KARTA 11 - CARD11

KARTA 11
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4JUP, 4LWD
Identifikátory
Aliasy	KARTA 11„BENTA, BIMP3, CARMA1, IMD11, PPBL, člen rodiny náborové domény kaspázy 11, IMD11A
Externí ID	OMIM: 607210 MGI: 1916978 HomoloGene: 13024 Genové karty: KARTA 11
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	3,043,945 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	141,000,582 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita guanylát kinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba domény CARD;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • membrána; • Komplex receptorů T buněk; • imunologická synapse; • membránový vor; • extracelulární exosom; • buněčná membrána; • Komplex CBM;
Biologický proces	• regulace apoptotického procesu; • pozitivní regulace produkce cytokinů; • Kostimulace T buněk; • stimulační signální dráha lektinového receptoru typu C; • Signální dráha receptoru Fc-epsilon; • pozitivní regulace aktivace T buněk; • pozitivní regulace proliferace B buněk; • pozitivní regulace proliferace T buněk; • regulace imunitní odpovědi; • pozitivní regulace signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • Signální dráha receptoru T buněk; • regulace diferenciace B buněk; • výběr thymických T buněk; • regulace diferenciace T buněk; • signální transdukce; • GMP metabolický proces; • pozitivní regulace aktivity transkripčního faktoru NF-kappaB; • GDP metabolický proces; • produkce imunoglobulinu; • Diferenciace B buněk; • Proliferace B buněk; • Aktivace T buněk; • aktivace lymfocytů; • homeostáza počtu buněk; • Signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • Signalizace TORC1;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	84433
	108723
	ENSG00000198286
	ENSMUSG00000036526
	Q9BXL7
	Q8CIS0
	NM_032415; NM_001324281
	NM_175362
	NP_001311210; NP_115791
	NP_780571
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Proteiny obsahující nábor kaspázových domén 11 také známý jako MAGUK protein obsahující KARTU 1 (Carma 1) je a protein v Rodina proteinů CARD-CC že u lidí je kódován KARTA 11 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem patří do rodiny guanylátkinázy asociované s membránou (MAGUK), což je třída proteinů, která funguje jako molekulární lešení pro montáž komplexů multiproteinů ve specializovaných oblastech plazmatické membrány. Tento protein je také členem rodiny proteinů CARD, která je definována nesením charakteristické náborové domény spojené s kaspázou (KARTU ). Tento protein má doménovou strukturu podobnou struktuře KARTA 14 protein. Ukázalo se, že CARD domény obou proteinů specificky interagují BCL10 protein známý jako pozitivní regulátor buněčné apoptózy a NF-kB aktivace. Pokud je tento protein exprimován v buňkách, aktivuje NF-kB a indukuje fosforylace BCL10.^[7]

Interakce

KARTA 11 byla prokázána komunikovat s BCL10.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198286 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000036526 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Bertin J, Wang L, Guo Y, Jacobson MD, Poyet JL, Srinivasula SM, Merriam S, DiStefano PS, Alnemri ES (duben 2001). „CARD11 a CARD14 jsou nové členy rodiny kaspázových náborových domén (CARD) / membránově asociovaných guanylátkinázových (MAGUK), které interagují s BCL10 a aktivují NF-kappa B“. J. Biol. Chem. 276 (15): 11877–82. doi:10,1074 / jbc.M010512200. PMID 11278692. S2CID 35815019.
^ Gaide O, Martinon F, Micheau O, Bonnet D, Thome M, Tschopp J (květen 2001). „Carma1, vazebný partner Bcl10 obsahující CARD, indukuje fosforylaci Bcl10 a aktivaci NF-kappaB“. FEBS Lett. 496 (2–3): 121–7. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 02414-0. PMID 11356195. S2CID 22024213.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CARD11 caspase recruitment domain family, member 11“.
^ Bertin J, Wang L, Guo Y, Jacobson MD, Poyet JL, Srinivasula SM, Merriam S, DiStefano PS, Alnemri ES (duben 2001). „CARD11 a CARD14 jsou nové členy rodiny kaspázových náborových domén (CARD) / membránově asociovaných guanylátkinázových (MAGUK), které interagují s BCL10 a aktivují NF-kappa B“. J. Biol. Chem. 276 (15): 11877–82. doi:10,1074 / jbc.M010512200. PMID 11278692. S2CID 35815019.

