Reticulon 4 - Reticulon 4 - Wikipedia

RTN4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2G31, 2JV5
Identifikátory
Aliasy	RTN4, ASY, NI220 / 250, NOGO, NOGO-A, NOGOC, NSP, NSP-CL, Nbla00271, Nbla10545, Nogo-B, Nogo-C, RTN-X, RTN4-A, RTN4-B1, RTN4-B2, RTN4 -C, retikulon 4
Externí ID	OMIM: 604475 MGI: 1915835 HomoloGene: 10743 Genové karty: RTN4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	55,112,621 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	29,744,331 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA; • kadherinová vazba; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • buněčná projekce; • jaderný obal; • membrána; • integrální součást membrány endoplazmatického retikula; • intracelulární; • endoplazmatické retikulum; • membrána endoplazmatického retikula; • buněčná membrána; • extracelulární exosom; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota; • tubulární síť endoplazmatického retikula; • tělo neuronových buněk; • endoplazmatické retikulum tubulární síťová membrána; • buněčné spojení;
Biologický proces	• shromáždění komplexu jaderných pórů; • regulace apoptotického procesu; • migrace vedená mozkovou kůrou radiální glia; • regulace větvené morfogeneze nervu; • srdeční epiteliální k mezenchymálnímu přechodu; • negativní regulace prodloužení axonu; • apoptotický proces; • negativní regulace axonogeneze; • vývoj nervového systému; • regulace vývoje nervové soustavy; • tvorba tubulárních sítí endoplazmatického retikula; • organizace tubulární sítě endoplazmatického retikula; • regulace buněčné migrace; • negativní regulace buněčného růstu; • axonální fasciculace; • pozitivní regulace migrace epiteliálních buněk; • pozitivní regulace proliferace epiteliálních buněk mléčné žlázy; • stabilizace bílkovin; • pozitivní regulace signalizace proteinkinázy B.; • pozitivní regulace lokalizace proteinu do endoplazmatického retikula; • pozitivní regulace signalizační dráhy ERBB3; • endoplazmatické retikulum tubulární síťová membránová organizace; • tvorba blastocyst; • pozitivní regulace signální dráhy podobné mýtnému receptoru 9; • lokalizace proteinu do lysozomu; • buněčná sfingolipidová homeostáza;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	57142
	68585
	ENSG00000115310
	ENSMUSG00000020458
	Q9NQC3
	Q99P72
NM_007008; NM_020532; NM_153828; NM_207520; NM_207521;
	NM_001321859; NM_001321860; NM_001321861; NM_001321862; NM_001321863; NM_001321904
	NM_024226; NM_194051; NM_194052; NM_194053; NM_194054
NP_001308788; NP_001308789; NP_001308790; NP_001308791; NP_001308792;
	NP_001308833; NP_008939; NP_065393; NP_722550; NP_997403; NP_997404
	NP_077188; NP_918940; NP_918941; NP_918942; NP_918943
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Reticulon 4, také známý jako Inhibitor růstu neuritů nebo Nogo, je protein že u lidí je kódován RTN4 gen^[5]^[6]^[7] který byl identifikován jako inhibitor z neurit růst specifický pro centrální nervový systém. Během nervového vývoje je Nogo exprimován hlavně neurony a poskytuje inhibiční signál pro migraci a pučení endotelových (špičkových) buněk CNS, čímž omezuje hustotu krevních cév.

Tento gen patří do rodiny retikulon -kódování genů. Retikulony jsou spojeny s endoplazmatickým retikulem a podílejí se na sekreci neuroendokrinů nebo na přenosu membrán v neuroendokrinních buňkách. Produktem tohoto genu je silný inhibitor růstu neuritů, který může také pomoci blokovat regeneraci centrálního nervového systému u vyšších obratlovců. Alternativně byly identifikovány sestřihané varianty transkriptu odvozené jak z diferenciálního sestřihu, tak z použití diferenciálního promotoru a kódování různých izoforem.^[7] Tam jsou tři izoformy: Nogo A, B a C. Nogo-A má dvě známé inhibiční domény včetně amino-Nogo na N-konci a Nogo-66, které tvoří molekuly extracelulární smyčky. Amino-Nogo i Nogo-66 se účastní inhibičních odpovědí, kde amino-Nogo je silným inhibitorem růstu neuritů a Nogo-66 se účastní růstový kužel zničení.^[8]

