Virus řepky - Turnip crinkle virus

Virus řepky (TCV)
Klasifikace virů
Skupina:
Skupina IV ((+) ssRNA )
Rodina:
Tombusviridae
Rod:
Carmovirus
Druh:
Virus řepky

Virus řepky (TCV) je rostlina patogenní virus z rodiny Tombusviridae. Poprvé byl izolován od tuřín (Brassica campestris ssp. rapa).

Struktura

TCV je malý (4054 základní páry ), jednovláknové, pozitivní sense RNA virus (virová RNA je ve stejné orientaci jako mRNA). Bylo prokázáno, že infikuje různé druhy rostlinných druhů (včetně Nicotiana benthamiana ) včetně společného modelu rostlin, Arabidopsis thaliana. Své gRNA kóduje pro pět bílkoviny: p28 a p88 (replikace), p8 a p9 (pohyb) a CP (obalový protein nebo enkapsidace ).[1] Struktura viru byla stanovena na 3,2Ångstrom rozlišení pomocí rentgenová krystalografie v roce 1986. Je strukturálně docela podobný rajče hustý kousek virus.[2]

Počet nekódující RNA prvky byly charakterizovány v TCV genom; příklady jsou vlásenka 5 a základní promotor.[3][4]

Replikace

Replikace virové RNA začíná migrací p28 na mitochondriální membránu. p28 migruje do vnější mitochondriální membrány a invaginuje ji; několik p88 molekul je přeneseno do nově vytvořených vezikul. Virová RNA se váže na p28 navázaný na membránu a RNA závislá RNA polymeráza nebo p88 iniciuje replikaci RNA pozitivního řetězce za vzniku meziproduktu mínus řetězce. Záporný řetězec meziproduktu se používá jako templát k produkci RNA potomstva pozitivního řetězce.[5] The obalových proteinů p8, p9 a p38 se podílejí na pohybu v rostlině.[6]

Satelitní viry

Malý, pomocné viry známý jako satelitní RNA Bylo zjištěno, že koinfikují rostliny pouze v přítomnosti TCV.[7] Tyto nekódující RNA up-regulujte příznaky TCV infekce. Satelitní RNA jsou na šíření závislé na TCV a hostitelském aparátu. Akcie satelitu C. sekvenční homologie s 3'koncem TCV, zatímco satelit D sdílí sekvenční homologii s 5'koncem satelitu C.

Reference

  1. ^ Carrington J, Heatona LA, Zuidemaa D, Hillman BI, Morris TJ (1989). Msgstr "Struktura genomu viru řepkového křečka". Virologie. 170 (1): 219–26. doi:10.1016/0042-6822(89)90369-3. PMID  2718381.
  2. ^ Hogle JM, Maeda A, Harrison SC (1986). „Struktura a shromáždění viru řepového zkroucení. I. Rentgenová krystalografická strukturní analýza při rozlišení 3,2 Å“. Journal of Molecular Biology. 191 (4): 625–38. doi:10.1016 / 0022-2836 (86) 90450-x. PMID  3806676.
  3. ^ McCormack, JC; Simon AE (2004). „Předpjatá hypermutageneze spojená s mutacemi v nepřekládané vlásence viru RNA“. Journal of Virology. 78 (14): 7813–7817. doi:10.1128 / JVI.78.14.7813-7817.2004. PMC  434097. PMID  15220455.
  4. ^ Zhang, G; Zhang J; Simon AE (2004). "Represe a dereprese syntézy minus-řetězce v replikonu viru plus-řetězce RNA". Journal of Virology. 78 (14): 7619–7633. doi:10.1128 / JVI.78.14.7619-7633.2004. PMC  434078. PMID  15220437.
  5. ^ Ahlquist P, Noueiry AO, Lee WM, Kushner DB, Dye BT (2003). „Hostitelské faktory při replikaci genomu pozitivního řetězce viru RNA“. Journal of Virology. 77 (15): 8181–6. doi:10.1128 / JVI.77.15.8181-8186.2003. PMC  165243. PMID  12857886.
  6. ^ Hacker DL, Petty IT, Wei N, Morris TJ (1992). Msgstr "Geny viru zvlněné řepy požadované pro replikaci RNA a pohyb viru". Virologie. 186 (1): 1–8. doi:10.1016 / 0042-6822 (92) 90055-t. PMID  1727594.
  7. ^ Altenbach SB, Howell SH (1981). Msgstr "Identifikace satelitní RNA asociované s virem tuřínu". Virologie. 112 (1): 25–33. doi:10.1016/0042-6822(81)90608-5. PMID  18635061.

externí odkazy