TAC1 - TAC1

TAC1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2KS9, 2KSA, 2KSB, 4HOM, %% s2B19, %% s2B19
Identifikátory
Aliasy	TAC1, Hs.2563, NK2, TAC2, prekurzor tachykininu 1, NKNA, NPK
Externí ID	OMIM: 162320 MGI: 98474 HomoloGene: 2394 Genové karty: TAC1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	97,740,472 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	7,565,834 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba na receptory; • vazba na receptor P látky;
Buněčná složka	• buněčná membrána; • extracelulární oblast; • axon; • tělo neuronových buněk; • extracelulární;
Biologický proces	• buněčná odpověď na stimul nervového růstového faktoru; • reakce na kvasinky; • asociativní učení; • pozitivní regulace vylučování sodíku ledvinami; • pozitivní regulace koncentrace cytosolických iontů vápníku; • signalizace buňka-buňka; • antibakteriální humorální odpověď; • pozitivní regulace synaptického přenosu, cholinergní; • pozitivní regulace migrace epiteliálních buněk; • pozitivní regulace osifikace; • pozitivní regulace synaptického přenosu, GABAergic; • negativní regulace srdeční frekvence; • pozitivní regulace sekrece kortikosteronů; • regulace krevního tlaku; • pozitivní regulace akčního potenciálu; • reakce na morfin; • reakce na lipopolysacharid; • dlouhodobá paměť; • reakce na bolest; • obranná reakce na gramnegativní bakterii; • pozitivní regulace sekrece slin; • pozitivní regulace akutní zánětlivé odpovědi; • inseminace; • reakce na hormon; • nocicepce; • detekce abiotického stimulu; • vrozený imunitní systém; • neuropeptidová signální dráha; • pozitivní regulace proliferace lymfocytů; • pozitivní regulace sestavy napěťových vláken; • antifungální humorální odpověď; • obranná odpověď na grampozitivní bakterii; • chemický synaptický přenos; • zánětlivá reakce; • signální dráha receptoru tachykininu; • antimikrobiální humorální imunitní odpověď zprostředkovaná antimikrobiálním peptidem; • zabíjení buněk jiného organismu; • Signální dráha receptoru spřaženého s G-proteinem;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6863
	21333
	ENSG00000006128
	ENSMUSG00000061762
	P20366
	P41539
	NM_013998; NM_003182; NM_013996; NM_013997
	NM_009311; NM_001311060
	NP_003173; NP_054702; NP_054703; NP_054704
	NP_001297989; NP_033337
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Preprotachykinin-1, (zkráceně PPT-1, PPT-I, nebo PPT-A), je prekurzorový protein že u lidí je kódován TAC1 gen.^[5]^[6]

Isoformy a deriváty

Protein má čtyři izoformy —Alfa-, beta-, gama- a delta-PPT — které mohou variabilně podstoupit posttranslační modifikace k výrobě neurokinin A (dříve známá jako látka K) a látka P.^[7]^[8] Alfa- a delta-PPT lze upravit pouze na látku P, zatímco beta- a gama-PPT mohou produkovat jak látku P, tak neurokinin A.^[9]

Neurokinin A lze také dále upravit tak, aby produkoval neuropeptid K. (také známý jako neurokinin K) a neuropeptid gama.^[10]

Tyto hormony se předpokládá, že fungují jako neurotransmitery které interagují s nervovými receptory a buňky hladkého svalstva. Je známo, že indukují behaviorální reakce a fungují jako vazodilatancia a sekretářky. Alternativní sestřih exonů 4 a / nebo 6 produkuje čtyři známé produkty neurčeného významu.^[6]

Lidské bazální ganglia

Povaha a distribuce PPT-1 byla studována u člověka bazální ganglia. Protein je exprimován rovnoměrně v celém caudate a putamen a 80 až 85% z toho existuje v izoformě beta-PPT. 15-20% proteinu je v izoformě gama-PPT, zatímco nebyl detekován žádný alfa-PPT.^[8]

Porovnání druhů

U lidí je beta-PPT dominantní izoformou v mozku, která kontrastuje s potkany (převážně gama-PPT) a kravami (alfa-PPT).^[8]