Výzkum naznačuje, že blokování Nogo-A během poškození neuronů (z nemocí, jako je roztroušená skleróza ) pomůže chránit nebo obnovit poškozené neurony.^[8]^[9] Zkoumání mechanismů tohoto proteinu představuje velký potenciál pro léčbu autoimunitní zprostředkovaný demyelinizační choroby a poranění míchy regenerace. Bylo také zjištěno, že je klíčovým hráčem v procesu, kdy fyzické cvičení zlepšuje procesy učení a paměti v mozku.^[10] Bylo také prokázáno, že Nogo-A negativně reguluje vaskulární růst a opravy po ischemické cévní mozkové příhodě. Genetická delece a blokování Nogo-A zprostředkované protilátkami vedly u experimentálního myšího modelu mozkové mrtvice k lepší revaskularizaci a funkčnímu zotavení.^[11]^[12]^[13] Kromě toho byl po léčbě anti-Nogo-A snížen vaskulární únik, hlavní komplikace po cévní mozkové příhodě.^[14]

Interakce

Bylo prokázáno, že Reticulon 4 komunikovat s WWP1,^[15] BCL2 jako 1^[16] a Bcl-2.^[16]

Viz také

Receptorový receptor 4

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115310 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020458 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ GrandPré T, Nakamura F, Vartanian T, Strittmatter SM (leden 2000). "Identifikace Nogo inhibitoru regenerace axonů jako retikulonového proteinu". Příroda. 403 (6768): 439–44. Bibcode:2000Natur.403..439G. doi:10.1038/35000226. PMID 10667797. S2CID 1926168.
^ Yang J, Yu L, Bi AD, Zhao SY (červen 2000). "Přiřazení genu lidského retikulonu 4 (RTN4) k chromozomu 2p14 -> 2p13 radiačním hybridním mapováním". Cytogenetika a genetika buněk. 88 (1–2): 101–2. doi:10.1159/000015499. PMID 10773680. S2CID 37521141.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RTN4 reticulon 4“.
^ ^A ^b Karnezis T, Mandemakers W, McQualter JL, Zheng B, Ho PP, Jordan KA a kol. (Červenec 2004). „Inhibitor růstu neuritů Nogo A se účastní autoimunitně zprostředkované demyelinizace“. Přírodní neurovědy. 7 (7): 736–44. doi:10.1038 / nn1261. PMID 15184901. S2CID 9613584.
^ Sozmen EG, Rosenzweig S, Llorente IL, DiTullio DJ, Machnicki M, Vinters HV a kol. (Prosinec 2016). „Blokování receptorů Nogo překonává selhání remyelinizace po mrtvici bílé hmoty a stimuluje funkční zotavení u starých myší“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 113 (52): E8453 – E8462. doi:10.1073 / pnas.1615322113. PMC 5206535. PMID 27956620.
^ Lee H, Raiker SJ, Venkatesh K, Geary R, Robak LA, Zhang Y, Yeh HH, Shrager P, Giger RJ (březen 2008). „Synaptická funkce pro receptor Nogo-66 NgR1: regulace morfologie dendritické páteře a synaptická síla závislá na aktivitě“. The Journal of Neuroscience. 28 (11): 2753–65. doi:10.1523 / JNEUROSCI.5586-07.2008. PMC 6670664. PMID 18337405. Shrnutí ležel – Výstraha Eurek.
^ Rust R, Grönnert L, Gantner C, Enzler A, Mulders G, Weber RZ a kol. (Červenec 2019). „Cílená terapie Nogo-A podporuje vaskulární opravu a funkční zotavení po cévní mozkové příhodě“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 116 (28): 14270–14279. doi:10.1073 / pnas.1905309116. PMC 6628809. PMID 31235580.
^ Rust, R; Grönnert, L; Weber, RZ; Mulders, G; Schwab, ME (září 2019). „Tankování ischemické CNS: naváděcí molekuly pro cévní reparaci“. Trendy v neurovědách. 42 (9): 644–656. doi:10.1016 / j.tins.2019.05.006. PMID 31285047. S2CID 195834057.
^ Rust, R; Gantner, C; Schwab, ME (leden 2019). „Pro- a antiangiogenní terapie: současný stav a klinické důsledky“. FASEB Journal. 33 (1): 34–48. doi:10.1096 / fj.201800640RR. PMID 30085886. S2CID 51937342.
^ Rust R, Weber RZ, Grönnert L, Mulders G, Maurer MA, Hofer AS a kol. (Prosinec 2019). „Anti-Nogo-A protilátky zabraňují úniku cév a působí jako pro-angiogenní faktory po cévní mozkové příhodě“. Vědecké zprávy. 9 (1): 20040. Bibcode:2019NatSR ... 920040R. doi:10.1038 / s41598-019-56634-1. PMC 6934709. PMID 31882970.
^ Qin H, Pu HX, Li M, Ahmed S, Song J (prosinec 2008). "Identifikace a strukturální mechanismus pro novou interakci mezi ubikvitin ligázou WWP1 a Nogo-A, klíčovým inhibitorem regenerace centrálního nervového systému". Biochemie. 47 (51): 13647–58. doi:10.1021 / bi8017976. PMID 19035836.
^ ^A ^b Tagami S, Eguchi Y, Kinoshita M, Takeda M, Tsujimoto Y (listopad 2000). „Nový protein, RTN-XS, interaguje s Bcl-XL i Bcl-2 na endoplazmatickém retikulu a snižuje jejich antiapoptotickou aktivitu.“. Onkogen. 19 (50): 5736–46. doi:10.1038 / sj.onc.1203948. PMID 11126360.

