COX5A - COX5A

COX5A
Identifikátory
Aliasy	COX5A, COX, COX-VA, VA, cytochrom c oxidáza podjednotka 5A
Externí ID	OMIM: 603773 MGI: 88474 HomoloGene: 37905 Genové karty: COX5A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 15 (lidský)
Konec	74,938,083 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	57,532,426 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita přenosu elektronů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • aktivita cytochrom-c oxidázy;
Buněčná složka	• myelin; • mitochondrie; • membrána; • mitochondriální vnitřní membrána; • komplex mitochondriálních dýchacích řetězců IV;
Biologický proces	• transmembránový transport vodíkových iontů; • transport mitochondriálních elektronů, cytochrom c na kyslík;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9377
	12858
	ENSG00000178741
	ENSMUSG00000000088
	P20674
	P12787
	NM_004255
	NM_007747
	NP_004246
	NP_031773
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Cytochrom C oxidázová podjednotka 5a je protein že u lidí je kódován COX5A gen. Cytochrom C oxidáza 5A je podjednotkou cytochrom c oxidáza komplex, také známý jako Komplex IV, poslední enzym v mitochondriální elektronový transportní řetězec.^[5]

Struktura

Gen COX5A, umístěný na rameni q chromozom 15 na pozici 24,1, je tvořen 5 exony a je dlouhý 17 880 párů bází.^[5] Protein COX5A váží 17 kDa a je složen ze 150 aminokyselin.^[6]^[7] Protein je podjednotkou Komplex IV, který se skládá z 13 podjednotek kódovaných mitochondrií a jader.^[5]

Funkce

Cytochrom C oxidáza (COX) je terminálním enzymem mitochondriální dýchací řetězec. Jedná se o komplex více podjednotkových enzymů, který spojuje přenos elektronů z cytochromu C na molekulární kyslík a přispívá k protonovému elektrochemickému gradientu přes vnitřní mitochondriální membránu k řízení syntézy ATP prostřednictvím protonmotivní síla. Mitochondriálně kódované podjednotky provádějí elektronový přenos aktivit čerpání protonů. Funkce jaderně kódovaných podjednotek nejsou známy, ale mohou hrát roli v regulaci a sestavení komplexu.^[5]

Souhrnná reakce:

4 Fe²⁺-cytochrom C + 8 hodin⁺_v + O.₂ → 4 Fe³⁺-cytochrom C + 2 H₂O + 4 H⁺_ven^[8]

Klinický význam

COX5A (tento gen) a COX5B podílejí se na regulaci metabolismu rakovinných buněk pomocí Bcl-2. COX5A interaguje specificky s Bcl-2, ale ne s jinými členy rodiny Bcl-2, jako je Bcl-xL, Bax nebo Bak.^[9]

The Trans-aktivátor transkripčního proteinu (Tat) z virus lidské imunodeficience (HIV) inhibuje cytochrom C aktivita oxidázy (COX) v permeabilizovaných mitochondriích izolovaných ze vzorků jater, srdce a mozku myší i lidských.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000178741 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000088 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C ^d „Entrez Gene: Cytochrome c oxidase subunit Va“.
^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
^ „Cytochrom C oxidázová podjednotka 5a ". Srdeční organelární proteinová atlasová znalostní databáze (COPaKB). Archivovány od originál dne 19. 7. 2018. Citováno 2018-07-18.
^ Voet D, Voet JG, Pratt CW (2013). „Kapitola 18“. Základy biochemie: život na molekulární úrovni (4. vydání). Hoboken, NJ: Wiley. str. 581–620. ISBN 978-0-470-54784-7.
^ Chen ZX, Pervaiz S (březen 2010). „Zapojení podjednotek Va a Vb cytochrom c oxidázy do regulace metabolismu rakovinných buněk pomocí Bcl-2“. Buněčná smrt a diferenciace. 17 (3): 408–20. doi:10.1038 / cdd.2009.132. PMID 19834492.
^ Lecoeur H, Borgne-Sanchez A, Chaloin O, El-Khoury R, Brabant M, Langonné A, Porceddu M, Brière JJ, Buron N, Rebouillat D, Péchoux C, Deniaud A, Brenner C, Briand JP, Muller S, Rustin P, Jacotot E (2012). „Protein HIV-1 Tat přímo indukuje permeabilizaci mitochondriální membrány a inaktivuje cytochrom c oxidázu“. Buněčná smrt a nemoc. 3 (3): e282. doi:10.1038 / cddis.2012.21. PMC 3317353. PMID 22419111.