I když lidský i potkaní PPT-1 produkují látku P a neurokinin A, lidé produkují více neuropeptidu K, zatímco krysy produkují více neuropeptidu gama. V kravských mozcích PPT-1 primárně kóduje látku P, ale ne jiné peptidy odvozené od neurokininu A.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000006128 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000061762 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Chiwakata C, Brackmann B, Hunt N, Davidoff M, Schulze W, Ivell R (květen 1991). "Exprese genu tachykininu (substance-P) v Leydigových buňkách lidského a myšího varlete". Endokrinologie. 128 (5): 2441–8. doi:10.1210 / endo-128-5-2441. PMID 1708336.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TAC1 tachykinin, prekurzor 1 (látka K, látka P, neurokinin 1, neurokinin 2, neuromedin L, neurokinin alfa, neuropeptid K, neuropeptid gama)“.
^ Holzer, P. (01.03.1988). „Místní efektorové funkce senzorických nervových zakončení citlivých na kapsaicin: Zapojení tachykininů, peptidu souvisejícího s genem kalcitoninu a dalších neuropeptidů“. Neurovědy. 24 (3): 739–768. doi:10.1016/0306-4522(88)90064-4. PMID 3288903. S2CID 35325223.
^ ^A ^b ^C ^d Bannon, Michael J .; Poosch, Michael S .; Haverstick, Doris M .; Anita, Mandal; Xue, Iris C. -H .; Shibata, Kazuhiko; Dragovic, Ljubisa J. (01.01.1992). "Preprotachykininová genová exprese v lidských bazálních gangliích: charakterizace mRNA a pre-mRNA produkovaných alternativním sestřihem RNA". Molekulární výzkum mozku. 12 (1–3): 225–231. doi:10.1016 / 0169-328X (92) 90088-S. PMID 1312203.
^ „MeSH Supplementary Concept: preprotachykinin“. www.mentata.com. Citováno 2016-05-19.^{[trvalý mrtvý odkaz ]}
^ Takeda, Y; Krause, JE (leden 1989). „Neuropeptid K účinně stimuluje sekreci slinných žláz a potencuje slinění vyvolané látkou P“. Proc Natl Acad Sci U S A. 86 (1): 392–396. doi:10.1073 / pnas.86.1.392. PMC 286471. PMID 2463627.

Další čtení

McGregor GP, Conlon JM (1991). "Charakterizace C-koncového peptidu obklopujícího lidský beta-preprotachykinin". Peptidy. 11 (5): 907–10. doi:10.1016 / 0196-9781 (90) 90007-R. PMID 2284201. S2CID 54246526.
Harmar AJ, Armstrong A, Pascall JC a kol. (1986). „cDNA sekvence lidského beta-preprotachykininu, běžného prekurzoru látky P a neurokininu A.“. FEBS Lett. 208 (1): 67–72. doi:10.1016/0014-5793(86)81534-4. PMID 3770210. S2CID 32411674.
Zimmer A, Zimmer AM, Baffi J a kol. (1998). „Hypoalgezie u myší s cílenou delecí genu tachykininu 1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (5): 2630–5. doi:10.1073 / pnas.95.5.2630. PMC 19441. PMID 9482938.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000006128 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000061762 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1708336-5] Chiwakata C, Brackmann B, Hunt N, Davidoff M, Schulze W, Ivell R (květen 1991). "Exprese genu tachykininu (substance-P) v Leydigových buňkách lidského a myšího varlete". Endokrinologie. 128 (5): 2441–8. doi:10.1210 / endo-128-5-2441. PMID 1708336.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: TAC1 tachykinin, prekurzor 1 (látka K, látka P, neurokinin 1, neurokinin 2, neuromedin L, neurokinin alfa, neuropeptid K, neuropeptid gama)“.

[7] Holzer, P. (01.03.1988). „Místní efektorové funkce senzorických nervových zakončení citlivých na kapsaicin: Zapojení tachykininů, peptidu souvisejícího s genem kalcitoninu a dalších neuropeptidů“. Neurovědy. 24 (3): 739–768. doi:10.1016/0306-4522(88)90064-4. PMID 3288903. S2CID 35325223.

[:0-8] A ^b ^C ^d Bannon, Michael J .; Poosch, Michael S .; Haverstick, Doris M .; Anita, Mandal; Xue, Iris C. -H .; Shibata, Kazuhiko; Dragovic, Ljubisa J. (01.01.1992). "Preprotachykininová genová exprese v lidských bazálních gangliích: charakterizace mRNA a pre-mRNA produkovaných alternativním sestřihem RNA". Molekulární výzkum mozku. 12 (1–3): 225–231. doi:10.1016 / 0169-328X (92) 90088-S. PMID 1312203.

[9] „MeSH Supplementary Concept: preprotachykinin“. www.mentata.com. Citováno 2016-05-19.^{[trvalý mrtvý odkaz ]}

[10] Takeda, Y; Krause, JE (leden 1989). „Neuropeptid K účinně stimuluje sekreci slinných žláz a potencuje slinění vyvolané látkou P“. Proc Natl Acad Sci U S A. 86 (1): 392–396. doi:10.1073 / pnas.86.1.392. PMC 286471. PMID 2463627.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]