externí odkazy

Člověk KARTA 11 umístění genomu a KARTA 11 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S, Dietrich N, DuBuque T, Favello A, Gish W, Hawkins M, Hultman M, Kucaba T, Lacy M, Le M, Le N, Mardis E Moore B, Morris M, Parsons J, Prange C, Rifkin L, Rohlfing T, Schellenberg K, Bento Soares M, Tan F, Thierry-Meg J, Trevaskis E, Underwood K, Wohldman P, Waterston R, Wilson R, Marra M (1996). „Generování a analýza 280 000 lidských sekvenčních značek“. Genome Res. 6 (9): 807–28. doi:10,1101 / gr. 6.807. PMID 8889549.
Sanger Center, The; Washington University Genome Sequencing Cente, The (1998). „Směrem k úplné sekvenci lidského genomu“. Genome Res. 8 (11): 1097–108. doi:10.1101 / gr.8.11.1097. PMID 9847074.
Wang L, Guo Y, Huang WJ, Ke X, Poyet JL, Manji GA, Merriam S, Glucksmann MA, DiStefano PS, Alnemri ES, Bertin J (2001). „Card10 je nový člen rodiny guanylátkinázových náborových domén asociovaných s membránou, který interaguje s BCL10 a aktivuje NF-kappa B“. J. Biol. Chem. 276 (24): 21405–9. doi:10,1074 / jbc.M102488200. PMID 11259443.
Wang D, You Y, Case SM, McAllister-Lucas LM, Wang L, DiStefano PS, Nuñez G, Bertin J, Lin X (2002). "Požadavek na CARMA1 při aktivaci NF-kappa B vyvolané TCR". Nat. Immunol. 3 (9): 830–5. doi:10.1038 / ni824. PMID 12154356. S2CID 19250072.
Gaide O, Favier B, Legler DF, Bonnet D, Brissoni B, Valitutti S, Bron C, Tschopp J, Thome M (2002). „CARMA1 je kritický regulátor spojený s lipidovým vorem aktivace NF-kappa B vyvolané TCR“. Nat. Immunol. 3 (9): 836–43. doi:10.1038 / ni830. PMID 12154360. S2CID 42949809.
Pomerantz JL, Denny EM, Baltimore D (2002). „CARD11 zprostředkovává faktorově specifickou aktivaci NF-kappaB komplexem receptorů T buněk“. EMBO J.. 21 (19): 5184–94. doi:10.1093 / emboj / cdf505. PMC 129028. PMID 12356734.
Wang D, Matsumoto R, You Y, Che T, Lin XY, Gaffen SL, Lin X (2004). „Aktivace NF-kappaB vyvolaná kostimulací CD3 / CD28 je zprostředkována náborem proteinkinázy C-theta, Bcl10 a IkappaB kinázy beta do imunologické synapse prostřednictvím CARMA1“. Mol. Buňka. Biol. 24 (1): 164–71. doi:10.1128 / MCB.24.1.164-171.2003. PMC 303359. PMID 14673152.
Stilo R, Liguoro D, Di Jeso B, Formisano S, Consiglio E, Leonardi A, Vito P (2004). „Fyzická a funkční interakce CARMA1 a CARMA3 s esenciálním modulátorem Ikappa kinázy gamma-NFkappaB“. J. Biol. Chem. 279 (33): 34323–31. doi:10,1074 / jbc.M402244200. PMID 15184390.
Lee KY, D'Acquisto F, Hayden MS, Shim JH, Ghosh S (2005). „PDK1 nukleaty T-buněčným receptorem indukovaný signální komplex pro aktivaci NF-kappaB“. Věda. 308 (5718): 114–8. Bibcode:2005Sci ... 308..114L. doi:10.1126 / science.1107107. PMID 15802604. S2CID 84389997.
Shinohara H, Yasuda T, Aiba Y, Sanjo H, Hamadate M, Watarai H, Sakurai H, Kurosaki T (2005). „PKC beta reguluje aktivaci IKK zprostředkovanou BCR usnadněním interakce mezi TAK1 a CARMA1“. J. Exp. Med. 202 (10): 1423–31. doi:10.1084 / jem.20051591. PMC 2212994. PMID 16301747.