Další čtení

Teng FY, Tang BL (srpen 2008). "Buňková autonomní funkce Nogo a retikulonů: Vznikající příběh v endoplazmatickém retikulu". Journal of Cellular Physiology. 216 (2): 303–8. doi:10,1002 / jcp.21434. PMID 18330888. S2CID 34163142.
Ng CE, Tang BL (březen 2002). „Nogos a receptor Nogo-66: faktory inhibující regeneraci neuronů CNS“. Journal of Neuroscience Research. 67 (5): 559–65. doi:10.1002 / jnr.10134. PMID 11891768. S2CID 26061828.
Watari A, Yutsudo M (leden 2003). „Multifunkční gen ASY / Nogo / RTN-X / RTN4: apoptóza, potlačení nádoru a inhibice regenerace neuronů“. Apoptóza. 8 (1): 5–9. doi:10.1023 / A: 1021639016300. PMID 12510146. S2CID 37206000.
Schweigreiter R, Bandtlow CE (2006). „Nogo v poraněné míše“. Journal of Neurotrauma. 23 (3–4): 384–96. doi:10.1089 / neu.2006.23.384. PMID 16629624.
Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (prosinec 1998). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 5 (6): 355–64. doi:10.1093 / dnares / 5.6.355. PMID 10048485.
Prinjha R, Moore SE, Vinson M, Blake S, Morrow R, Christie G, Michalovich D, Simmons DL, Walsh FS (leden 2000). "Inhibitor růstu neuritů u lidí". Příroda. 403 (6768): 383–4. doi:10.1038/35000287. PMID 10667780. S2CID 205004005.
Chen MS, Huber AB, van der Haar ME, Frank M, Schnell L, Spillmann AA, Christ F, Schwab ME (leden 2000). „Nogo-A je inhibitor růstu neuritů asociovaný s myelinem a antigen pro monoklonální protilátku IN-1.“ Příroda. 403 (6768): 434–9. Bibcode:2000Natur.403..434C. doi:10.1038/35000219. PMID 10667796. S2CID 4388618.
Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (říjen 2000). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Výzkum genomu. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Výzkum genomu. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Tagami S, Eguchi Y, Kinoshita M, Takeda M, Tsujimoto Y (listopad 2000). „Nový protein, RTN-XS, interaguje s Bcl-XL i Bcl-2 na endoplazmatickém retikulu a snižuje jejich antiapoptotickou aktivitu.“. Onkogen. 19 (50): 5736–46. doi:10.1038 / sj.onc.1203948. PMID 11126360.
Fournier AE, GrandPre T, Strittmatter SM (leden 2001). "Identifikace receptoru zprostředkujícího Nogo-66 inhibici axonální regenerace". Příroda. 409 (6818): 341–6. Bibcode:2001 Natur.409..341F. doi:10.1038/35053072. PMID 11201742. S2CID 4404627.
Josephson A, Widenfalk J, Widmer HW, Olson L, Spenger C (červen 2001). „Exprese mRNA NOGO v nervové tkáni dospělého a fetálního člověka a potkana a při úbytku hmotnosti“. Experimentální neurologie. 169 (2): 319–28. doi:10.1006 / ex. 2001.1659. PMID 11358445. S2CID 23996169.
Zhou ZM, Sha JH, Li JM, Lin M, Zhu H, Zhou YD, Wang LR, Zhu H, Wang YQ, Zhou KY (únor 2002). „Exprese nového genu podobného retikulonu v lidských varlatech“. Reprodukce. 123 (2): 227–34. doi:10.1530 / rep.0.1230227. PMID 11866689.
