TBRG4 - TBRG4

TBRG4
Identifikátory
Aliasy	TBRG4, CPR2, FASTKD4, transformátor růstového faktoru beta regulátor 4
Externí ID	OMIM: 611325 MGI: 1100868 HomoloGene: 31259 Genové karty: TBRG4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	45,112,047 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	6,626,067 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita proteinkinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• mitochondrie; • mitochondriální matice;
Biologický proces	• buněčné dýchání; • fosforylace bílkovin; • zástava buněčného cyklu; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • Metabolický proces mRNA; • regulace stability mitochondriální mRNA; • zpracování mitochondriální mRNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9238
	21379
	ENSG00000136270
	ENSMUSG00000000384
	Q969Z0
	Q91YM4
	NM_199122; NM_001261834; NM_004749; NM_030900
NM_001130457; NM_134011; NM_001362713; NM_001362714; NM_001362715;
	NM_001362716
	NP_001248763; NP_004740; NP_112162; NP_954573
NP_001123929; NP_598772; NP_001349642; NP_001349643; NP_001349644;
	NP_001349645
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Regulátor beta transformujícího růstového faktoru 4 (TBRG4), také známý jako protein 2 pro obnovení progrese buněčného cyklu (CPR2) a protein 4 obsahující FAST kinázovou doménu (FASTKD4), je protein že u lidí je kódován TBRG4 gen na chromozomu 7.^[5]^[6]^[7] Tento protein je součástí rodiny FASTKD, která je známá pro regulaci energetické rovnováhy mitochondrie ve stresu a buněčný cyklus postup.^[8]^[9] TBRG4 se podílí na proliferaci buněk při hematopoéze a mnohočetný myelom.^[10]^[11]

Struktura

TBRG4 sdílí strukturální charakteristiky rodiny FASTKD, včetně N-terminál mitochondriální doména cílení a tři C-terminál domény: dvě domény podobné FAST kinázám (FAST_1 a FAST_2) a a RNA -vázací doména (RAP).^[8]^[9] Doména cílení mitochondrií směruje TBRG4 k importu do mitochondrií. I když funkce C-koncových domén nejsou známy, RAP pravděpodobně váže RNA během trans-sestřihu.^[8] TBRG4 také obsahuje více domnělých domén leucinového zipu.^[6]

Funkce

Jako člen rodiny FASTKD, TBRG4 lokalizuje do mitochondrií k modulaci jejich energetické rovnováhy, zejména v podmínkách stresu. Ačkoli je TBRG4 všudypřítomně exprimován ve všech tkáních, objevuje se hojněji kosterní sval, srdce sval a další tkáně obohacené o mitochondrie.^[8] TBRG4 se také lokalizuje do kostní dřeň (BM), kde funguje při hematopoéze indukcí sekrece IL-6 a VEGF, které pak stimulují buněčnou proliferaci a angiogeneze. Inhibuje však imunoglobulin sekrece normální B buňky.^[10]

