Carmovirus - Carmovirus

Carmovirus
Journal.pone.0142415.g001.Dpng
Transmisní elektronový mikrofotografie viru fazole mírné mozaiky (BMMV) viriony
Klasifikace virů
Skupina:
Skupina IV ((+) ssRNA )
Rodina:
Tombusviridae
Rod:
Carmovirus
Typ Druh

Carmovirus je rod viry, v rodině Tombusviridae. Rostliny slouží jako přirození hostitelé. V současné době existuje 19 druhů v tomto rodu, včetně druhů druhů Virus karafiátu.[1][2] Je zařazen pod Baltimore klasifikace systém jako virus skupiny IV, který má jednořetězcový, pozitivní smysl RNA genom.[3]

Dějiny

Navrženo na schůzi ICTV v roce 1987 jako nepřiřazený rod a přiděleno Tombusviridae v roce 1993,[4] ICTV od vydání 2013 rozpoznává 19 druhů.[3][5]

Na schůzi v roce 1987 byli za členy navrženi: Virus karafiátu, Virus řepky, Virus mozaiky Galinsoga, Virus glycinové skvrny, Hibiscus chlorotic ringspot virus (HCRSV), Virus rozpadu květu Pelargonium, Virus kaktusu Saguaro. Virus mozaiky Galinsoga a Virus glycinové skvrny v současné době nejsou členy.

Jako předběžní členové byli navíc navrženi: Virus mírné mozaiky fazole, Blackgram skvrnitý virus, *Virus Cowpea strakatosti, Latentní virus černého bezu, *Meloun nekrotický přímý virus, Virus nekrózy špiček narcisu, Virus jitrocele 6, Virus bez příznaků horečky. (Taxonomický návrh 30) Do vydání roku 2013 byly přijaty pouze ty, které jsou označeny hvězdičkou *.

Taxonomie

Skupina: ssRNA (+)

[2]

Struktura

Viry v Carmoviru jsou neobalené, s ikosahedrickou a sférickou geometrií a T = 3 symetrií. Průměr je kolem 28-34 nm, skládá se z 32 kapsomerů. Genomy jsou lineární, mají délku přibližně 4 až 5,4 kB. Každá podjednotka se skládá ze 180 proteinů. Hmotnostně je viron 80% bílkovin a 20% nukleových kyselin.[1]

RodStrukturaSymetrieCapsidGenomické uspořádáníGenomická segmentace
CarmovirusIcosahedralT = 3NeobalenéLineárníMonopartitní

Životní cyklus

Virová replikace je cytoplazmatická. Vstupu do hostitelské buňky se dosáhne penetrací do hostitelské buňky. Replikace sleduje model replikace pozitivního řetězce RNA viru. Transkripce pozitivního řetězce viru rna pomocí modelu předčasného ukončení subgenomické transkripce rna je metodou transkripce. Překlad probíhá virovou iniciací a potlačením ukončení. Virus opouští hostitelskou buňku virovým pohybem vedeným tubuly. Rostliny slouží jako přirozený hostitel. Přenosové cesty jsou mechanické, nesené osivem a kontaktní.[1]

RodPodrobnosti o hostiteliTkáňový tropismusVstupní údajePodrobnosti o vydáníReplikační webMísto montážePřenos
CarmovirusRostlinyŽádnýVirové hnutí; mechanické očkováníVirové hnutíCytoplazmaCytoplazmaMechanické: kontakt; semínko

Rekombinace

RNA rekombinace se vyskytuje často během replikace carmovirů, což usnadňuje virovou genom oprava a podpora variability sekvence.[6] K rekombinaci dochází mechanismem, ve kterém je virová RNA-dependentní RNA polymeráza přepíná šablony během syntézy RNA (rekombinace volby kopírování).[6]

Epidemiologie

Přirozeným hostitelem viru je druh Caryophyllaceae, odpovědný za karafiáty, ale může infikovat mnohem větší škálu rostlin. Příznaky jsou lokalizované léze, kde došlo k buněčné smrti. Virus se šíří prostřednictvím členovců přenášejících infikovanou mízu. Ačkoli je nemoc rozšířena na karafiátech, příznaky jsou relativně mírné a nepředstavují zásadní problém. V jiných rostlinách, například v Kala „Tato choroba vyvolává větší obavy, protože rostlina má pro ni značný ekonomický význam Tchaj-wan.

Reference

  1. ^ A b C „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 15. června 2015.
  2. ^ A b ICTV. „Virus Taxonomy: 2014 Release“. Citováno 15. června 2015.
  3. ^ A b Neznámý autor (2004). 00.074.0.02. Carmovirus. V: ICTVdB - Univerzální virová databáze, verze 3. Büchen-Osmond, C. (Ed), ICTVdB Management, Columbia University, New York, USA
  4. ^ „ZÁPIS ze 7. schůze ICTV EDMONTON, KANADA, 12. srpna 1987“ (PDF). Archivovány od originál (PDF) dne 13. prosince 2014. Citováno 11. prosince 2014.
  5. ^ Historie taxonomie ICTV pro karmovirus
  6. ^ A b Cheng CP, Nagy PD. Mechanismus rekombinace RNA ve virech karmy a tombusu: důkazy pro změnu templátu pomocí RNA-dependentní RNA polymerázy in vitro. J Virol. 2003 listopad; 77 (22): 12033-47. doi: 10.1128 / jvi.77.22.12033-12047.2003. PMID: 14581540; PMCID: PMC254248

Bibliografie

externí odkazy