Další čtení

Williams SL, Valnot I, Rustin P, Taanman JW (únor 2004). „Podskupiny cytochrom c oxidázy ve fibroblastových kulturách od pacientů nesoucích mutace v COX10, SCO1 nebo SURF1“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (9): 7462–9. doi:10,1074 / jbc.M309232200. PMID 14607829.
Hughes GJ, Frutiger S, Paquet N, Pasquali C, Sanchez JC, Tissot JD, Bairoch A, Appel RD, Hochstrasser DF (listopad 1993). "Mapa lidských jaterních proteinů: aktualizace 1993". Elektroforéza. 14 (11): 1216–22. doi:10,1002 / elps.11501401181. PMID 8313870.
Kovalyov LI, Shishkin SS, Efimochkin AS, Kovalyova MA, Ershova ES, Egorov TA, Musalyamov AK (červenec 1995). "Hlavní profil exprese proteinu a dvourozměrná proteinová databáze lidského srdce". Elektroforéza. 16 (7): 1160–9. doi:10,1002 / elps.11501601192. PMID 7498159.
Yano M, Ueta Y, Murasaki A, Kanda H, Oka C, Kawaichi M (srpen 2004). „Vazba proteinů na doménu PDZ reguluje proteolytickou aktivitu serinové proteázy HtrA1“. The Biochemical Journal. 381 (Pt 3): 895–904. doi:10.1042 / BJ20040435. PMC 1133901. PMID 15101818.
Hofmann S, Lichtner P, Schuffenhauer S, Gerbitz KD, Meitinger T (1998). „Přiřazení lidských genů kódujících podjednotky cytochrom c oxidázy Va (COX5A), VIc (COX6C) a VIIc (COX7C) chromozomovým pásmům 15q25, 8q22 -> q23 a 5q14 a tří pseudogenů (COX5AP1, COX6CP1, COX7CP1) na 14q22, 16p12 a 13q14 -> q21 pomocí FISH a radiačního hybridního mapování ". Cytogenetika a buněčná genetika. 83 (3–4): 226–7. doi:10.1159/000015185. PMID 10072584.
Cornelis MC, Monda KL, Yu K, Paynter N, Azzato EM, Bennett SN, Berndt SI, Boerwinkle E, Chanock S, Chatterjee N, Couper D, Curhan G, Heiss G, Hu FB, Hunter DJ, Jacobs K, Jensen MK , Kraft P, Landi MT, Nettleton JA, Purdue MP, Rajaraman P, Rimm EB, Rose LM, Rothman N, Silverman D, Stolzenberg-Solomon R, Subar A, Yeager M, Chasman DI, van Dam RM, Caporaso NE (duben 2011). „Celomanomová metaanalýza identifikuje regiony na 7p21 (AHR) a 15q24 (CYP1A2) jako determinanty obvyklé konzumace kofeinu“. Genetika PLOS. 7 (4): e1002033. doi:10.1371 / journal.pgen.1002033. PMC 3071630. PMID 21490707.
Rizzuto R, Nakase H, Zeviani M, DiMauro S, Schon EA (září 1988). „Podjednotka Va lidské a hovězí cytochrom c oxidázy je vysoce konzervativní“. Gen. 69 (2): 245–56. doi:10.1016/0378-1119(88)90435-0. PMID 2853101.

externí odkazy

Člověk COX5A umístění genomu a COX5A stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Hmotnostní spektrometrie charakterizace COX5A na COPaKB

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000178741 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000088 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b ^C ^d „Entrez Gene: Cytochrome c oxidase subunit Va“.

[COPaKB-6] Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (říjen 2013). „Integrace biologie a medicíny srdečních proteomů pomocí specializované znalostní databáze“. Výzkum oběhu. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.

[url_COPaKB-7] „Cytochrom C oxidázová podjednotka 5a ". Srdeční organelární proteinová atlasová znalostní databáze (COPaKB). Archivovány od originál dne 19. 7. 2018. Citováno 2018-07-18.

[Biochem-8] Voet D, Voet JG, Pratt CW (2013). „Kapitola 18“. Základy biochemie: život na molekulární úrovni (4. vydání). Hoboken, NJ: Wiley. str. 581–620. ISBN 978-0-470-54784-7.

[9] Chen ZX, Pervaiz S (březen 2010). „Zapojení podjednotek Va a Vb cytochrom c oxidázy do regulace metabolismu rakovinných buněk pomocí Bcl-2“. Buněčná smrt a diferenciace. 17 (3): 408–20. doi:10.1038 / cdd.2009.132. PMID 19834492.

[10] Lecoeur H, Borgne-Sanchez A, Chaloin O, El-Khoury R, Brabant M, Langonné A, Porceddu M, Brière JJ, Buron N, Rebouillat D, Péchoux C, Deniaud A, Brenner C, Briand JP, Muller S, Rustin P, Jacotot E (2012). „Protein HIV-1 Tat přímo indukuje permeabilizaci mitochondriální membrány a inaktivuje cytochrom c oxidázu“. Buněčná smrt a nemoc. 3 (3): e282. doi:10.1038 / cddis.2012.21. PMC 3317353. PMID 22419111.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]