GrandPré T, Li S, Strittmatter SM (květen 2002). "Peptid antagonista receptoru Nogo-66 podporuje regeneraci axonů". Příroda. 417 (6888): 547–51. Bibcode:2002 Natur.417..547G. doi:10.1038 / 417547a. PMID 12037567. S2CID 4414714.
Hu WH, Hausmann ON, Yan MS, Walters WM, Wong PK, Bethea JR (duben 2002). "Identifikace a charakterizace nového Nogo-interagujícího mitochondriálního proteinu (NIMP)". Journal of Neurochemistry. 81 (1): 36–45. doi:10.1046 / j.1471-4159.2002.00788.x. PMID 12067236. S2CID 38794348.
Liu BP, Fournier A, GrandPré T, Strittmatter SM (srpen 2002). „Glykoprotein asociovaný s myelinem jako funkční ligand pro receptor Nogo-66“. Věda. 297 (5584): 1190–3. Bibcode:2002Sci ... 297.1190L. doi:10.1126 / science.1073031. PMID 12089450. S2CID 1357777.
Dupuis L, Gonzalez de Aguilar JL, di Scala F, Rene F, de Tapia M, Pradat PF, Lacomblez L, Seihlan D, Prinjha R, Walsh FS, Meininger V, Loeffler JP (srpen 2002). „Nogo poskytuje molekulární marker pro diagnostiku amyotrofické laterální sklerózy“. Neurobiologie nemocí. 10 (3): 358–65. doi:10.1006 / nbdi.2002.0522. PMID 12270696. S2CID 45996722.
Taketomi M, Kinoshita N, Kimura K, Kitada M, Noda T, Asou H, Nakamura T, Ide C (říjen 2002). "Exprese Nogo-A ve zralých oligodendrocytech krysí míchy ve spojení se specifickými molekulami". Neurovědy Dopisy. 332 (1): 37–40. doi:10.1016 / S0304-3940 (02) 00910-2. hdl:2433/148718. PMID 12377379. S2CID 13433362.
Li M, Shi J, Wei Z, Teng FY, Tang BL, Song J (září 2004). "Strukturální charakterizace lidských funkčních domén Nogo-A. Struktura řešení Nogo-40, antagonisty receptoru Nogo-66 zvyšující regeneraci poškozené míchy". European Journal of Biochemistry / FEBS. 271 (17): 3512–22. doi:10.1111 / j.0014-2956.2004.04286.x. PMID 15317586.
Li M, Liu J, Song J (srpen 2006). „Nogo jde do čisté vody: struktura řešení Nogo-60 a design strukturovaného a v pufru rozpustného Nogo-54 pro zlepšení regenerace CNS“. Věda o bílkovinách. 15 (8): 1835–41. doi:10.1110 / ps.062306906. PMC 2242580. PMID 16877707.
Li M, Song J (červenec 2007). „N- a C-konce lidských Nogo molekul jsou vnitřně nestrukturované: bioinformatika, CD, charakterizace NMR a funkční implikace“. Proteiny. 68 (1): 100–8. doi:10,1002 / prot.21385. PMID 17397058. S2CID 21507005.
Li M, Song J (srpen 2007). „Nogo-B receptor má skutečně nestrukturovanou ektodoménu a částečně složenou cytoplazmatickou doménu“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 360 (1): 128–34. doi:10.1016 / j.bbrc.2007.06.031. PMID 17585875.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115310 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020458 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10667797-5] GrandPré T, Nakamura F, Vartanian T, Strittmatter SM (leden 2000). "Identifikace Nogo inhibitoru regenerace axonů jako retikulonového proteinu". Příroda. 403 (6768): 439–44. Bibcode:2000Natur.403..439G. doi:10.1038/35000226. PMID 10667797. S2CID 1926168.

