ARDB - ARDB
Obsah | |
---|---|
Popis | Databáze, která sleduje geny rezistence na antibiotika. |
Typy dat zajat | Geny pro rezistenci na antibiotika |
Organismy | Bakterie |
Kontakt | |
Primární citace | PMID 18832362 |
Přístup | |
webová stránka | ardb |
Smíšený | |
Bookmarkable subjekty | Ano |
ARDB také známý jako Databáze genů rezistence na antibiotika je databáze který sleduje odolnost proti antibiotikům geny s informacemi jako např mechanismus účinku, odporový profil, ontologie Klastry ortologních genů (COG) a Databáze chráněných domén (CDD) anotace.[1] Obsahuje také odkazy na externí databáze. Databáze slouží také k identifikaci nových geny rezistence. Během vytváření ARDB v roce 2009 nebyl k dispozici žádný komplexní systém anotací. Tím pádem, ontologie termíny pro profily odporu a mechanismy akcí byly vytvořeny pro ARDB. Ostatní věci klasifikované podle ontologie zahrnují modifikaci cíle léčiva, enzymatickou destrukci léčiva a transport drog.[1] Transportéry drog jsou dále subklasifikovány podle Čerpadla MFS Efflux, Čerpadla SMR Efflux, Čerpadla ABC Efflux, RND Efflux čerpadla následující konvence uvedené v tomto článku.[2] V současné době ARDB obsahuje informace o odporu 13 293 geny, 377 typů, 257 antibiotika, 632 genomy, 933 druh a 124 rody.
Viz také
Reference
- ^ A b Liu, B .; Pop, M. (01.01.2009). „ARDB - databáze genů rezistence na antibiotika“. Výzkum nukleových kyselin. 37 (Databáze): D443 – D447. doi:10.1093 / nar / gkn656. ISSN 0305-1048. PMC 2686595. PMID 18832362.
- ^ Higgins, Christopher F. (duben 2007). "Více molekulárních mechanismů pro transportéry rezistence k více lékům". Příroda. 446 (7137): 749–757. Bibcode:2007 Natur.446..749H. doi:10.1038 / nature05630. ISSN 0028-0836. PMID 17429392.