SRA1 - SRA1

SRA1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2MGX, 4NBO
Identifikátory
Aliasy	SRA1, SRA, SRAP, STRAA1, pp7684, aktivátor RNA steroidního receptoru 1
Externí ID	OMIM: 603819 MGI: 1344414 HomoloGene: 11906 Genové karty: SRA1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	140,558,252 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita koaktivátoru transkripce nukleárního receptoru závislá na ligandu; • steroidní receptor RNA aktivátor vazba RNA; • Vazba DNA;
Buněčná složka	• mikrotubulární cytoskelet; • mezibuněčný most; • buněčná membrána; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol; • cytoplazma; • ribonukleoprotein; • komplex regulátoru transkripce; • náběžná hrana buňky;
Biologický proces	• regulace apoptotického procesu; • diferenciace buněk; • pozitivní regulace aktivity receptoru; • buněčná proliferace; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • apoptotický proces; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • negativní regulace diferenciace myoblastů; • buněčná odpověď na estrogenový stimul; • pozitivní regulace transkripce templátované nukleovou kyselinou;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10011
	24068
	ENSG00000213523
	ENSMUSG00000006050
	Q9HD15
	Q80VJ2
	NM_001035235; NM_001253764
	NM_001164406; NM_025291
	NP_001030312; NP_001240693
	NP_001157878; NP_079567
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Aktivátor RNA steroidního receptoru 1 také známý jako protein aktivátoru RNA steroidního receptoru (SRAP) je a protein že u lidí je kódován SRA1 gen.^[4]^[5] MRNA transkribovaná z genu SRA1 je složkou obsahující komplex ribonukleoproteinů NCOA1. Tato funkční RNA také kóduje protein.^[6]

Funkce

Tento gen je zapojen do transkripční koaktivace podle steroidní receptor. V současné době existují údaje naznačující, že tento gen kóduje jak nekódující RNA, která funguje jako součást komplexu ribonukleoproteinů, tak mRNA kódující protein. Zvýšená exprese transkriptu i proteinu je spojena s rakovinou.^[5]

Interakce

SRA1 bylo prokázáno komunikovat s:

Ukázalo se, že SRAP interaguje se svým protějškem SRA RNA nepřímo s funkční substrukturou STR7 SRA RNA.^[9] Původně bylo navrženo, že obsahuje RRM, bylo prokázáno, že SRAP má na svém C-terminálním konci svazek šroubovice, zatímco N-terminál k této doméně se jeví jako nestrukturovaný.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000213523 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Lanz RB, McKenna NJ, Onate SA, Albrecht U, Wong J, Tsai SY, Tsai MJ, O'Malley BW (duben 1999). „Koaktivátor steroidních receptorů, SRA, funguje jako RNA a je přítomen v komplexu SRC-1“. Buňka. 97 (1): 17–27. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80711-4. PMID 10199399.
^ ^A ^b "Entrez Gene: SRA1 steroidní receptor RNA aktivátor 1".
^ Chooniedass-Kothari S, Emberley E, Hamedani MK, Troup S, Wang X, Czosnek A, Hube F, Mutawe M, Watson PH, Leygue E (květen 2004). „Aktivátor RNA steroidního receptoru je první funkční RNA kódující protein“. FEBS Dopisy. 566 (1–3): 43–7. doi:10.1016 / j.febslet.2004.03.104. PMID 15147866.
^ ^A ^b ^C Watanabe M, Yanagisawa J, Kitagawa H, Takeyama K, Ogawa S, Arao Y, Suzawa M, Kobayashi Y, Yano T, Yoshikawa H, Masuhiro Y, Kato S (březen 2001). „Podrodina proteinů DEAD-box vázajících RNA působí jako alfa koaktivátor estrogenového receptoru prostřednictvím N-terminální aktivační domény (AF-1) s RNA koaktivátorem, SRA“. Časopis EMBO. 20 (6): 1341–52. doi:10.1093 / emboj / 20.6.1341. PMC 145523. PMID 11250900.
^ Shi Y, Downes M, Xie W, Kao HY, Ordentlich P, Tsai CC, Hon M, Evans RM (květen 2001). „Sharp, indukovatelný kofaktor, který integruje represi a aktivaci jaderných receptorů“. Geny a vývoj. 15 (9): 1140–51. doi:10,1101 / gad. 871201. PMC 312688. PMID 11331609.
^ Hubé F, Velasco G, Rollin J, Furling D, Francastel C (leden 2011). „Protein aktivátoru RNA steroidního receptoru se váže na SRA RNA zprostředkovanou aktivaci MyoD a diferenciaci svalů a působí proti ní“. Výzkum nukleových kyselin. 39 (2): 513–25. doi:10.1093 / nar / gkq833. PMC 3025577. PMID 20855289.
^ Bilinovich SM, Davis CM, Morris DL, Ray LA, Prokop JW, Buchan GJ, Leeper TC (duben 2014). „C-koncová doména SRA1p má násobek více podobný PRP18 než RRM a neváže se přímo na oblast SRA1 RNA STR7“. Journal of Molecular Biology. 426 (8): 1753–65. doi:10.1016 / j.jmb.2014.01.007. PMID 24486611.

