SYNPO2 - SYNPO2
Myopodin protein, také zvaný Synaptopodin-2 je protein že u lidí je kódován SYNPO2 gen.[5][6][7] Myopodin je vyjádřen v srdeční, hladký sval a kosterní sval a lokalizuje do Z-disk struktur.
Struktura
Myopodin je protein 117,4 kDa složený z 1093 aminokyselin,[8] ačkoli byly popsány čtyři alternativně sestříhané izoformy.[9] Myopodin obsahuje jeden motiv PPXY, několik motivů PXXP a dva potenciály sekvence nukleární lokalizace (jeden N-terminál a jeden C-terminál ).[5] Ukázalo se, že PPXY motivy zprostředkovávají interakce a motivy PXXP představují potenciální místa interakce pro SH3 doména -obsahující proteiny. Myopodin obsahuje román aktin vazebné místo (mezi aminokyselinami 410 a 563) ve středu proteinu.[5]
Funkce
V době myotube diferenciace, myopodin interaguje s stresová vlákna před společnou lokalizací s alfa aktinin-2 na Z-disky ve zralých pruhovaných svalových buňkách.[5] Ukázalo se, že myopodin se pohybuje mezi jádro a cytoplazma v myoblasty a myotubes v reakci na stres; jeho export z jádro je citlivý na lemtomycin B.[5] Nukleární lokalizace myopodinu je citlivá na Importin 13, který přímo váže myopodin a usnadňuje jeho translokaci.[10] Zdá se, že vazba na import a jaderný dovoz myopodinu je zprostředkována serin /threonin fosforylace závislá vazba myopodinu na 14-3-3 beta [11] Zdá se, že myopodin reguluje rozdělený intracelulární přenos signálu mezi Z-disk a jádro v srdeční sval buňky vytvořením a Z-disk signalizační komplex s alfa aktinin-2, kalcineurin, CaMKII, protein specifický pro svalovou A-kinázu, a myomegalin.[12] Konkrétně fosforylace pomocí protein kináza A nebo CaMKII a defosforylace pomocí kalcineurin usnadňuje vázání nebo uvolňování 14-3-3-beta a odpovídající jaderný nebo cytoplazmatický lokalizace myopodinu.[12]
Interakce
Myopodin interaguje s:
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000172403 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000050315 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b C d E F G Weins A, Schwarz K, Faul C, Barisoni L, Linke WA, Mundel P (říjen 2001). „Diferenciace a stres závislá jaderná cytoplazmatická redistribuce myopodinu, nového proteinu vázajícího aktiny“. The Journal of Cell Biology. 155 (3): 393–404. doi:10.1083 / jcb.200012039. PMC 2150840. PMID 11673475.
- ^ Liang J, Ke G, You W, Peng Z, Lan J, Kalesse M, Tartakoff AM, Kaplan F, Tao T (leden 2008). „Interakce mezi importinem 13 a myopodinem naznačuje cestu nukleárního importu pro myopodin“. Molekulární a buněčná biochemie. 307 (1–2): 93–100. doi:10.1007 / s11010-007-9588-1. PMID 17828378. S2CID 19273082.
- ^ „Entrez Gene: SYNPO2 synaptopodin 2“.
- ^ Joon-Sub Chung. „Znalostní databáze atlasu srdečních organelárních proteinů (COPaKB) - —proteinové informace“. heartproteome.org.
- ^ „SYNPO2 - Synaptopodin-2 - Homo sapiens (Human) - SYNPO2 gen a protein“. uniprot.org.
- ^ A b Liang J, Ke G, You W, Peng Z, Lan J, Kalesse M, Tartakoff AM, Kaplan F, Tao T (leden 2008). „Interakce mezi importinem 13 a myopodinem naznačuje cestu nukleárního importu pro myopodin“. Molekulární a buněčná biochemie. 307 (1–2): 93–100. doi:10.1007 / s11010-007-9588-1. PMID 17828378. S2CID 19273082.
- ^ Faul C, Hüttelmaier S, Oh J, Hachet V, Singer RH, Mundel P (květen 2005). „Podpora importu alfa zprostředkovaného jaderného importu vazbou nákladního proteinu závislého na fosforylaci na 14-3-3“. The Journal of Cell Biology. 169 (3): 415–24. doi:10.1083 / jcb.200411169. PMC 2171942. PMID 15883195.
- ^ A b C d E F Faul C, Dhume A, Schecter AD, Mundel P (prosinec 2007). „Proteinkináza A, Ca2 + / kalmodulin-dependentní kináza II a kalcineurin regulují intracelulární přenos myopodinu mezi Z-diskem a jádrem srdečních myocytů.“. Molekulární a buněčná biologie. 27 (23): 8215–27. doi:10.1128 / MCB.00950-07. PMC 2169179. PMID 17923693.
Další čtení
- Houlgatte R, Mariage-Samson R, Duprat S, Tessier A, Bentolila S, Lamy B, Auffray C (říjen 1995). „Genexpress Index: zdroj pro objevování genů a genovou mapu lidského genomu“. Výzkum genomu. 5 (3): 272–304. doi:10,1101 / gr. 5.3.272. PMID 8593614.
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Výzkum genomu. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B „Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Výzkum genomu. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
- Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (září 2000). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. Zprávy EMBO. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
- Van Impe K, De Corte V, Eichinger L, Bruyneel E, Mareel M, Vandekerckhove J, Gettemans J (květen 2003). „Nukleo-cytoplazmatický aktin vázající protein CapG postrádá nukleární exportní sekvenci přítomnou ve strukturně příbuzných proteinech“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (20): 17945–52. doi:10,1074 / jbc.M209946200. PMID 12637565.
- Sanchez-Carbayo M, Schwarz K, Charytonowicz E, Cordon-Cardo C, Mundel P (srpen 2003). „Role myopodinu potlačující nádory u rakoviny močového měchýře: ztráta jaderné exprese myopodinu závisí na buněčném cyklu a předpovídá klinický výsledek“. Onkogen. 22 (34): 5298–305. doi:10.1038 / sj.onc.1206616. PMID 12917631.
- Jing L, Liu L, Yu YP, Dhir R, Acquafondada M, Landsittel D, Cieply K, Wells A, Luo JH (květen 2004). „Exprese myopodinu indukuje potlačení růstu nádoru a metastáz“. American Journal of Pathology. 164 (5): 1799–806. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 63738-8. PMC 1615646. PMID 15111326.
- Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (říjen 2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Výzkum genomu. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
- Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (leden 2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |