Rodina genu pro přenos genů se zvýšenými varlaty - Testis-enhanced gene transfer family - Wikipedia

Rodina genových transkriptů se zvýšenými varlaty
Identifikátory
SymbolTEGT
PfamPF01027
TCDB1.A.14
OPM nadčeleď703
OPM protein4pgr

The rodina transkriptu genů se zvýšeným varlatem (TEGT) zahrnuje genové transkriptové proteiny savců se zvýšeným obsahem varlat, které jsou exprimovány ve vysokých koncentracích ve varlatech, domnělé proteiny vázající glutamát / aspartát rostlin a zvířat, protein YccA Escherichia coli a protein YetJ z Bacillus subtilis. Tyto proteiny mají délku přibližně 200 až 250 zbytků a vykazují 7 TMS.[1]

Homologie

Homology se nacházejí v různých Gramnegativní a Grampozitivní bakterie, kvasinky, houby, rostliny, zvířata a viry. The E-coli genom kóduje tři paralogy, YbhL, YbhM a YccA. Vzdálené homology nalezené v Drosophilia melanogaster a krysa jsou protein spojený s N-methyl-D-aspartátovým receptorem (NMDARAI) a glutamátový vazebný řetězec N-methyl-D-aspartátového receptoru. Dva další jsou protein neurální membrány potkana 35 a Arabidopsis thaliana Protein inhibitoru Bax-1 (BI-1) schopný potlačit buněčnou smrt indukovanou Bax v droždí.

BI-1

Jeden z těchto proteinů, TEGT nebo Bax Inhibitor-1 (TC # 1.A.14.1.1 ), má C-koncovou doménu, která tvoří Ca2+-propustný kanál.[2] BI-1 je ER -lokalizovaný protein, který chrání před apoptóza a ER stres. Bylo navrženo, že BI-1 moduluje ER Ca2+ homeostáza jednáním jako Ca2+- únikový kanál. Tyto proteiny jsou vzdáleně příbuzné s ionotropním proteinem vázajícím glutamát N-methyl D-aspartátového (NMDA) receptoru člověka. Homology zahrnují domnělý protein indukovaný studeným šokem a stabilizační protein SecY.[1]

Funkce

Na základě experimentálního stanovení topologie BI-1 Bultynck et al. navrhuje, aby jeho C-koncový a-helikální 20 aminokyselinový peptid katalyzoval Ca2+ tok obou in vivo a in vitro.[2] Ca2+Vlastnosti úniku byly zachovány u zvířat, ale ne u rostlinných a kvasinkových ortologů. Mutací jednoho z kritických zbytků aspartátu (D213) v navrhovaném Ca2+-kanálový pór v plné délce BI-1, D213 se ukázalo být nezbytné pro ER Ca závislý na BI-12+-unikat.

Struktura

Chang et al. zveřejněno krystalové struktury bakteriálního homologu, YetJ (TC # 1.A.14.2.3 ) při rozlišení 1,9 Á a charakterizoval jeho aktivitu úniku vápníku. Jeho záhyb se sedmi transmembránami a šroubovicemi obsahuje dva sendviče se třemi šroubovicemi omotané kolem centrální C-terminální šroubovice.[3] Struktury získané v uzavřené a otevřené konformaci jsou reverzibilně přeměnitelné změnami pH. Vodíkově vázaný narušený pár konzervovaných zbytků aspartylu vysvětluje závislost tohoto přechodu na pH a pH reguluje přítok vápníku v proteoliposomech. Homologické modely pro lidský BI-1 poskytly pohled na jeho cytoprotektivní aktivitu.[3]

Transportní reakce

Zobecněná reakce katalyzovaná kanály TEGT je:

kationy (out) ⇌ kationty (in)

Reference

  1. ^ A b van Stelten J, Silva F, Belin D, Silhavy TJ (srpen 2009). "Účinky antibiotik a protoonkogenového homologu na destrukci proteinového translokátoru SecY". Věda. 325 (5941): 753–6. Bibcode:2009Sci ... 325..753V. doi:10.1126 / science.1172221. PMC  2832214. PMID  19661432.
  2. ^ A b Bultynck G, Kiviluoto S, Henke N, Ivanova H, Schneider L, Rybalchenko V, Luyten T, Nuyts K, De Borggraeve W, Bezprozvanny I, Parys JB, De Smedt H, Missiaen L, Methner A (leden 2012). „C-konec inhibitoru Bax-1 tvoří póry kanálu propustné pro Ca2 +“. The Journal of Biological Chemistry. 287 (4): 2544–57. doi:10.1074 / jbc.M111.275354. PMC  3268414. PMID  22128171.
  3. ^ A b Chang Y, Bruni R, Kloss B, Assur Z, Kloppmann E, Rost B, Hendrickson WA, Liu Q (červen 2014). „Strukturální základ pro únik vápníku citlivý na pH přes membrány“. Věda. 344 (6188): 1131–5. Bibcode:2014Sci ... 344.1131C. doi:10.1126 / science.1252043. PMC  4119810. PMID  24904158.

Do tato úprava, tento článek používá obsah z „1.A.14 Testes-Enhanced Gene Transfer (TEGT) Family“, který je licencován způsobem, který umožňuje opětovné použití v rámci Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License, ale ne pod GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky.