WWP1 - WWP1
NEDD4 podobná E3 ubikvitin-protein ligáza WWP1 je enzym že u lidí je kódován WWP1 gen.[5][6][7]
Funkce
Proteiny obsahující WW doménu se nacházejí ve všech eukaryotech a hrají důležitou roli při regulaci široké škály buněčných funkcí, jako je degradace proteinu, transkripce a sestřih RNA. Tento gen kóduje protein, který obsahuje 4 tandemové WW domény a doménu HECT (homologní s E6-asociovaným proteinovým karboxylovým koncem). Kódovaný protein patří do rodiny proteinů podobných NEDD4, kterými jsou molekuly ubikvitin-ligázy E3 a regulují klíčová rozhodnutí o obchodování, včetně cílení proteinů na proteosomy nebo lysozomy. Alternativní sestřih tohoto genu generuje alespoň 6 variant transkriptu; úplná povaha těchto přepisů však nebyla definována.[7] V neuronech myší ortolog Wwp1 a jeho homolog Wwp2 řídí získávání polarity, formování a větvení axonů, stejně jako migraci nově narozených nervových buněk do kortikální desky.[8]
Interakce
WWP1 bylo prokázáno komunikovat s:
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000123124 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000041058 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Pirozzi G, McConnell SJ, Uveges AJ, Carter JM, Sparks AB, Kay BK, Fowlkes DM (červen 1997). "Identifikace nových proteinů obsahujících lidskou WW doménu klonováním ligandových cílů". J Biol Chem. 272 (23): 14611–6. doi:10.1074 / jbc.272.23.14611. PMID 9169421.
- ^ Wood JD, Yuan J, Margolis RL, Colomer V, Duan K, Kushi J, Kaminsky Z, Kleiderlein JJ, Sharp AH, Ross CA (červenec 1998). „Atrophin-1, produkt genu DRPLA, interaguje se dvěma rodinami proteinů obsahujících WW doménu“. Mol Cell Neurosci. 11 (3): 149–60. doi:10,1006 / mcne.1998.0677. PMID 9647693. S2CID 20003277.
- ^ A b „Entrez Gene: WWP1 WW doména obsahující E3 ubikvitinovou proteinovou ligázu 1“.
- ^ Ambrozkiewicz MC, Schwark M, Kishimoto-Suga M, Borisova E, Hori K, Salazar-Lázaro A, Rusanova A, Altas B, Piepkorn L, Bessa P, Schaub T, Zhang X, Rabe T, Ripamonti S, Rosário M, Akiyama H, Jahn O, Kobayashi T, Hoshino M, Tarabykin V, Kawabe H (prosinec 2018). „Získávání polarity u kortikálních neuronů je poháněno synergickým účinkem ubikvitinových ligas regulovaných na Sox9 a Wwp2 E3 a intronické miR-140“. Neuron. 100 (5): 1097–1115.e15. doi:10.1016 / j.neuron.2018.10.008. PMID 30392800.
- ^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- ^ Conkright MD, Wani MA, Lingrel JB (srpen 2001). „Fung podobný faktoru Lung Krüppel obsahuje autoinhibiční doménu, která reguluje její transkripční aktivaci vazbou WWP1, ubikvitin ligázy E3“. J. Biol. Chem. 276 (31): 29299–306. doi:10,1074 / jbc.M103670200. PMID 11375995.
- ^ Qin H, Pu HX, Li M, Ahmed S, Song J (prosinec 2008). "Identifikace a strukturální mechanismus pro novou interakci mezi ubikvitin ligázou WWP1 a Nogo-A, klíčovým inhibitorem regenerace centrálního nervového systému". Biochemie. 47 (51): 13647–58. doi:10.1021 / bi8017976. PMID 19035836.
Další čtení
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
- Mosser EA, Kasanov JD, Forsberg EC, Kay BK, Ney PA, Bresnick EH (1998). "Fyzické a funkční interakce mezi transaktivační doménou hematopoetického transkripčního faktoru NF-E2 a WW doménami". Biochemie. 37 (39): 13686–95. doi:10.1021 / bi981310l. PMID 9753456.
