TOG superrodina - TOG superfamily
The receptor spojený s proteinem transportér-opsin-G (TOG) nadčeleď je proteinová nadčeleď integrální membránové proteiny, obvykle 7 nebo 8 transmembránových alfa-šroubovice segmenty (TMS). Zahrnuje (1) iontově translokační mikrobiální rhodopsiny a (2) receptory spojené s G proteinem (GPCR), (3) transportéry sladkého cukru, (4) absorpce nikotinamid ribonukleosidu permeaty (PnuC; TC # 4.B.1 ), (5) Permeáty pro absorpci 4-toluensulfonátu (TSUP); TC # 2.A.102 ), (6) Ni2+–Ko2+ transportéry (NiCoT); TC # 2.A.52 ), (7) transportéry organických látek (OST); TC # 2.A.82 ), (8) fosfát: Na+ symporte (PNaS); TC # 2.A.58 ) a (9) lysozomální cystinové transportéry (LCT); TC # 2.A.43 ).[1][2]
Rodiny
Aktuálně uznáváno rodiny v rámci nadrodiny TOG (s TC čísla v modré barvě) zahrnují:[3]
- 1.A.14 - Rodina genů pro přenos genů (TEGT) se zvýšením varlat
- 1.A.26 - The Mg2+ Rodina Transporter-E (MgtE)
- 1.A.76 - Rodina hořčíku Transporter1 (MagT1)
- 2.A.43 - Rodina lyzozomálních cystinových transportérů (LCT)
- 2.A.52 - Potom já2+-Co2+ Rodina transportérů (NiCoT)
- 2.A.58 - Fosfát: Na+ Rodina Symporter (PNaS)
- 2.A.82 - Rodina transportérů organických látek (OST)
- 2.A.102 - Rodina 4-toluensulfonátových absorpčních permeas (TSUP)
- 2.A.123 - Sladký; PQ smyčka; Sliny; Rodina MtN3 (sladká)
- 3.E.1 - Rodina mikrobiálních rhodopsinů (MR) přenášejících ionty
- 4.B.1 - Rodina nikotinamid ribonukleosidů (NR) pro absorpci permeázy (PnuC)
- 9.A.14 - Rodina receptoru spojeného s G-proteinem (GPCR)
Struktury
Několik 3D struktur dostupných pro členy následujících rodin zahrnuje:
- SWEET rodina: 4RNG
- Rodina MR: 5AX0, 3T45- struktury s vysokým rozlišením
- Rodina PnuC: 4QTN
- Rodina GPCR: 3CAP
Viz také
Reference
- ^ Maksim A. Shlykov; Wei Hao Zheng; Jonathan S. Chen a Milton H. Saier, ml. (Březen 2012). „Bioinformatická charakterizace rodiny transmembránových proteinů pro absorpci 4-toluensulfonátu (TSUP)“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - biomembrány. 1818 (3): 703–717. doi:10.1016 / j.bbamem.2011.12.005. PMC 3917603. PMID 22192777.
- ^ Yee DC1, Shlykov MA, Västermark A, Reddy VS, Arora S, Sun EI, Saier MH Jr. .. (září 2013). „Nadrodina receptoru spojeného s proteinem transportér-opsin-G (TOG)“. FEBS Journal. 280 (22): 5780–5800. doi:10.1111 / febs.12499. PMC 3832197. PMID 23981446.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
- ^ Saier, Milton. „Nadrodina receptoru spojeného s proteinem Transporter-Opsin-G (TOG)“. tcdb.org. Citováno 28. prosince 2015.
Další čtení
- Yee DC1, Shlykov MA, Västermark A, Reddy VS, Arora S, Sun EI, Saier MH Jr. .. (září 2013). „Nadrodina receptoru spojeného s proteinem transportér-opsin-G (TOG)“. FEBS Journal. 280 (22): 5780–5800. doi:10.1111 / febs.12499. PMC 3832197. PMID 23981446.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
