ARDB - ARDB

Databáze genů rezistence na antibiotika
Obsah
PopisDatabáze, která sleduje geny rezistence na antibiotika.
Typy dat
zajat
Geny pro rezistenci na antibiotika
OrganismyBakterie
Kontakt
Primární citacePMID  18832362
Přístup
webová stránkaardb.cbcb.umd.edu
Smíšený
Bookmarkable
subjekty
Ano

ARDB také známý jako Databáze genů rezistence na antibiotika je databáze který sleduje odolnost proti antibiotikům geny s informacemi jako např mechanismus účinku, odporový profil, ontologie Klastry ortologních genů (COG) a Databáze chráněných domén (CDD) anotace.[1] Obsahuje také odkazy na externí databáze. Databáze slouží také k identifikaci nových geny rezistence. Během vytváření ARDB v roce 2009 nebyl k dispozici žádný komplexní systém anotací. Tím pádem, ontologie termíny pro profily odporu a mechanismy akcí byly vytvořeny pro ARDB. Ostatní věci klasifikované podle ontologie zahrnují modifikaci cíle léčiva, enzymatickou destrukci léčiva a transport drog.[1] Transportéry drog jsou dále subklasifikovány podle Čerpadla MFS Efflux, Čerpadla SMR Efflux, Čerpadla ABC Efflux, RND Efflux čerpadla následující konvence uvedené v tomto článku.[2] V současné době ARDB obsahuje informace o odporu 13 293 geny, 377 typů, 257 antibiotika, 632 genomy, 933 druh a 124 rody.

Viz také

Reference

  1. ^ A b Liu, B .; Pop, M. (01.01.2009). „ARDB - databáze genů rezistence na antibiotika“. Výzkum nukleových kyselin. 37 (Databáze): D443 – D447. doi:10.1093 / nar / gkn656. ISSN  0305-1048. PMC  2686595. PMID  18832362.
  2. ^ Higgins, Christopher F. (duben 2007). "Více molekulárních mechanismů pro transportéry rezistence k více lékům". Příroda. 446 (7137): 749–757. Bibcode:2007 Natur.446..749H. doi:10.1038 / nature05630. ISSN  0028-0836. PMID  17429392.