[pmid10773680-6] Yang J, Yu L, Bi AD, Zhao SY (červen 2000). "Přiřazení genu lidského retikulonu 4 (RTN4) k chromozomu 2p14 -> 2p13 radiačním hybridním mapováním". Cytogenetika a genetika buněk. 88 (1–2): 101–2. doi:10.1159/000015499. PMID 10773680. S2CID 37521141.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: RTN4 reticulon 4“.

[Karnezis2004-8] A ^b Karnezis T, Mandemakers W, McQualter JL, Zheng B, Ho PP, Jordan KA a kol. (Červenec 2004). „Inhibitor růstu neuritů Nogo A se účastní autoimunitně zprostředkované demyelinizace“. Přírodní neurovědy. 7 (7): 736–44. doi:10.1038 / nn1261. PMID 15184901. S2CID 9613584.

[9] Sozmen EG, Rosenzweig S, Llorente IL, DiTullio DJ, Machnicki M, Vinters HV a kol. (Prosinec 2016). „Blokování receptorů Nogo překonává selhání remyelinizace po mrtvici bílé hmoty a stimuluje funkční zotavení u starých myší“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 113 (52): E8453 – E8462. doi:10.1073 / pnas.1615322113. PMC 5206535. PMID 27956620.

[pmid18337405-10] Lee H, Raiker SJ, Venkatesh K, Geary R, Robak LA, Zhang Y, Yeh HH, Shrager P, Giger RJ (březen 2008). „Synaptická funkce pro receptor Nogo-66 NgR1: regulace morfologie dendritické páteře a synaptická síla závislá na aktivitě“. The Journal of Neuroscience. 28 (11): 2753–65. doi:10.1523 / JNEUROSCI.5586-07.2008. PMC 6670664. PMID 18337405. Shrnutí ležel – Výstraha Eurek.

[11] Rust R, Grönnert L, Gantner C, Enzler A, Mulders G, Weber RZ a kol. (Červenec 2019). „Cílená terapie Nogo-A podporuje vaskulární opravu a funkční zotavení po cévní mozkové příhodě“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 116 (28): 14270–14279. doi:10.1073 / pnas.1905309116. PMC 6628809. PMID 31235580.

[12] Rust, R; Grönnert, L; Weber, RZ; Mulders, G; Schwab, ME (září 2019). „Tankování ischemické CNS: naváděcí molekuly pro cévní reparaci“. Trendy v neurovědách. 42 (9): 644–656. doi:10.1016 / j.tins.2019.05.006. PMID 31285047. S2CID 195834057.

[13] Rust, R; Gantner, C; Schwab, ME (leden 2019). „Pro- a antiangiogenní terapie: současný stav a klinické důsledky“. FASEB Journal. 33 (1): 34–48. doi:10.1096 / fj.201800640RR. PMID 30085886. S2CID 51937342.

[14] Rust R, Weber RZ, Grönnert L, Mulders G, Maurer MA, Hofer AS a kol. (Prosinec 2019). „Anti-Nogo-A protilátky zabraňují úniku cév a působí jako pro-angiogenní faktory po cévní mozkové příhodě“. Vědecké zprávy. 9 (1): 20040. Bibcode:2019NatSR ... 920040R. doi:10.1038 / s41598-019-56634-1. PMC 6934709. PMID 31882970.

[pmid19035836-15] Qin H, Pu HX, Li M, Ahmed S, Song J (prosinec 2008). "Identifikace a strukturální mechanismus pro novou interakci mezi ubikvitin ligázou WWP1 a Nogo-A, klíčovým inhibitorem regenerace centrálního nervového systému". Biochemie. 47 (51): 13647–58. doi:10.1021 / bi8017976. PMID 19035836.

[pmid11126360-16] A ^b Tagami S, Eguchi Y, Kinoshita M, Takeda M, Tsujimoto Y (listopad 2000). „Nový protein, RTN-XS, interaguje s Bcl-XL i Bcl-2 na endoplazmatickém retikulu a snižuje jejich antiapoptotickou aktivitu.“. Onkogen. 19 (50): 5736–46. doi:10.1038 / sj.onc.1203948. PMID 11126360.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]