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
- Conkright MD, Wani MA, Lingrel JB (2001). „Fung podobný faktoru Lung Krüppel obsahuje autoinhibiční doménu, která reguluje její transkripční aktivaci vazbou na WWP1, ubikvitinovou ligázu E3“. J. Biol. Chem. 276 (31): 29299–306. doi:10,1074 / jbc.M103670200. PMID 11375995.
- Flasza M, Gorman P, Roylance R, Canfield AE, Baron M (2002). „Alternativní sestřih určuje strukturu domény WWP1, proteinu rodiny Nedd4“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 290 (1): 431–7. doi:10.1006 / bbrc.2001.6206. PMID 11779188.
- Galinier R, Dna E, Lortat-Jacob H, Wood J, Chroboczek J (2003). „Adenovirový protein zapojený do internalizace viru získává ubikvitin-proteinové ligázy“. Biochemie. 41 (48): 14299–305. doi:10.1021 / bi020125b. PMID 12450395.
- Verdecia MA, Joazeiro CA, Wells NJ, Ferrer JL, Bowman ME, Hunter T, Noel JP (2003). "Konformační flexibilita je základem ligace ubikvitinu zprostředkovaná ligázou E3 ligandy HECT domény WWP1". Mol. Buňka. 11 (1): 249–59. doi:10.1016 / S1097-2765 (02) 00774-8. PMID 12535537.
- Komuro A, Imamura T, Saitoh M, Yoshida Y, Yamori T, Miyazono K, Miyazawa K (2004). "Negativní regulace signalizace transformujícího růstového faktoru beta (TGF-beta) proteinem 1 obsahujícím doménu WW (WWP1)". Onkogen. 23 (41): 6914–23. doi:10.1038 / sj.onc.1207885. PMID 15221015. S2CID 7742985.
- Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
- Seo SR, Lallemand F, Ferrand N, Pessah M, L'Hoste S, Camonis J, Atfi A (2005). „Nová E3 ubikvitinová ligáza Tiul1 se asociuje s TGIF a cílí na degradaci Smad2“. EMBO J.. 23 (19): 3780–92. doi:10.1038 / sj.emboj.7600398. PMC 522797. PMID 15359284.
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Chen C, Sun X, Guo P, Dong XY, Sethi P, Cheng X, Zhou J, Ling J, Simons JW, Lingrel JB, Dong JT (2006). „Faktor 5 podobný lidskému Kruppel je terčem E3 ubikvitin ligázy WWP1 pro proteolýzu v epitelových buňkách“. J. Biol. Chem. 280 (50): 41553–61. doi:10,1074 / jbc.M506183200. PMID 16223724.
- Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.
- Flasza M, Nguyen Huu NS, Mazaleyrat S, Clémence S, Villemant C, Clarke R, Baron M (2006). „Regulace nukleární lokalizace lidského proteinu WWP1 souvisejícího s Nedd4 Notchem“. Mol. Membr. Biol. 23 (3): 269–76. doi:10.1080/09687860600665010. PMID 16785210. S2CID 913524.
- Laine A, Ronai Z (2007). „Regulace lokalizace a transkripce p53 pomocí E3 ligázy WWP1 domény HECT“. Onkogen. 26 (10): 1477–83. doi:10.1038 / sj.onc.1209924. PMC 2997392. PMID 16924229.
- Chen C, Sun X, Guo P, Dong XY, Sethi P, Zhou W, Zhou Z, Petros J, Frierson HF, Vessella RL, Atfi A, Dong JT (2007). „Ubikvitin E3 ligáza WWP1 jako onkogenní faktor u lidské rakoviny prostaty“. Onkogen. 26 (16): 2386–94. doi:10.1038 / sj.onc.1210021. PMID 17016436. S2CID 24487179.