Další čtení

Ulveling D, Francastel C, Hubé F (duben 2011). „Když je jedna lepší než dvě: RNA s dvojí funkcí“ (PDF). Biochimie. 93 (4): 633–44. doi:10.1016 / j.biochi.2010.11.004. PMID 21111023.
Hubé F, Velasco G, Rollin J, Furling D, Francastel C (leden 2011). „Protein aktivátoru RNA steroidního receptoru se váže na SRA RNA zprostředkovanou aktivaci MyoD a diferenciaci svalů a působí proti ní“. Výzkum nukleových kyselin. 39 (2): 513–25. doi:10.1093 / nar / gkq833. PMC 3025577. PMID 20855289.
Cooper C, Guo J, Yan Y, Chooniedass-Kothari S, Hube F, Hamedani MK, Murphy LC, Myal Y, Leygue E (červenec 2009). „Zvýšení relativní exprese endogenního nekódujícího steroidního receptoru RNA aktivátoru (SRA) v lidských buňkách rakoviny prsu pomocí modifikovaných oligonukleotidů“. Výzkum nukleových kyselin. 37 (13): 4518–31. doi:10.1093 / nar / gkp441. PMC 2715257. PMID 19483093.
Hube F, Guo J, Chooniedass-Kothari S, Cooper C, Hamedani MK, Dibrov AA, Blanchard AA, Wang X, Deng G, Myal Y, Leygue E (červenec 2006). „Alternativní sestřih prvního intronu aktivátoru RNA steroidního receptoru (SRA) se podílí na generování kódujících a nekódujících izoforem RNA v buněčných liniích rakoviny prsu“. DNA a buněčná biologie. 25 (7): 418–28. doi:10.1089 / dna.2006.25.418. hdl:1807.1/831. PMID 16848684.
Leygue E, Dotzlaw H, Watson PH, Murphy LC (září 1999). "Exprese aktivátoru RNA steroidního receptoru v lidských nádorech prsu". Výzkum rakoviny. 59 (17): 4190–3. PMID 10485452.
Murphy LC, Simon SL, Parkes A, Leygue E, Dotzlaw H, Snell L, Troup S, Adeyinka A, Watson PH (listopad 2000). "Změněná exprese regulátorů estrogenových receptorů během tumorigeneze lidského prsu". Výzkum rakoviny. 60 (22): 6266–71. PMID 11103781.
Cavarretta IT, Mukopadhyay R, Lonard DM, Cowsert LM, Bennett CF, O'Malley BW, Smith CL (únor 2002). „Snížení exprese koaktivátoru antisense oligodeoxynukleotidy inhibuje transkripční aktivitu ERalpha a proliferaci MCF-7“. Molekulární endokrinologie. 16 (2): 253–70. doi:10.1210 / mě.16.2.253. PMID 11818499.
Kučera T, Waltner-Law M, Scott DK, Prasad R, Granner DK (červenec 2002). „Bodová mutace transaktivační domény AF2 glukokortikoidního receptoru narušuje jeho interakci s koaktivátorem steroidních receptorů 1“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (29): 26098–102. doi:10,1074 / jbc.M204013200. PMID 12118039.
Ueda T, Mawji NR, Bruchovsky N, Sadar MD (říjen 2002). „Na ligandu nezávislá aktivace androgenového receptoru interleukinem-6 a role koaktivátoru steroidních receptorů-1 v buňkách rakoviny prostaty“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (41): 38087–94. doi:10,1074 / jbc.M203313200. PMID 12163482.
Lanz RB, Razani B, Goldberg AD, O'Malley BW (prosinec 2002). „Výrazné motivy RNA jsou důležité pro koaktivaci receptorů steroidních hormonů aktivátorem steroidních receptorů RNA (SRA)“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (25): 16081–6. doi:10.1073 / pnas.192571399. PMC 138568. PMID 12444263.
Emberley E, Huang GJ, Hamedani MK, Czosnek A, Ali D, Grolla A, Lu B, Watson PH, Murphy LC, Leygue E (únor 2003). "Identifikace nových lidských kódujících izoforem RNA steroidního receptoru aktivátoru". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 301 (2): 509–15. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 03070-X. PMID 12565891.
Watkins RE, Davis-Searles PR, Lambert MH, Redinbo MR (srpen 2003). „Vazba koaktivátoru podporuje specifickou interakci mezi ligandem a receptorem pregnanu X“. Journal of Molecular Biology. 331 (4): 815–28. doi:10.1016 / S0022-2836 (03) 00795-2. PMID 12909012.
Deblois G, Giguère V (červen 2003). "Ligand nezávislá koaktivace ERalpha AF-1 aktivátorem steroidního receptoru RNA (SRA) prostřednictvím aktivace MAPK". The Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology. 85 (2–5): 123–31. doi:10.1016 / S0960-0760 (03) 00225-5. PMID 12943696. S2CID 34194523.
Lanz RB, Chua SS, Barron N, Söder BM, DeMayo F, O'Malley BW (říjen 2003). „Aktivátor RNA steroidního receptoru stimuluje proliferaci i apoptózu in vivo“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (20): 7163–76. doi:10.1128 / MCB.23.20.7163-7176.2003. PMC 230309. PMID 14517287.
Fleming FJ, Hill AD, McDermott EW, O'Higgins NJ, Young LS (leden 2004). „Diferenciální nábor koregulátorových proteinů koaktivátor steroidních receptorů-1 a umlčovací mediátor pro receptory retinoidů a štítné žlázy na prvek odpovědi estrogenový receptor na estrogen beta-estradiolem a 4-hydroxytamoxifenem u lidské rakoviny prsu“. The Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism. 89 (1): 375–83. doi:10.1210 / jc.2003-031048. PMID 14715875.
Xu B, Koenig RJ (srpen 2004). „Doména vázající RNA v receptoru hormonu štítné žlázy zvyšuje transkripční aktivaci“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (32): 33051–6. doi:10,1074 / jbc.M404930200. PMID 15180993.
Zhao X, Patton JR, Davis SL, Florence B, Ames SJ, Spanjaard RA (srpen 2004). „Regulace aktivity jaderného receptoru pseudouridinsyntázou posttranskripční modifikací aktivátoru RNA steroidního receptoru“. Molekulární buňka. 15 (4): 549–58. doi:10.1016 / j.molcel.2004.06.044. PMID 15327771.
Coleman KM, Lam V, Jaber BM, Lanz RB, Smith CL (říjen 2004). „SRA koaktivace estrogenového receptoru-alfa je nezávislá na fosforylaci a zvyšuje aktivitu agonisty 4-hydroxytamoxifenu“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 323 (1): 332–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.08.090. PMID 15351741.

