Rodina genu pro přenos genů se zvýšenými varlaty - Testis-enhanced gene transfer family - Wikipedia
Rodina genových transkriptů se zvýšenými varlaty | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identifikátory | |||||||||
Symbol | TEGT | ||||||||
Pfam | PF01027 | ||||||||
TCDB | 1.A.14 | ||||||||
OPM nadčeleď | 703 | ||||||||
OPM protein | 4pgr | ||||||||
|
The rodina transkriptu genů se zvýšeným varlatem (TEGT) zahrnuje genové transkriptové proteiny savců se zvýšeným obsahem varlat, které jsou exprimovány ve vysokých koncentracích ve varlatech, domnělé proteiny vázající glutamát / aspartát rostlin a zvířat, protein YccA Escherichia coli a protein YetJ z Bacillus subtilis. Tyto proteiny mají délku přibližně 200 až 250 zbytků a vykazují 7 TMS.[1]
Homologie
Homology se nacházejí v různých Gramnegativní a Grampozitivní bakterie, kvasinky, houby, rostliny, zvířata a viry. The E-coli genom kóduje tři paralogy, YbhL, YbhM a YccA. Vzdálené homology nalezené v Drosophilia melanogaster a krysa jsou protein spojený s N-methyl-D-aspartátovým receptorem (NMDARAI) a glutamátový vazebný řetězec N-methyl-D-aspartátového receptoru. Dva další jsou protein neurální membrány potkana 35 a Arabidopsis thaliana Protein inhibitoru Bax-1 (BI-1) schopný potlačit buněčnou smrt indukovanou Bax v droždí.
BI-1
Jeden z těchto proteinů, TEGT nebo Bax Inhibitor-1 (TC # 1.A.14.1.1 ), má C-koncovou doménu, která tvoří Ca2+-propustný kanál.[2] BI-1 je ER -lokalizovaný protein, který chrání před apoptóza a ER stres. Bylo navrženo, že BI-1 moduluje ER Ca2+ homeostáza jednáním jako Ca2+- únikový kanál. Tyto proteiny jsou vzdáleně příbuzné s ionotropním proteinem vázajícím glutamát N-methyl D-aspartátového (NMDA) receptoru člověka. Homology zahrnují domnělý protein indukovaný studeným šokem a stabilizační protein SecY.[1]
Funkce
Na základě experimentálního stanovení topologie BI-1 Bultynck et al. navrhuje, aby jeho C-koncový a-helikální 20 aminokyselinový peptid katalyzoval Ca2+ tok obou in vivo a in vitro.[2] Ca2+Vlastnosti úniku byly zachovány u zvířat, ale ne u rostlinných a kvasinkových ortologů. Mutací jednoho z kritických zbytků aspartátu (D213) v navrhovaném Ca2+-kanálový pór v plné délce BI-1, D213 se ukázalo být nezbytné pro ER Ca závislý na BI-12+-unikat.
Struktura
Chang et al. zveřejněno krystalové struktury bakteriálního homologu, YetJ (TC # 1.A.14.2.3 ) při rozlišení 1,9 Á a charakterizoval jeho aktivitu úniku vápníku. Jeho záhyb se sedmi transmembránami a šroubovicemi obsahuje dva sendviče se třemi šroubovicemi omotané kolem centrální C-terminální šroubovice.[3] Struktury získané v uzavřené a otevřené konformaci jsou reverzibilně přeměnitelné změnami pH. Vodíkově vázaný narušený pár konzervovaných zbytků aspartylu vysvětluje závislost tohoto přechodu na pH a pH reguluje přítok vápníku v proteoliposomech. Homologické modely pro lidský BI-1 poskytly pohled na jeho cytoprotektivní aktivitu.[3]
Transportní reakce
Zobecněná reakce katalyzovaná kanály TEGT je:
- kationy (out) ⇌ kationty (in)
Reference
- ^ A b van Stelten J, Silva F, Belin D, Silhavy TJ (srpen 2009). "Účinky antibiotik a protoonkogenového homologu na destrukci proteinového translokátoru SecY". Věda. 325 (5941): 753–6. Bibcode:2009Sci ... 325..753V. doi:10.1126 / science.1172221. PMC 2832214. PMID 19661432.
- ^ A b Bultynck G, Kiviluoto S, Henke N, Ivanova H, Schneider L, Rybalchenko V, Luyten T, Nuyts K, De Borggraeve W, Bezprozvanny I, Parys JB, De Smedt H, Missiaen L, Methner A (leden 2012). „C-konec inhibitoru Bax-1 tvoří póry kanálu propustné pro Ca2 +“. The Journal of Biological Chemistry. 287 (4): 2544–57. doi:10.1074 / jbc.M111.275354. PMC 3268414. PMID 22128171.
- ^ A b Chang Y, Bruni R, Kloss B, Assur Z, Kloppmann E, Rost B, Hendrickson WA, Liu Q (červen 2014). „Strukturální základ pro únik vápníku citlivý na pH přes membrány“. Věda. 344 (6188): 1131–5. Bibcode:2014Sci ... 344.1131C. doi:10.1126 / science.1252043. PMC 4119810. PMID 24904158.
Do tato úprava, tento článek používá obsah z „1.A.14 Testes-Enhanced Gene Transfer (TEGT) Family“, který je licencován způsobem, který umožňuje opětovné použití v rámci Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License, ale ne pod GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky.