a inaktivuje cytochrom c oxidázu“. Buněčná smrt a nemoc. 3 (3): e282. doi:10.1038 / cddis.2012.21. PMC 3317353. PMID 22419111.
Další čtení
- Hochstrasser DF, Frutiger S, Paquet N, Bairoch A, Ravier F, Pasquali C, Sanchez JC, Tissot JD, Bjellqvist B, Vargas R (prosinec 1992). "Mapa lidských jaterních proteinů: referenční databáze vytvořená mikrosekvenováním a gelovým porovnáním". Elektroforéza. 13 (12): 992–1001. doi:10,1002 / elps.11501301201. PMID 1286669. S2CID 23518983.
- Fabrizi GM, Sadlock J, Hirano M, Mita S, Koga Y, Rizzuto R, Zeviani M, Schon EA (říjen 1992). "Diferenciální exprese genů specifikujících dvě izoformy podjednotky VIa lidské cytochrom c oxidázy". Gen. 119 (2): 307–12. doi:10.1016 / 0378-1119 (92) 90288-Z. PMID 1327966.
- Fabrizi GM, Rizzuto R, Nakase H, Mita S, Kadenbach B, Schon EA (srpen 1989). "Pořadí cDNA specifikující podjednotku VIa lidského cytochrom c oxidázy". Výzkum nukleových kyselin. 17 (15): 6409. doi:10.1093 / nar / 17.15.6409. PMC 318308. PMID 2549515.
- Schmidt TR, Jaradat SA, Goodman M, Lomax MI, Grossman LI (červen 1997). „Molekulární vývoj cytochrom c oxidázy: kolísání rychlosti mezi izoformami podjednotky VIa“. Molekulární biologie a evoluce. 14 (6): 595–601. doi:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a025798. PMID 9190060.
- Merante F, Ling M, Duncan AM, Duff C, Robinson BH (červen 1997). „Klonování, charakterizace a chromozomální lokalizace genů souvisejících s cytochrom c oxidázou podjednotky VIa v lidských játrech“. Genom. 40 (3): 325–31. doi:10.1139 / g97-045. PMID 9202413.
- Wong-Riley M, Guo A, Bachman NJ, Lomax MI (duben 2000). „Lidský gen COX6A1: analýza promotoru, izolace cDNA a exprese v opičím mozku“. Gen. 247 (1–2): 63–75. doi:10.1016 / S0378-1119 (00) 00121-9. PMID 10773445.
externí odkazy
- Hmotnostní spektrometrie charakterizace COX6A1 na COPaKB
- Člověk COX6A1 umístění genomu a COX6A1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
- Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P12074 (Podjednotka cytochrom c oxidázy 6A1, mitochondriální) na PDBe-KB.
Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.