externí odkazy

SRA1 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
SRA1 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9HD15 (Aktivátor 1 lidského steroidního receptoru RNA) na PDBe-KB.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q80VJ2 (Aktivátor RNA myšího steroidního receptoru 1) na PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000213523 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10199399-4] Lanz RB, McKenna NJ, Onate SA, Albrecht U, Wong J, Tsai SY, Tsai MJ, O'Malley BW (duben 1999). „Koaktivátor steroidních receptorů, SRA, funguje jako RNA a je přítomen v komplexu SRC-1“. Buňka. 97 (1): 17–27. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80711-4. PMID 10199399.

[entrez-5] A ^b "Entrez Gene: SRA1 steroidní receptor RNA aktivátor 1".

[pmid15147866-6] Chooniedass-Kothari S, Emberley E, Hamedani MK, Troup S, Wang X, Czosnek A, Hube F, Mutawe M, Watson PH, Leygue E (květen 2004). „Aktivátor RNA steroidního receptoru je první funkční RNA kódující protein“. FEBS Dopisy. 566 (1–3): 43–7. doi:10.1016 / j.febslet.2004.03.104. PMID 15147866.

[pmid11250900-7] A ^b ^C Watanabe M, Yanagisawa J, Kitagawa H, Takeyama K, Ogawa S, Arao Y, Suzawa M, Kobayashi Y, Yano T, Yoshikawa H, Masuhiro Y, Kato S (březen 2001). „Podrodina proteinů DEAD-box vázajících RNA působí jako alfa koaktivátor estrogenového receptoru prostřednictvím N-terminální aktivační domény (AF-1) s RNA koaktivátorem, SRA“. Časopis EMBO. 20 (6): 1341–52. doi:10.1093 / emboj / 20.6.1341. PMC 145523. PMID 11250900.

[pmid11331609-8] Shi Y, Downes M, Xie W, Kao HY, Ordentlich P, Tsai CC, Hon M, Evans RM (květen 2001). „Sharp, indukovatelný kofaktor, který integruje represi a aktivaci jaderných receptorů“. Geny a vývoj. 15 (9): 1140–51. doi:10,1101 / gad. 871201. PMC 312688. PMID 11331609.

[pmid20855289-9] Hubé F, Velasco G, Rollin J, Furling D, Francastel C (leden 2011). „Protein aktivátoru RNA steroidního receptoru se váže na SRA RNA zprostředkovanou aktivaci MyoD a diferenciaci svalů a působí proti ní“. Výzkum nukleových kyselin. 39 (2): 513–25. doi:10.1093 / nar / gkq833. PMC 3025577. PMID 20855289.

[10] Bilinovich SM, Davis CM, Morris DL, Ray LA, Prokop JW, Buchan GJ, Leeper TC (duben 2014). „C-koncová doména SRA1p má násobek více podobný PRP18 než RRM a neváže se přímo na oblast SRA1 RNA STR7“. Journal of Molecular Biology. 426 (8): 1753–65. doi:10.1016 / j.jmb.2014.01.007. PMID 24486611.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]