APLP2 - APLP2

APLP2
Identifikátory
AliasyAPLP2, APLP-2, APPH, APPL2, CDEBP, prekurzor amyloid beta jako protein 2
Externí IDOMIM: 104776 MGI: 88047 HomoloGene: 20396 Genové karty: APLP2
Umístění genu (člověk)
Chromozom 11 (lidský)
Chr.Chromozom 11 (lidský)[1]
Chromozom 11 (lidský)
Genomická poloha pro APLP2
Genomická poloha pro APLP2
Kapela11q24.3Start130,068,147 bp[1]
Konec130,144,811 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE APLP2 208702 x na fs.png

PBB GE APLP2 208703 s na fs.png

PBB GE APLP2 208248 x na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

334

11804

Ensembl

ENSG00000084234

ENSMUSG00000031996

UniProt

Q06481

Q06335

RefSeq (mRNA)

NM_001102455
NM_001102456
NM_009691
NM_001357698

RefSeq (protein)

NP_001095925
NP_001095926
NP_033821
NP_001344627

Místo (UCSC)Chr 11: 130,07 - 130,14 MbChr 9: 31,15 - 31,21 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Amyloidový protein 2, také známý jako APLP2, je protein že u lidí je kódován APLP2 gen.[5][6] APLP2 spolu s APLP1 jsou důležitými modulátory glukóza a inzulín homeostáza.[7]

Poloha genu

Člověk APLP2 Gen se nachází na dlouhém (q) rameni chromozom 11 v oblasti 2 pásmo 4, od základní pár 130, 069, 821 na pár bází 130, 144, 811 (GRCh38.p7).[5]

Struktura bílkovin

APLP2 se skládá z 763 aminokyseliny, s 31 aminokyselinami tvořícími signální peptid a 732 aminokyselin tvořících řetězec proteinu.[8]

Extracelulární doména

Extracelulární doména (zbytky 32-692) obsahuje doménu El, doménu E2 a doménu inhibitoru BPTI / Kunitz.[8][9] Doména E1 obsahuje dvě nezávislé skládací jednotky, doména podobná růstovému faktoru (GFLD) a doména vázající měď (CuBD).[9] GFLD má vysoce nabitý základní povrch a vysoce flexibilní oblast skládající se z N-koncové smyčky tvořené disulfidovým můstkem.[9] CuBD se skládá z alfa-šroubovice který je pevně zabalen na trojvláknovém lanku beta-list.[9]

Doména E2 je největší subdoménou APLP2 a skládá se ze šesti alfa-šroubovic.[9] The N-terminál dvouvláknová svinutá cívková struktura prvního monomeru E2 se balí proti C-terminál trojvláknová stočená cívková struktura druhého monomeru.[9]

Doména inhibitoru BPTI / Kunitz (zbytky 306-364)[8] je „bohatý na Cys“ a je schopen některé inhibovat proteázy.[10]

The ektodoména APLP2 je dimerní a obsahuje více vazebných míst pro ionty kovů a složky extracelulární matrice.[9] Tato vazebná místa mohou vázat měď, zinek, kolagen a heparan sulfát.[9]

Transmembránová oblast

Transmembránová oblast APLP2 (zbytky 693-716) je spirálovitý ve struktuře.[8]

Cytoplazmatická doména

Cytoplazmatická doména (žije 717-763)[8] obsahuje sekvenci YENPTY naznačující funkci duelu domény.[9] Motiv NPxY může fungovat jako signál pro endocytóza nebo sekvence může fungovat tak, že zprostředkovává vazbu různých interaktivních partnerů.[9]

Funkce

APLP2 se asociuje s molekulami prezentace antigenu jako MHC třída I molekul a reguluje jejich povrchovou expresi zesílením endocytóza.[11][12]

APLP1 a APLP2 dvojnásobné knockout myši Zobrazit hypoglykémie a hyperinzulinémie což naznačuje, že tyto dva proteiny jsou důležitými modulátory homeostázy glukózy a inzulínu.[7] Bylo také prokázáno, že APLP2 reguluje vývoj mozku regulací migrace a diferenciace nervových kmenových buněk.[13]

