SYBL1 - SYBL1

VAMP7
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2DMW
Identifikátory
Aliasy	VAMP7, SYBL1, TI-VAMP, TIVAMP, VAMP-7, membránový protein spojený s vezikuly 7
Externí ID	OMIM: 300053 MGI: 1096399 HomoloGene: 4121 Genové karty: VAMP7
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	155,943,769 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba SNARE; • Aktivita SNAP receptoru; • syntaxinová vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• extracelulární exosom; • transportní váček; • pseudopodia; • cytoplazma; • transportní vezikulární membrána; • synapse; • integrální součást membrány; • trans-Golgiho síť; • azurofilní granulovaná membrána; • Golgiho aparát; • buněčné spojení; • destičkový alfa granulát; • intracelulární membránou vázaná organela; • lamellipodium; • apikální část buňky; • neuronová projekce; • membrána; • povrch buňky; • membrána fagocytických vezikul; • endoplazmatické retikulum; • perinukleární oblast cytoplazmy; • membrána endoplazmatického retikula; • sekreční granule; • sekreční granulovaná membrána; • lysozom; • cytoplazmatický váček; • membrána pozdního endozomu; • endozom; • fagocytární váček; • buněčná membrána; • lysozomální membrána; • Komplex SNARE; • klatrinem potažená membrána vezikul; • synaptický váček; • integrální součást membrány synaptických vezikul; • hipokampální mechové vlákno na CA3 synapse;
Biologický proces	• GO: 0000046 zrání autofagosomu; • transport vezikul podél mikrotubulů; • fúze vezikul s Golgiho aparátem; • Transport proteinu Golgiho na plazmatickou membránu; • pozitivní regulace sekrece histaminu žírnými buňkami; • SNARE komplexní montáž; • exocytóza regulovaná ionty vápníku; • transport triglyceridů; • ER na transport zprostředkovaný vezikuly Golgi; • transport zprostředkovaný vezikulemi po Golgi; • regulace cílení proteinu na vakuolární membránu; • exocytóza; • přirozená degranulace zabijáckých buněk; • fagocytóza, pohlcení; • transport bílkovin; • transport endosomu k lysozomu; • pozitivní regulace morfogeneze dendritů; • fúze vezikul; • transport zprostředkovaný vezikuly; • degranulace neutrofilů; • eosinofilní degranulace; • endocytóza; • membránová organizace; • doprava;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6845
	20955
	ENSG00000124333
	ENSMUSG00000051412
	P51809
	P70280
	NM_001145149; NM_001185183; NM_005638
	NM_001302138; NM_011515
	NP_001138621; NP_001172112; NP_005629
	NP_001289067; NP_035645; NP_001346080
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Synaptobrevin -jako protein 1 (SYBL1), také známý jako membránový protein spojený s vezikuly 7 (VAMP7), je protein že u lidí je kódován VAMP7nebo SYBL1, gen.^[4]^[5]^[6]

Funkce

SYBL1 je transmembránový protein, který je členem rozpustného receptoru proteinu pro připojení faktoru citlivého na N-ethylmaleimid (SNARE ) rodina. SYBL1 se lokalizuje na pozdě endozomy a lysozomy a podílí se na fúzi dopravy vezikuly na jejich cílové membrány.^[6]