Klinický význam

Zapojení TBRG4 do krvetvorba spojuje to mnohočetný myelom (MM), který pochází z maligní proliferace plazmatických buněk v kostní dřeň.^[10] Vysoká exprese TBRG4 byla spojena se zvýšenou proliferace buněk a horší výsledek; downregulace jeho exprese tedy může přispět ke snížení růstu nádoru zastavením progrese buněčného cyklu.^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136270 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000384 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ UniProt: Q969Z0
^ ^A ^b Edwards MC, Liegeois N, Horecka J, DePinho RA, Sprague GF, Tyers M, Elledge SJ (listopad 1997). „Lidské geny CPR (obnovení buněčného cyklu) dodávají kvasinkovým buňkám Far-fenotyp“. Genetika. 147 (3): 1063–76. PMC 1208234. PMID 9383053.
^ "Entrez Gene: TBRG4 transformující růstový faktor beta regulátor 4".
^ ^A ^b ^C ^d Simarro M, Gimenez-Cassina A, Kedersha N, Lazaro JB, Adelmant GO, Marto JA, Rhee K, Tisdale S, Danial N, Benarafa C, Orduña A, Anderson P (říjen 2010). „Protein 3 obsahující rychlou kinázovou doménu je mitochondriální protein nezbytný pro buněčné dýchání“. Komunikace pro biochemický a biofyzikální výzkum. 401 (3): 440–6. doi:10.1016 / j.bbrc.2010.09.075. PMC 2963690. PMID 20869947.
^ ^A ^b Yeung KT, Das S, Zhang J, Lomniczi A, Ojeda SR, Xu CF, Neubert TA, Samuels HH (červen 2011). „Nový transkripční komplex, který selektivně moduluje apoptózu buněk rakoviny prsu prostřednictvím regulace FASTKD2“. Molekulární a buněčná biologie. 31 (11): 2287–98. doi:10.1128 / MCB.01381-10. PMC 3133243. PMID 21444724.
^ ^A ^b ^C Sevcikova S, Paszekova H, Besse L, Sedlarikova L, Kubaczkova V, Almasi M, Pour L, Hajek R (duben 2015). „Extramedulární relaps mnohočetného myelomu definovaný jako skupina s nejvyšším rizikem na základě deregulovaných údajů o genové expresi“ (PDF). Biomedicínské práce Lékařské fakulty Univerzity Palackého v Olomouci, Československo. 159 (2): 288–93. doi:10,5507 / bp.2015.014. PMID 25877407.
^ ^A ^b Sarasquete ME, Martínez-López J, Chillón MC, Alcoceba M, Corchete LA, Paiva B, Puig N, Sebastián E, Jiménez C, Mateos MV, Oriol A, Rosiñol L, Palomera L, Teruel AI, González Y, Lahuerta JJ, Bladé J, Gutiérrez NC, Fernández-Redondo E, González M, San Miguel JF, García-Sanz R (říjen 2013). „Hodnocení profilování genové exprese kvantitativní polymerázovou řetězovou reakcí s cílem vyvinout klinicky proveditelný test predikce výsledku u mnohočetného myelomu“. British Journal of Hematology. 163 (2): 223–34. doi:10.1111 / bjh.12519. PMID 23952215. S2CID 207081358.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (únor 1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 6 (1): 63–70. doi:10.1093 / dnares / 6.1.63. PMID 10231032.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (září 2000). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. Zprávy EMBO. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Rival-Gervier S, Thépot D, Jolivet G, Houdebine LM (květen 2003). „Gen vepřové syrovátkové kyselé bílkoviny je obklopen dvěma všudypřítomně exprimovanými geny“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - genová struktura a exprese. 1627 (1): 7–14. doi:10.1016 / s0167-4781 (03) 00051-4. PMID 12759187.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (říjen 2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Přírodní biotechnologie. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136270 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000384 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[uniprot-5] UniProt: Q969Z0

[pmid9383053-6] A ^b Edwards MC, Liegeois N, Horecka J, DePinho RA, Sprague GF, Tyers M, Elledge SJ (listopad 1997). „Lidské geny CPR (obnovení buněčného cyklu) dodávají kvasinkovým buňkám Far-fenotyp“. Genetika. 147 (3): 1063–76. PMC 1208234. PMID 9383053.

[entrez-7] "Entrez Gene: TBRG4 transformující růstový faktor beta regulátor 4".

[pmid20869947-8] A ^b ^C ^d Simarro M, Gimenez-Cassina A, Kedersha N, Lazaro JB, Adelmant GO, Marto JA, Rhee K, Tisdale S, Danial N, Benarafa C, Orduña A, Anderson P (říjen 2010). „Protein 3 obsahující rychlou kinázovou doménu je mitochondriální protein nezbytný pro buněčné dýchání“. Komunikace pro biochemický a biofyzikální výzkum. 401 (3): 440–6. doi:10.1016 / j.bbrc.2010.09.075. PMC 2963690. PMID 20869947.

[pmid21444724-9] A ^b Yeung KT, Das S, Zhang J, Lomniczi A, Ojeda SR, Xu CF, Neubert TA, Samuels HH (červen 2011). „Nový transkripční komplex, který selektivně moduluje apoptózu buněk rakoviny prsu prostřednictvím regulace FASTKD2“. Molekulární a buněčná biologie. 31 (11): 2287–98. doi:10.1128 / MCB.01381-10. PMC 3133243. PMID 21444724.

[pmid25877407-10] A ^b ^C Sevcikova S, Paszekova H, Besse L, Sedlarikova L, Kubaczkova V, Almasi M, Pour L, Hajek R (duben 2015). „Extramedulární relaps mnohočetného myelomu definovaný jako skupina s nejvyšším rizikem na základě deregulovaných údajů o genové expresi“ (PDF). Biomedicínské práce Lékařské fakulty Univerzity Palackého v Olomouci, Československo. 159 (2): 288–93. doi:10,5507 / bp.2015.014. PMID 25877407.

[pmid23952215-11] A ^b Sarasquete ME, Martínez-López J, Chillón MC, Alcoceba M, Corchete LA, Paiva B, Puig N, Sebastián E, Jiménez C, Mateos MV, Oriol A, Rosiñol L, Palomera L, Teruel AI, González Y, Lahuerta JJ, Bladé J, Gutiérrez NC, Fernández-Redondo E, González M, San Miguel JF, García-Sanz R (říjen 2013). „Hodnocení profilování genové exprese kvantitativní polymerázovou řetězovou reakcí s cílem vyvinout klinicky proveditelný test predikce výsledku u mnohočetného myelomu“. British Journal of Hematology. 163 (2): 223–34. doi:10.1111 / bjh.12519. PMID 23952215. S2CID 207081358.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]