Dvojité myši vyřazují APLP2 a jeho homology, APLIKACE a APLP1 prokázaly silnou indikaci, že APLP2 má mezi členy rodiny klíčovou fyziologickou roli.[14] APLP2 / APP myši s dvojitým knock-outem a APLP2 / APLP1 myši s dvojitým knock-outem vykazují každá letální fenotyp (den 1 po narození), zatímco myši APLP1 / APP s dvojitým knock-outem jsou zjevně normální, což dokazuje důležitost proteinu APLP2.[14]

APLP2 hraje roli v synaptická plasticita, fungující na podporu růstu neuritů, migrace nervových buněk a homeostázy mědi.[14] Analýza neuronů a sítí APP / APLP2 dvojitých knock-out myší pomocí neuronů odvozených z kmenových buněk a kultur řezů ukazuje nedostatečné excitační synaptický přenos v tomto genotypu.[15] Kromě toho bylo prokázáno, že APLP2 spolu s APP vykazují presynaptické a postsynaptické funkce v synaptogeneze a údržba synapsí.[16]

Ukázalo se, že APLP2 působí jako receptor nákladu v axonálním transportu intaktních proteinů.[17]

Klinický význam

APLP2 je součástí rodiny savců membránové proteiny spolu s APLP1 a amyloidový prekurzorový protein (APLIKACE).[18] Protože APP hraje klíčovou roli v molekulární patologii Alzheimerova choroba (AD), předpokládá se, že APLP2 také hraje roli v AD patogeneze.[19] Ukázalo se, že amyloidový β peptid (Ap), který je přítomen na APP, způsobuje neurotoxický účinky vedoucí k AD.[20] Ačkoli sekvence Ap není na APLP2 přítomna, bylo navrženo, aby APLP2 a APP sdílely a funkční redundance přičemž oba proteiny spolu vzájemně působí, aby vykazovaly fyziologické funkce spojené s tvorbou synapsí.[19]

Interakce

APLP2 bylo prokázáno komunikovat s APBB1.[21][22]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000084234 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031996 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b „Entrez Gene: APLP2 amyloid beta (A4) prekurzor podobný protein 2“.
  6. ^ Leach R, Ko M, Krawetz SA (1999). „Přiřazení genu proteinu 2 podobného amyloidovému prekurzoru (APLP2) k 11q24 fluorescenční in situ hybridizací“. Cytogenetika a genetika buněk. 87 (3–4): 215–6. doi:10.1159/000015472. PMID  10702673. S2CID  39798007.
  7. ^ A b Needham BE, Wlodek ME, Ciccotosto GD, Fam BC, Masters CL, Proietto J, Andrikopoulos S, Cappai R (červen 2008). „Identifikace proteinu amyloidního prekurzoru Alzheimerovy choroby (APP) a jeho homologu APLP2 jako základních modulátorů homeostázy a růstu glukózy a inzulínu“. The Journal of Pathology. 215 (2): 155–63. doi:10,1002 / cesta 2343. PMID  18393365. S2CID  1064378.
  8. ^ A b C d E „APLP2 - prekurzor proteinu podobného amyloidu 2 - Homo sapiens (člověk) - gen a protein APLP2“. www.uniprot.org. Citováno 2016-10-03.
  9. ^ A b C d E F G h i j Kaden D, Munter LM, Reif B, Multhaup G (duben 2012). „Protein prekurzoru amyloidu a jeho homology: strukturní a funkční aspekty nativní a patogenní oligomerizace“. European Journal of Cell Biology. 91 (4): 234–9. doi:10.1016 / j.ejcb.2011.01.017. PMID  21459473.
  10. ^ Petersen LC, Bjørn SE, Norris F, Norris K, Sprecher C, Foster DC (leden 1994). "Exprese, čištění a charakterizace domény inhibitoru proteázy Kunitzova typu z homologu proteinu lidského prekurzoru amyloidního proteinu". FEBS Dopisy. 338 (1): 53–7. doi:10.1016/0014-5793(94)80115-0. PMID  8307156. S2CID  31738626.
  11. ^ Tuli A, Sharma M, Naslavsky N, Caplan S, Solheim JC (červen 2008). „Specifičnost interakcí amyloidového prekurzorového proteinu 2 s molekulami MHC třídy I“. Imunogenetika. 60 (6): 303–13. doi:10.1007 / s00251-008-0296-0. PMC  2683759. PMID  18452037.
  12. ^ Tuli A, Sharma M, McIlhaney MM, Talmadge JE, Naslavsky N, Caplan S, Solheim JC (srpen 2008). „Amyloidový prekurzorový protein 2 zvyšuje endocytózu, nestabilitu a obrat molekuly H2-K (d) MHC třídy I“. Journal of Immunology. 181 (3): 1978–87. doi:10,4049 / jimmunol.181.3.1978. PMC  2607064. PMID  18641335.
  13. ^ Shariati SA, Lau P, Hassan BA, Müller U, Dotti CG, De Strooper B, Gärtner A (březen 2013). „APLP2 reguluje diferenciaci neuronálních kmenových buněk během kortikálního vývoje“. Journal of Cell Science. 126 (Pt 5): 1268–77. doi:10.1242 / jcs.122440. PMID  23345401.
  14. ^ A b C Walsh DM, Minogue AM, Sala Frigerio C, Fadeeva JV, Wasco W, Selkoe DJ (duben 2007). "Rodina proteinů APP: podobnosti a rozdíly". Transakce biochemické společnosti. 35 (Pt 2): 416–20. doi:10.1042 / BST0350416. PMID  17371289.
  15. ^ Schrenk-Siemens K, Perez-Alcala S, Richter J, Lacroix E, Rahuel J, Korte M, Müller U, Barde YA, Bibel M (srpen 2008). „Neurony odvozené od embryonálních kmenových buněk jako buněčný systém ke studiu funkce genů: nedostatek amyloidních prekurzorových proteinů APP a APLP2 vede k defektnímu synaptickému přenosu“. Kmenové buňky. 26 (8): 2153–63. doi:10.1634 / kmenové články. 2008-0010. PMID  18535156. S2CID  207240922.
  16. ^ Wang Z, Wang B, Yang L, Guo Q, Aithmitti N, Songyang Z, Zheng H (září 2009). „Presynaptická a postsynaptická interakce amyloidního prekurzorového proteinu podporuje periferní a centrální synaptogenezi“. The Journal of Neuroscience. 29 (35): 10788–801. doi:10.1523 / JNEUROSCI.2132-09.2009. PMC  2757256. PMID  19726636.
  17. ^ Müller U, Kins S (2002). "APP v pohybu". Trendy v molekulární medicíně. 8 (4): 152–5. doi:10.1016 / S1471-4914 (02) 02320-1. PMID  11927267.
  18. ^ Korte M, Herrmann U, Zhang X, Draguhn A (duben 2012). "Role APP a APLP pro synaptický přenos, plasticitu a síťové funkce: lekce z genetických modelů myší". Experimentální výzkum mozku. 217 (3–4): 435–40. doi:10.1007 / s00221-011-2894-6. PMID  22006270. S2CID  11886993.
  19. ^ A b Midthune B, Tyan SH, Walsh JJ, Sarsoza F, Eggert S, Hof PR, Dickstein DL, Koo EH (duben 2012). „Odstranění amyloidového prekurzorového proteinu 2 (APLP2) nemá vliv na morfologii nebo funkci hipokampálního neuronu.“. Molekulární a buněčné neurovědy. 49 (4): 448–55. doi:10.1016 / j.mcn.2012.02.001. PMC  3348437. PMID  22353605.
  20. ^ Hardy J, Selkoe DJ (červenec 2002). „Amyloidová hypotéza Alzheimerovy choroby: pokrok a problémy na cestě k terapeutikám“. Věda. 297 (5580): 353–6. doi:10.1126 / science.1072994. PMID  12130773. S2CID  15150253.
  21. ^ Guénette SY, Chen J, Jondro PD, Tanzi RE (říjen 1996). „Sdružení nového lidského proteinu podobného FE65 s cytoplazmatickou doménou proteinu prekurzoru beta-amyloidu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (20): 10832–7. doi:10.1073 / pnas.93.20.10832. PMC  38241. PMID  8855266.
  22. ^ Tanahashi H, Tabira T (únor 1999). „Molekulární klonování lidského Fe65L2 a jeho interakce s Alzheimerovým beta-amyloidovým prekurzorovým proteinem“. Neurovědy Dopisy. 261 (3): 143–6. doi:10.1016 / S0304-3940 (98) 00995-1. PMID  10081969. S2CID  54307954.

externí odkazy