Interakce

SYBL1 bylo prokázáno komunikovat s SNAP23^[7]^[8] a AP3D1.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124333 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ D'Esposito M, Ciccodicola A, Gianfrancesco F, Esposito T, Flagiello L, Mazzarella R, Schlessinger D, D'Urso M (červenec 1996). "Gen podobný synaptobrevinu v pseudoautosomální oblasti Xq28 prochází inaktivací X". Nat. Genet. 13 (2): 227–9. doi:10.1038 / ng0696-227. PMID 8640232.
^ Filippini F, Rossi V, Galli T, Budillon A, D'Urso M, D'Esposito M (červenec 2001). „Longins: nová evoluční konzervovaná rodina VAMP, která sdílí novou doménu SNARE“. Trends Biochem. Sci. 26 (7): 407–9. doi:10.1016 / S0968-0004 (01) 01861-8. PMID 11440841.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SYBL1 synaptobrevin like 1“.
^ ^A ^b Martinez-Arca S, Rudge R, Vacca M, Raposo G, Camonis J, Proux-Gillardeaux V, Daviet L, Formstecher E, Hamburger A, Filippini F, D'Esposito M, Galli T (červenec 2003). „Duální mechanismus ovládající lokalizaci a funkci exocytických v-SNARE“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (15): 9011–6. doi:10.1073 / pnas.1431910100. PMC 166429. PMID 12853575.
^ Galli T, Zahraoui A, Vaidyanathan VV, Raposo G, Tian JM, Karin M, Niemann H, Louvard D (červen 1998). "Nový tetanový neurotoxin-necitlivý vezikulární asociovaný membránový protein v SNARE komplexech apikální plazmatické membrány epiteliálních buněk". Mol. Biol. Buňka. 9 (6): 1437–48. doi:10,1091 / mbc.9.6.1437. PMC 25366. PMID 9614185.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Galli T, Zahraoui A, Vaidyanathan VV, Raposo G, Tian JM, Karin M, Niemann H, Louvard D (1998). "Nový tetanový neurotoxin-necitlivý vezikulární asociovaný membránový protein v SNARE komplexech apikální plazmatické membrány epiteliálních buněk". Mol. Biol. Buňka. 9 (6): 1437–48. doi:10,1091 / mbc.9.6.1437. PMC 25366. PMID 9614185.
Advani RJ, Yang B, Prekeris R, Lee KC, Klumperman J, Scheller RH (1999). „VAMP-7 zprostředkovává vezikulární transport z endosomů do lysozomů“. J. Cell Biol. 146 (4): 765–76. doi:10.1083 / jcb.146.4.765. PMC 2156136. PMID 10459012.
Matarazzo MR, Cuccurese M, Strazzullo M, Vacca M, Curci A, Miano MG, Cocchia M, Mercadante G, Torino A, D'Urso M, Ciccodicola A, D'Esposito M (1999). "Lidská a myší genová struktura a exprese SYBL1". Gen. 240 (1): 233–8. doi:10.1016 / S0378-1119 (99) 00375-3. PMID 10564831.
Ciccodicola A, D'Esposito M, Esposito T, Gianfrancesco F, Migliaccio C, Miano MG, Matarazzo MR, Vacca M, Franzè A, Cuccurese M, Cocchia M, Curci A, Terracciano A, Torino A, Cocchia S, Mercadante G, Pannone E, Archidiacono N, Rocchi M, Schlessinger D, D'Urso M (2000). „Diferenciálně regulované a vyvinuté geny v plně sekvenované pseudoautosomální oblasti Xq / Yq“. Hučení. Mol. Genet. 9 (3): 395–401. doi:10.1093 / hmg / 9.3.395. PMID 10655549.
Ward DM, Pevsner J, Scullion MA, Vaughn M, Kaplan J (2000). „Syntaxin 7 a VAMP-7 jsou rozpustné receptory proteinů pro připojení faktoru citlivého na N-ethylmaleimid potřebné pro fúzi pozdního endosomu s lysozomem a homotypickou fúzí lysozomu v alveolárních makrofázích. Mol. Biol. Buňka. 11 (7): 2327–33. doi:10,1091 / mbc.11.7.2327. PMC 14922. PMID 10888671.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Antonin W, Holroyd C, Fasshauer D, Pabst S, Von Mollard GF, Jahn R (2000). „Komplex SNARE zprostředkující fúzi pozdních endosomů definuje konzervované vlastnosti struktury a funkce SNARE“. EMBO J.. 19 (23): 6453–64. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6453. PMC 305878. PMID 11101518.
Wade N, Bryant NJ, Connolly LM, Simpson RJ, Luzio JP, Piper RC, James DE (2001). „Komplexy syntaxinu 7 s myší Vps10p ocasní interaktor lb, syntaxin 6, membránový protein asociovaný s vezikulemi (VAMP) 8 a VAMP7 v buňkách melanomu b16“. J. Biol. Chem. 276 (23): 19820–7. doi:10,1074 / jbc.M010838200. PMID 11278762.
Antonin W, Fasshauer D, Becker S, Jahn R, Schneider TR (2002). „Krystalová struktura endosomálního komplexu SNARE odhaluje společné strukturní principy všech SNARE“. Nat. Struct. Biol. 9 (2): 107–11. doi:10.1038 / nsb746. hdl:11858 / 00-001M-0000-0012-F459-F. PMID 11786915.
Müller DJ, Schulze TG, Jahnes E, Cichon S, Krauss H, Kesper K, Held T, Maier W, Propping P, Nöthen MM, Rietschel M (2002). „Sdružení mezi polymorfismem v pseudoautosomálním X-vázaném genu SYBL1 a bipolární afektivní poruchou“. Dopoledne. J. Med. Genet. 114 (1): 74–8. doi:10,1002 / ajmg.10115. PMID 11840509.
Bogdanovic A, Bennett N, Kieffer S, Louwagie M, Morio T, Garin J, Satre M, Bruckert F (2002). „Syntaxin 7, syntaxin 8, Vti1 a VAMP7 (membránový protein spojený s vezikuly 7) tvoří aktivní komplex SNARE pro časnou fúzi makropinocytů v Dictyostelium discoideum“. Biochem. J. 368 (Pt 1): 29–39. doi:10.1042 / BJ20020845. PMC 1222979. PMID 12175335.
Matarazzo MR, De Bonis ML, Gregory RI, Vacca M, Hansen RS, Mercadante G, D'Urso M, Feil R, D'Esposito M (2002). „Alelická inaktivace pseudoautosomálního genu SYBL1 je řízena epigenetickými mechanismy společnými pro chromozomy X a Y“. Hučení. Mol. Genet. 11 (25): 3191–8. doi:10,1093 / hmg / 11,25,3191. PMID 12444103.
Martinez-Arca S, Rudge R, Vacca M, Raposo G, Camonis J, Proux-Gillardeaux V, Daviet L, Formstecher E, Hamburger A, Filippini F, D'Esposito M, Galli T (2003). „Duální mechanismus ovládající lokalizaci a funkci exocytických v-SNARE“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (15): 9011–6. doi:10.1073 / pnas.1431910100. PMC 166429. PMID 12853575.
Di Leva F, Ferrante MI, Demarchi F, Caravelli A, Matarazzo MR, Giacca M, D'Urso M, D'Esposito M, Franzé A (2004). „Bazální transkripce lidského synaptobrevinového 1 genu je regulována prostřednictvím interakce faktoru aktivujícího transkripci genu selenocysteinu tRNA s faktorem zinku 143 s evolučními konzervovanými cis-prvky“. J. Biol. Chem. 279 (9): 7734–9. doi:10,1074 / jbc.M308140200. PMID 14672948.
Rao SK, Huynh C, Proux-Gillardeaux V, Galli T, Andrews NW (2004). "Identifikace SNARE účastnících se synaptotagminu VII regulované lysozomální exocytózy". J. Biol. Chem. 279 (19): 20471–9. doi:10,1074 / jbc.M400798200. PMID 14993220.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P51809 (Membránový protein spojený s vezikuly 7) na PDBe-KB.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124333 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8640232-4] D'Esposito M, Ciccodicola A, Gianfrancesco F, Esposito T, Flagiello L, Mazzarella R, Schlessinger D, D'Urso M (červenec 1996). "Gen podobný synaptobrevinu v pseudoautosomální oblasti Xq28 prochází inaktivací X". Nat. Genet. 13 (2): 227–9. doi:10.1038 / ng0696-227. PMID 8640232.

[pmid11440841-5] Filippini F, Rossi V, Galli T, Budillon A, D'Urso M, D'Esposito M (červenec 2001). „Longins: nová evoluční konzervovaná rodina VAMP, která sdílí novou doménu SNARE“. Trends Biochem. Sci. 26 (7): 407–9. doi:10.1016 / S0968-0004 (01) 01861-8. PMID 11440841.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: SYBL1 synaptobrevin like 1“.

[pmid12853575-7] A ^b Martinez-Arca S, Rudge R, Vacca M, Raposo G, Camonis J, Proux-Gillardeaux V, Daviet L, Formstecher E, Hamburger A, Filippini F, D'Esposito M, Galli T (červenec 2003). „Duální mechanismus ovládající lokalizaci a funkci exocytických v-SNARE“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (15): 9011–6. doi:10.1073 / pnas.1431910100. PMC 166429. PMID 12853575.

[pmid9614185-8] Galli T, Zahraoui A, Vaidyanathan VV, Raposo G, Tian JM, Karin M, Niemann H, Louvard D (červen 1998). "Nový tetanový neurotoxin-necitlivý vezikulární asociovaný membránový protein v SNARE komplexech apikální plazmatické membrány epiteliálních buněk". Mol. Biol. Buňka. 9 (6): 1437–48. doi:10,1091 / mbc.9.6.1437. PMC 25366. PMID 9614185.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]