SSX2 - SSX2

SSX2B
Identifikátory
Aliasy	SSX2B, CT5.2, CT5.2b, HOM-MEL-40, SSX, synoviální sarkom, bod zlomu X 2B, člen rodiny SSX 2B
Externí ID	HomoloGene: 133226 Genové karty: SSX2B
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	52,790,305 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106; • vazba nukleové kyseliny;
Buněčná složka	• intracelulární; • buněčné jádro;
Biologický proces	• negativní regulace transkripce templátované nukleovou kyselinou; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	727837
	n / a
	ENSG00000268447
	n / a
	Q16385
	n / a
	NM_001278702; NM_001164417; NM_001278701
	n / a
	NP_001157889; NP_001265630; NP_001265631
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Protein SSX2 je protein že u lidí je kódován SSX2 gen.^[3]^[4]

Produkt tohoto genu patří do rodiny vysoce homologních synoviální sarkom, hraniční bod X (SSX) bílkoviny. Tyto proteiny mohou fungovat jako transkripční represory. Jsou také schopni vyvolat spontánně Humorný a buněčné imunitní odpovědi u pacientů s rakovinou a jsou potenciálně užitečnými cíli v imunoterapie proti rakovinové vakcíně. SSX1, SSX2 a SSX4 geny byly zapojeny do t (X; 18) chromozomální translokace charakteristicky nalezený ve všech synoviální sarkomy. Tato translokace vede k fúzi translokačního genu synoviálního sarkomu chromozom 18 k jednomu z genů SSX chromozom X. Kódované hybridní proteiny jsou pravděpodobně zodpovědné za transformační aktivitu. Dva varianty přepisu kódování odlišné izoformy byly identifikovány pro tento gen.^[4]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000268447 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Tureci O, Sahin U, Schobert I, Koslowski M, Scmitt H, Schild HJ, Stenner F, Seitz G, Rammensee HG, Pfreundschuh M (listopad 1996). „Gen SSX-2, který se podílí na translokaci synoviálních sarkomů t (X; 18), kóduje antigen lidského nádoru HOM-MEL-40.“ Cancer Res. 56 (20): 4766–72. PMID 8840996.
^ ^A ^b „Entrez Gene: SSX2 synoviální sarkom, X breakpoint 2“.

Další čtení

Wu LQ, Lu Y, Wang XF a kol. (2006). "Exprese antigenu rakoviny varlat (CTA) v nádorových tkáních a periferní krvi čínských pacientů s hepatocelulárním karcinomem". Life Sci. 79 (8): 744–8. doi:10.1016 / j.lfs.2006.02.024. PMID 16546222.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Fernebro J, Francis P, Edén P a kol. (2006). "Profily genové exprese se vztahují k fúznímu typu SS18 / SSX v synoviálním sarkomu." Int. J. Cancer. 118 (5): 1165–72. doi:10.1002 / ijc.21475. PMID 16152617.
Ross MT, Grafham DV, Coffey AJ a kol. (2005). „Sekvence DNA lidského chromozomu X“. Příroda. 434 (7031): 325–37. doi:10.1038 / nature03440. PMC 2665286. PMID 15772651.
Tvrdík D, Povýsil C, Svatosová J, Dundr P (2005). „Molekulární diagnostika synoviálního sarkomu: RT-PCR detekce fúzních transkriptů SYT-SSX1 / 2 v tkáni zalité v parafinu“. Med. Sci. Monit. 11 (3): MT1–7. PMID 15735574.
Ayyoub M, Merlo A, Hesdorffer CS a kol. (2005). "Výrazné, ale překrývající se pomocné epitopy T v oblasti 37-58 SSX-2". Clin. Immunol. 114 (1): 70–8. doi:10.1016 / j.clim.2004.08.014. PMID 15596411.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Güre AO, Wei IJ, Old LJ, Chen YT (2002). "Rodina genů SSX: charakterizace 9 kompletních genů". Int. J. Cancer. 101 (5): 448–53. doi:10.1002 / ijc.10634. PMID 12216073.
Yang K, Lui WO, Xie Y a kol. (2002). „Koexistence fúzí SYT-SSX1 a SYT-SSX2 v synoviálních sarkomech“. Onkogen. 21 (26): 4181–90. doi:10.1038 / sj.onc.1205569. PMID 12037676.
de Bruijn DR, dos Santos NR, Kater-Baats E a kol. (2002). „Protein SSX2 související s rakovinou interaguje s lidským homologem interakce GTPázy podobného Ras, RAB3IP, a novým jaderným proteinem SSX2IP.“ Geny Chromozomy Rakovina. 34 (3): 285–98. doi:10,1002 / gcc.10073. PMID 12007189.
Brodin B, Haslam K, Yang K a kol. (2001). "Klonování a charakterizace sestřihových variant fúzních transkriptů synoviálního sarkomu: SYT / SSX4, SYT / SSX4v a SYT / SSX2v. Možná regulační role produktu fúzního genu v expresi SYT divokého typu". Gen. 268 (1–2): 173–82. doi:10.1016 / S0378-1119 (01) 00412-7. PMID 11368913.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A a kol. (2001). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. EMBO Rep. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
dos Santos NR, Torensma R, de Vries TJ, et al. (2000). "Heterogenní exprese antigenů SSX rakovina / varlata v lidských melanomových lézích a buněčných liniích". Cancer Res. 60 (6): 1654–62. PMID 10749136.
dos Santos NR, de Bruijn DR, Balemans M, et al. (1998). "Nukleární lokalizace SYT, SSX a fúzních proteinů SYT-SSX spojených se synoviálním sarkomem". Hučení. Mol. Genet. 6 (9): 1549–58. doi:10,1093 / hmg / 6,9,1549. PMID 9285793.
Shipley JM, Clark J, Crew AJ a kol. (1994). „Translokace t (X; 18) (p11.2; q11.2) nalezená v lidských synoviálních sarkomech zahrnuje dva odlišné lokusy na chromozomu X“. Onkogen. 9 (5): 1447–53. PMID 8152806.

Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000268447 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8840996-3] Tureci O, Sahin U, Schobert I, Koslowski M, Scmitt H, Schild HJ, Stenner F, Seitz G, Rammensee HG, Pfreundschuh M (listopad 1996). „Gen SSX-2, který se podílí na translokaci synoviálních sarkomů t (X; 18), kóduje antigen lidského nádoru HOM-MEL-40.“ Cancer Res. 56 (20): 4766–72. PMID 8840996.

[entrez-4] A ^b „Entrez Gene: SSX2 synoviální sarkom, X breakpoint 2“.

[1]

[2]

[3]

[4]