Sommer K, Guo B, Pomerantz JL, Bandaranayake AD, Moreno-García ME, Ovechkina YL, Rawlings DJ (2005). "Fosforylace linkeru CARMA1 řídí aktivaci NF-kappaB". Imunita. 23 (6): 561–74. doi:10.1016 / j.immuni.2005.09.014. PMID 16356855.
Matsumoto R, Wang D, Blonska M, Li H, Kobayashi M, Pappu B, Chen Y, Wang D, Lin X (2005). „Fosforylace CARMA1 hraje klíčovou roli při aktivaci NF-kappaB zprostředkované T-buňkami“. Imunita. 23 (6): 575–85. doi:10.1016 / j.immuni.2005.10.007. PMID 16356856.
Narayan P, Holt B, Tosti R, Kane LP (2006). „CARMA1 je vyžadován pro aktivaci NF-kappaB zprostředkovanou Akt v T buňkách“. Mol. Buňka. Biol. 26 (6): 2327–36. doi:10.1128 / MCB.26.6.2327-2336.2006. PMC 1430296. PMID 16508008.
Ishiguro K, Avruch J, Landry A, Qin S, Ando T, Goto H, Xavier R (2006). „Nore1B reguluje TCR signalizaci přes Ras a Carma1“. Buňka. Signál. 18 (10): 1647–54. doi:10.1016 / j.cellsig.2006.01.015. PMC 3204664. PMID 16520020.
Ishiguro K, Green T, Rapley J, Wachtel H, Giallourakis C, Landry A, Cao Z, Lu N, Takafumi A, Goto H, Daly MJ, Xavier RJ (2006). „Ca2 + / kalmodulin-dependentní protein kináza II je modulátor aktivace NF-kappaB zprostředkované CARMA1“. Mol. Buňka. Biol. 26 (14): 5497–508. doi:10.1128 / MCB.02469-05. PMC 1592706. PMID 16809782.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198286 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000036526 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11278692-5] Bertin J, Wang L, Guo Y, Jacobson MD, Poyet JL, Srinivasula SM, Merriam S, DiStefano PS, Alnemri ES (duben 2001). „CARD11 a CARD14 jsou nové členy rodiny kaspázových náborových domén (CARD) / membránově asociovaných guanylátkinázových (MAGUK), které interagují s BCL10 a aktivují NF-kappa B“. J. Biol. Chem. 276 (15): 11877–82. doi:10,1074 / jbc.M010512200. PMID 11278692. S2CID 35815019.

[pmid11356195-6] Gaide O, Martinon F, Micheau O, Bonnet D, Thome M, Tschopp J (květen 2001). „Carma1, vazebný partner Bcl10 obsahující CARD, indukuje fosforylaci Bcl10 a aktivaci NF-kappaB“. FEBS Lett. 496 (2–3): 121–7. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 02414-0. PMID 11356195. S2CID 22024213.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: CARD11 caspase recruitment domain family, member 11“.

[autogenerated1-8] Bertin J, Wang L, Guo Y, Jacobson MD, Poyet JL, Srinivasula SM, Merriam S, DiStefano PS, Alnemri ES (duben 2001). „CARD11 a CARD14 jsou nové členy rodiny kaspázových náborových domén (CARD) / membránově asociovaných guanylátkinázových (MAGUK), které interagují s BCL10 a aktivují NF-kappa B“. J. Biol. Chem. 276 (15): 11877–82. doi:10,1074 / jbc.M010512200. PMID 11278692. S2CID 35815019.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]