Thermococcaceae - Thermococcaceae

Thermococcaceae
Vědecká klasifikace
Doména:
Archaea
Království:
Euryarchaeota
Kmen:
Euryarchaeota
Třída:
Termokoky
Objednat:
Termokoky
Rodina:
Thermococcaceae Zillig a kol. 1988
Rody

v taxonomie, Thermococcaceae plocha rodina z Termokoky.[1] Byly izolovány téměř všechny druhy ze tří rodů Thermococcaceae hydrotermální průduchy V oceáně. Všechny jsou přísně anaeroby.[2]

Fylogeneze

Aktuálně přijímaná taxonomie je založena na Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře[3] a Národní centrum pro biotechnologické informace[4]a fylogeneze je založena na uvolňování 106 LTP na bázi 16S rRNA 106 o Projekt „All-Species Living Tree“.[5]

 
  Palaeococcus
 

P. ferrophilus Takai a kol. 2000 (typ sp.)

 
 

P. helgesonii Amend a kol. 2006

 
 
 
 

?Thermococcus litoralis Neuner a kol. 2001

 
 

?Thermococcus marinus ♠ Jolivet a kol. 2004

 
 

?Thermococcus mexicalis ♠ Antoine 1996

 
 

?Thermococcus nautilus ♠ Soler a kol. 2007

 
 

?Thermococcus onnurineus ♠ Bae a kol. 2006

 
 

?Thermococcus radiotolerans ♠ Jolivet a kol. 2004

 
 

?Thermococcus waimanguensis ♠ Goetz & Morgan 1999

 
 
 

Thermococcus aegaeus Arab a kol. 2000

 
 
 

Thermococcus alcaliphilus Keller a kol. 1997

 
 

Thermococcus sibiricus Miroshnichenko a kol. 2001

 
 
 
 
 

Thermococcus aggregans Canganella a kol. 1998

 
 
 

Thermococcus barophilus Marteinsson a kol. 1999

 
 
  Pyrococcus
 

?P. abyssi ♠ Erauso a kol. 1993

 
 

?P. woesei ♦ Zillig 1988

 
 

?P. yayanosii Birrien a kol. 2011

 
 
 

Thermococcus chitonophagus Huber a Stetter 1996

 
 

P. glycovorans Barbier a kol. 1999

 
 
 
 

P. furiosus Fiala a Stetter 1986 (typ sp.)

 
 

P. horikoshii González a kol. 1999

 
 
 
  Thermococcus
 

T. gorgonarius Miroshnichenko a kol. 1998

 
 

T. guaymasensis Canganella a kol. 1998

 
 
 
 
 

T. fumicolans Godfroy a Meunier 1996

 
 

T. gammatolerans Jolivet a kol. 2003

 
 
 
 

T. stetteri Miroshnichenko 1990

 
 
 

T. kodakarensis Atomi a kol. 2005

 
 

T. peptonophilus González a kol. 1996

 
 
 
 
 
 
 

T. profundus Kobayashi a Horikoshi 1995

 
 
 

T. acidaminovorans Dirmeier a kol. 2001

 
 
 

T. pacificus Miroshnichenko a kol. 1998

 
 
 

T. waiotapuensis González a kol. 2001

 
 

T. zilligii Ronimus a kol. 1999

 
 
 
 
 
 
 
 

T. atlanticus Cambon-Bonavita et al. 2004

 
 
 

T. celericrescens Kuwabara a kol. 2007

 
 

T. siculi Grote a kol. 2000

 
 
 
 
 

T. coalescens Kuwabara a kol. 2005

 
 

T. thioreducens Pikuta a kol. 2007

 
 
 

T. hydrothermalis Godfroy a kol. 1997

 
 

T. celer Zillig 1983 (typ sp.)

 
 

T. barossii Duffaud et al. 2005

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Poznámky:
♠ Kmeny nalezené na Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI), ale není uveden v seznamu Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN).
♦ Ztráta typu nebo není k dispozici

Reference

  1. ^ Viz NCBI webová stránka o Thermococcaceae. Data extrahovaná z „Zdroje taxonomie NCBI“. Národní centrum pro biotechnologické informace. Citováno 2007-03-19.
  2. ^ Schut, Gerrit J .; Gina L. Lipscomb; Yejun Han; Jaspreet S. Notey; Robert M. Kelly; Michael M. W. Adams (10.10.2006). "Rodina Thermococcaceae a řád Thermococcales". Prokaryotes. 3. Springer Science & Business Media. str. 363–383. doi:10.1007/978-3-642-38954-2_324. ISBN  978-0387254937.
  3. ^ J.P.Euzéby. "Thermococcaceae". Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN) [1]. Archivovány od originál dne 27.01.2013. Citováno 2011-11-17. Externí odkaz v | vydavatel = (Pomoc)
  4. ^ Sayers; et al. "Thermococcaceae". Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI) databáze taxonomie [2]. Citováno 2011-06-05. Externí odkaz v | vydavatel = (Pomoc)
  5. ^ Projekt All-Species Living Tree.„Vydání LTP založené na 16S rRNA 106 (plný strom)“ (PDF). Silva komplexní databáze ribozomálních RNA [3]. Citováno 2011-11-17. Externí odkaz v | vydavatel = (Pomoc)

Další čtení

Vědecké časopisy

Vědecké knihy

Vědecké databáze

externí odkazy