CPSF6 - CPSF6
Podjednotka faktoru štěpnosti a polyadenylační specificity 6 je protein že u lidí je kódován CPSF6 gen.[5][6][7]
Funkce
Protein kódovaný tímto genem je jednou podjednotkou štěpícího faktoru požadovaného pro štěpení 3 'RNA a zpracování polyadenylace. Interakce proteinu s RNA je jedním z prvních kroků při sestavování komplexu zpracování na 3 'konci a usnadňuje nábor dalších faktorů zpracování. Komplex štěpného faktoru se skládá ze čtyř polypeptidů. Tento gen kóduje 68kD podjednotku. Má doménovou organizaci připomínající spliceozomální proteiny.[7]
Interakce
Bylo prokázáno, že CPSF6 komunikovat s WWP1[8] a PLSCR1.[8]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000111605 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000055531 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Rüegsegger U, Blank D, Keller W (leden 1998). „Faktor štěpení lidského pre-mRNA Im souvisí se spliceozomálními SR proteiny a může být rekonstituován in vitro z rekombinantních podjednotek“. Molekulární buňka. 1 (2): 243–53. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80025-8. PMID 9659921.
- ^ Cardinale S, Cisterna B, Bonetti P, Aringhieri C, Biggiogera M, Barabino SM (duben 2007). „Subnukleární lokalizace a dynamika pod-jednotky 68-kDa štěpícího faktoru I pre-mRNA 3 'na konci zpracování“. Molekulární biologie buňky. 18 (4): 1282–92. doi:10,1091 / mbc.E06-09-0846. PMC 1838998. PMID 17267687.
- ^ A b „Entrez Gene: CPSF6 štěpení a polyadenylační specifický faktor 6, 68 kDa“.
- ^ A b Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N a kol. (Říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
externí odkazy
- Člověk CPSF6 umístění genomu a CPSF6 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Další čtení
- Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Rüegsegger U, Beyer K, Keller W (březen 1996). „Čištění a charakterizace lidského štěpného faktoru Im zapojeného do 3 'koncového zpracování prekurzorů messengerové RNA“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (11): 6107–13. doi:10.1074 / jbc.271.11.6107. PMID 8626397.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- de Vries H, Rüegsegger U, Hübner W, Friedlein A, Langen H, Keller W (listopad 2000). „Lidský pre-mRNA štěpný faktor II (m) obsahuje homology kvasinkových proteinů a spojuje další dva štěpné faktory“. Časopis EMBO. 19 (21): 5895–904. doi:10.1093 / emboj / 19.21.5895. PMC 305781. PMID 11060040.
- Awasthi S, Alwine JC (listopad 2003). "Sdružení polyadenylačního štěpného faktoru I s U1 snRNP". RNA. 9 (11): 1400–9. doi:10,1261 / rna.5104603. PMC 1287061. PMID 14561889.
- Brown KM, GM Gilmartin (prosinec 2003). "Mechanismus pro regulaci zpracování pre-mRNA 3 'lidským štěpným faktorem Im". Molekulární buňka. 12 (6): 1467–76. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00453-2. PMID 14690600.
- Dettwiler S, Aringhieri C, Cardinale S, Keller W, Barabino SM (srpen 2004). „Zřetelné motivy sekvence v podjednotce 68 kDa štěpného faktoru Im zprostředkovávají vazbu RNA, interakce protein-protein a subcelulární lokalizaci“ (PDF). The Journal of Biological Chemistry. 279 (34): 35788–97. doi:10,1074 / jbc.M403927200. PMID 15169763. S2CID 39752996.
- Venkataraman K, Brown KM, Gilmartin GM (červen 2005). „Analýza nekanonického poly (A) místa odhaluje tripartitní mechanismus pro rozpoznávání poly (A) místa obratlovců“. Geny a vývoj. 19 (11): 1315–27. doi:10.1101 / gad.1298605. PMC 1142555. PMID 15937220.
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Millevoi S, Loulergue C, Dettwiler S, Karaa SZ, Keller W, Antoniou M, Vagner S (říjen 2006). „Interakce mezi U2AF 65 a CF I (m) spojuje spojovací a 3 'koncové stroje zpracování“. Časopis EMBO. 25 (20): 4854–64. doi:10.1038 / sj.emboj.7601331. PMC 1618107. PMID 17024186.
- Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |