DDX17 - DDX17
Pravděpodobná ATP závislá RNA helikáza DDX17 (p72) je enzym že u lidí je kódován DDX17 gen.[5][6]
Funkce
DEAD box proteiny, charakterizované konzervovaným motivem Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), jsou domnělé RNA helikázy. Jsou zapojeny do řady buněčných procesů zahrnujících změnu sekundární struktury RNA, jako je iniciace translace, nukleární a mitochondriální sestřih a ribozom a spliceosome shromáždění. Na základě jejich distribučních vzorců se někteří členové této rodiny považují za členy embryogeneze, spermatogeneze a buněčného růstu a dělení. Tento gen kóduje DEAD box protein, což je ATPáza aktivovaná různými druhy RNA, ale ne dsDNA. Tento protein a ten kódovaný genem DDX5 jsou si navzájem bližší než s jakýmkoli jiným členem rodiny DEAD boxů. Alternativní sestřih tohoto genu generuje 2 varianty transkriptu kódující různé izoformy s tím, že delší transkript uvádí, že také iniciuje translaci v počátečním místě jiné než AUG (CUG).[6]
Interakce
DDX17 bylo prokázáno komunikovat s:
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000100201 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000055065 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Lamm GM, Nicol SM, Fuller-Pace FV, Lamond AI (prosinec 1996). „p72: lidský jaderný DEAD box protein vysoce příbuzný p68“. Nucleic Acids Res. 24 (19): 3739–47. doi:10.1093 / nar / 24.19.3739. PMC 146168. PMID 8871553.
- ^ A b „Entrez Gene: DDX17 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptid 17".
- ^ Ogilvie VC, Wilson BJ, Nicol SM, Morrice NA, Saunders LR, Barber GN, Fuller-Pace FV (2003). „Vysoce příbuzné RNA helikázy DEAD box p68 a p72 existují jako heterodimery v buňkách“. Nucleic Acids Res. 31 (5): 1470–80. doi:10,1093 / nar / gkg236. PMC 149829. PMID 12595555.
- ^ Wilson BJ, Giguère V (listopad 2007). „Identifikace nových partnerů dráhy helikáz p68 a p72 pomocí metaanalýzy Oncomine“. BMC Genomics. 8: 419. doi:10.1186/1471-2164-8-419. PMC 3225811. PMID 18005418.
- ^ Wilson BJ, Bates GJ, Nicol SM, Gregory DJ, Perkins ND, Fuller-Pace FV (srpen 2004). „Helikázy p68 a p72 DEAD box RNA interagují s HDAC1 a potlačují transkripci způsobem specifickým pro promotor“. BMC Mol. Biol. 5: 11. doi:10.1186/1471-2199-5-11. PMC 514542. PMID 15298701.
Další čtení
- Lüking A, Stahl U, Schmidt U (1998). "Rodina proteinů RNA helikáz". Krit. Biochem. Mol. Biol. 33 (4): 259–96. doi:10.1080/10409239891204233. PMID 9747670.
- Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anální. Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
- Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (1997). "Sekvenování cDNA ve velkém měřítku". Genome Res. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
- Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, Bruskiewich R, Beare DM, Clamp M, Smink LJ, Ainscough R, Almeida JP, Babbage A, Bagguley C, Bailey J, Barlow K, Bates KN , Beasley O, Bird CP, Blakey S, Bridgeman AM, Buck D, Burgess J, Burrill WD, O'Brien KP (1999). „Sekvence DNA lidského chromozomu 22“. Příroda. 402 (6761): 489–95. doi:10.1038/990031. PMID 10591208.
- Uhlmann-Schiffler H, Rössler OG, Stahl H (2002). „MRNA z DEAD box proteinu p72 je alternativně přeložena do 82-kDa RNA helikázy“. J. Biol. Chem. 277 (2): 1066–75. doi:10,1074 / jbc.M107535200. PMID 11675387.
- Hönig A, Auboeuf D, Parker MM, O'Malley BW, Berget SM (2002). "Regulace alternativního sestřihu pomocí ATP-DEAD-Box RNA Helicase p72". Mol. Buňka. Biol. 22 (16): 5698–707. doi:10.1128 / MCB.22.16.5698-5707.2002. PMC 133985. PMID 12138182.
- Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (2002). „Proteomický přístup k identifikaci proteinů vázajících proliferující buněčný jaderný antigen (PCNA) v lyzátech lidských buněk. Identifikace lidského komplexu CHL12 / RFCs2-5 jako nového proteinu vázajícího PCNA“. J. Biol. Chem. 277 (43): 40362–7. doi:10,1074 / jbc.M206194200. PMID 12171929.
- Lee CG (2002). „RH70, obousměrná RNA helikáza, čistí společně s U1snRNP“. J. Biol. Chem. 277 (42): 39679–83. doi:10.1074 / jbc.C200337200. PMID 12193588.
- Ogilvie VC, Wilson BJ, Nicol SM, Morrice NA, Saunders LR, Barber GN, Fuller-Pace FV (2003). „Vysoce příbuzné RNA helikázy DEAD box p68 a p72 existují jako heterodimery v buňkách“. Nucleic Acids Res. 31 (5): 1470–80. doi:10,1093 / nar / gkg236. PMC 149829. PMID 12595555.
- Fujita T, Kobayashi Y, Wada O, Tateishi Y, Kitada L, Yamamoto Y, Takashima H, Murayama A, Yano T, Baba T, Kato S, Kawabe Y, Yanagisawa J (2003). „Plná aktivace funkce 1 aktivace estrogenového receptoru alfa indukuje proliferaci buněk rakoviny prsu“. J. Biol. Chem. 278 (29): 26704–14. doi:10,1074 / jbc.M301031200. PMID 12738788.
- Li J, Hawkins IC, Harvey CD, Jennings JL, Link AJ, Patton JG (2003). „Regulace alternativního sestřihu pomocí SRrp86 a jeho interakčních proteinů“. Mol. Buňka. Biol. 23 (21): 7437–47. doi:10.1128 / MCB.23.21.7437-7447.2003. PMC 207616. PMID 14559993.
- Wilson BJ, Bates GJ, Nicol SM, Gregory DJ, Perkins ND, Fuller-Pace FV (2005). „Helikázy p68 a p72 DEAD box RNA interagují s HDAC1 a potlačují transkripci způsobem specifickým pro promotor“. BMC Mol. Biol. 5: 11. doi:10.1186/1471-2199-5-11. PMC 514542. PMID 15298701.
- Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (2004). "Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace". Curr. Biol. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660.
- Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M, Sakakibara Y, Chiba J, Mizushima-Sugano J, Nakai K, Sugano S (2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových regionech“. Genome Res. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
- Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG, Goward ME, Aguado B, Mallya M, Mokrab Y, Huckle EJ, Beare DM, Dunham I (2005). „Přístup ke klonování lidského ORFeome založený na anotaci genomu“. Genome Biol. 5 (10): R84. doi:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.
Tento článek o gen na lidský chromozom 22 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |