SWAP proteinová doména - SWAP protein domain

Surp
PDB 1ug0 EBI.jpg
Struktura řešení SURP domény v BAB30904.
Identifikátory
SymbolSurp
PfamPF01805
InterProIPR000061

v molekulární biologie, proteinová doména SWAP je odvozen z termínu Suppressor-of-White-APricot, regulátor sestřihu z modelový organismus Drosophila melanogaster. The proteinová doména se nachází v regulačních orgánech, které řídí sestřih. Nachází se v sestřih regulační bílkoviny.[1]Když je gen vyjádřený the DNA musí být přepsal do messenger RNA (mRNA). Někdy však obsahuje pojmenované intervenující nebo přerušující sekvence introny. mRNA sestřih pomáhá tyto sekvence odstranit a zanechává příznivější sekvenci. Spojování mRNA je zásadní událostí v post-transkripční modifikace proces genová exprese.[2] SWAP pomáhá řídit tento proces ve všech buňkách kromě gamety.

Funkce

Úlohou SWAP proteinové domény je kontrolovat pre- nezávislé na pohlavímRNA zpracování v somatický buňky, tj. v každé buňce kromě pohlavní buňky To zahrnuje autoregulaci, přičemž reguluje sestřih vlastní pre-mRNA.[3] Savčí homolog SWAP působí jako gen regulovaný hormony štítné žlázy. To znamená, že je řízen štítnou žlázou.[4][5]

Struktura

SWAP bílkoviny sdílet kolineárně seřazenou sérii románů sekvenční motivy.[3] To znamená, že byly v průběhu času konzervovány. Protein SWAP v různých organismech sdílí určitou podobnost, pokud jde o sekvenci, a mohl být v určitém bodě evoluční historie příbuzný.

Reference

  1. ^ Denhez F, Lafyatis R (červen 1994). „Zachování regulovaného alternativního sestřihu a identifikace funkčních domén v homologech obratlovců k regulátoru sestřihu Drosophila, supresoru bílé-meruňky“. The Journal of Biological Chemistry. 269 (23): 16170–9. PMID  8206918.
  2. ^ Clancy, Suzanne (2008). „RNA Splicing: Introns, Exons and Spliceosome“. Přírodní výchova. 1 (1). Citováno 31. března 2011.
  3. ^ A b Spikes DA, Kramer J, Bingham PM, Van Doren K (říjen 1994). „SWAP pre-mRNA sestřihové regulátory jsou nová, stará rodina proteinů, která sdílí vysoce konzervovaný sekvenční motiv s rodinou prp21 konstitutivních sestřihových proteinů“. Výzkum nukleových kyselin. 22 (21): 4510–9. doi:10.1093 / nar / 22.21.4510. PMC  308487. PMID  7971282.
  4. ^ Cuadrado A, Bernal J, Muñoz A (srpen 1999). „Identifikace savčího homologu regulátoru sestřihu Suppressor-of-white-meruňka jako genu regulovaného hormonem štítné žlázy“. Výzkum mozku. Molekulární výzkum mozku. 71 (2): 332–40. doi:10.1016 / s0169-328x (99) 00212-0. PMID  10521587.
  5. ^ Khan A, Sulkowski ZL, Chen T, Zavacki AM, Sajdel-Sulkowska EM (červen 2012). „Změny genové exprese závislé na hormonu štítné žlázy závislé na pohlaví po perinatální expozici thimerosalu u potkanů“. Journal of Physiology and Pharmacology. 63 (3): 277–83. PMID  22791642.
Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR000061