Varisulca - Varisulca

Varisulca
Ancyromonas sp.
Vědecká klasifikace E
Doména:Eukaryota
(bez hodnocení):Bikonta
(bez hodnocení):Varisulca
Cavalier-Smith, 2002
Třídy

Varisulca je navrhovaný bazální Podiate taxon.[1] Zahrnuje několik linií heterotrofních protistů, zejména ancyromonády (planomonády), kollodictyonidy (diphylleidy), rigifilidy (Rigifila, Micronuclearia) a Mantamonas. Nedávné důkazy naznačují, že poslední tři jsou navzájem úzce spjaty a vytvářejí tzv. Kladu CRuMs, ale je nepravděpodobné, že by to konkrétně souviselo s ancyromonádami [2]

Cavalier-Smith navrhl nový podkmen Varisulca, který se skládá z tříd Hilomonadea, Diphyllatea a Glissodiscea.[3] O platnosti této navrhované taxonomie dosud nerozhodla Společnost protistologů. Je nepravděpodobné, že by byl široce přijímán, protože Varisulca se jeví jako parafyletická nebo polyfyletická (ancyromonády nejsou odvozeny jako sesterská skupina CRuM). Glissodiscea a Multirhiza (taxon zahrnující Diphyllatea a Glissodiscea) také vypadají parafyleticky nebo polyfyleticky, protože Mantamonas patří k CRuM, ale ancyromonády nikoli.

Varisulca se jeví jako parafyletický kmen Podiata. Takže další bazální Podiata jako např Malawimonas, Metamonada a / nebo Amébozoa a Amorphea se možná objevila ve Varisulce.[4][5] Některé skupiny Apusozoa jsou nyní považovány za Varisulca. The Apusomonadida (např. Thecamonas ) nyní není přímo spojen s Varisulca, ale je považován za sestru opisthokonts. Sulcozoa (původně pouze Varisulca a Apusozoa) nyní zahrnuje Unikonta / Amorphea a stává se ekvivalentem (kmene) Podiata a Sarcomastigota.[6]

Eukaryoty
Scotokaryotes /
 

Metamonada

 
 
 

Malawimonas

 
Sulcozoa /Podiata
 

Varisulca

 
Amorphea /
 

Amébozoa

 
Obazoa
 

Opisthokonta

 
 
 

Breviata

 
 
 

Apusomonadida

 
 

Opisthokonta

 
 
 
 
Unikont
/Sarcomastigota
 
Opimoda /Neozoa
 

Corticata /Diphoda /Diaphoretickes /Bikont

 
 

Mantamonadida vypadat jako sestra Apusomonadida v Apusozoa v některých nálezech.[7][8]

Taxonomie

Podkmen Varisulca Cavalier-Smith 2012

Reference

  1. ^ Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E .; Snell, Elizabeth A .; Berney, Cédric; Fiore-Donno, Anna Maria; Lewis, Rhodri (01.12.2014). „Multigenní eukaryotická fylogeneze odhaluje pravděpodobné předky prvoků opisthokonts (zvířata, houby, choanozoany) a amébozoa“. Molekulární fylogenetika a evoluce. 81: 71–85. doi:10.1016 / j.ympev.2014.08.012. PMID  25152275.
  2. ^ Brown, Matthew W; Heiss, Aaron A; Kamikawa, Ryoma; Inagaki, Yuji; Yabuki, Akinori; Tice, Alexander K; Shiratori, Takashi; Ishida, Ken-Ichiro; Hashimoto, Tetsuo (19. 1. 2018). „Fylogenomika umisťuje osiřelé linie Protistanu do nové eukaryotické superskupiny“. Biologie genomu a evoluce. 10 (2): 427–433. doi:10.1093 / gbe / evy014. ISSN  1759-6653. PMC  5793813. PMID  29360967.
  3. ^ Cavalier-Smith T (2013). “Časný vývoj režimů krmení eukaryot, buněčná strukturní rozmanitost a klasifikace prvoků phyla Loukozoa, Sulcozoa a Choanozoa”. Eur J Protistol. 49 (2): 115–78. doi:10.1016 / j.ejop.2012.06.001. PMID  23085100.
  4. ^ Cavalier-Smith, Thomas (05.02.2017). „Původ živočišné mnohobuněčnosti: prekurzory, příčiny, důsledky - přechod choanoflagellát / houba, neurogeneze a kambrická exploze“. Phil. Trans. R. Soc. B. 372 (1713): 20150476. doi:10.1098 / rstb.2015.0476. ISSN  0962-8436. PMC  5182410. PMID  27994119.
  5. ^ Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E .; Lewis, Rhodri (2016). „Fylogeneze 187 genů kmene prvoků Amoebozoa odhaluje novou třídu (Cutosea) hluboce se rozvětvující, ultrastrukturálně jedinečné, obalené mořské Lobosy a objasňuje vývoj améb“. Molekulární fylogenetika a evoluce. 99: 275–296. doi:10.1016 / j.ympev.2016.03.023. PMID  27001604.
  6. ^ Ruggiero, Michael A .; Gordon, Dennis P .; Orrell, Thomas M .; Bailly, Nicolas; Bourgoin, Thierry; Brusca, Richard C .; Cavalier-Smith, Thomas; Guiry, Michael D .; Kirk, Paul M. (2015-04-29). „Vyšší klasifikace všech živých organismů“. PLOS ONE. 10 (4): e0119248. Bibcode:2015PLoSO..1019248R. doi:10.1371 / journal.pone.0119248. ISSN  1932-6203. PMC  4418965. PMID  25923521.
  7. ^ Glücksman E, Snell EA, Berney C, Chao EE, Bass D, Cavalier-Smith T (září 2010). „Román mořského plachtění Zooflagellate rodu Mantamonas (Mantamonadida ord. Č .: Apusozoa)“. Protist. 162 (2): 207–221. doi:10.1016 / j.protis.2010.06.004. PMID  20884290.
  8. ^ Orr, Russell J. S .; Zhao, Sen; Klaveness, Dag; Yabuki, Akinori; Ikeda, Keiji; Makoto, Watanabe M .; Shalchian-Tabrizi, Kamran (08.10.2017). „Enigmatic Diphyllatea eukaryotes: Kultivace a cílené sekvenování amplikonu PacBio RS odhaluje taxonomickou rozmanitost vyššího řádu a globální distribuci“. bioRxiv  10.1101/199125.
  9. ^ Glücksman, Snell & Cavalier-Smith (2013). "Fylogeneze a vývoj Planomonadida (Sulcozoa): Osm nových druhů a nové rody Fabomonas a Nutomonas". European Journal of Protistology. 49 (2): 179–200. doi:10.1016 / j.ejop.2012.08.007. PMID  23369787.