SH2D3C - SH2D3C

SH2D3C
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasySH2D3C, Sh2d3c, Chat, Nsp3, Shep1, PRO34088, doména SH2 obsahující 3C
Externí IDOMIM: 604722 MGI: 1351631 HomoloGene: 69145 Genové karty: SH2D3C
Umístění genu (člověk)
Chromozom 9 (lidský)
Chr.Chromozom 9 (lidský)[1]
Chromozom 9 (lidský)
Genomické umístění pro SH2D3C
Genomické umístění pro SH2D3C
Kapela9q34.11Start127,738,317 bp[1]
Konec127,778,710 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001252547
NM_013781

RefSeq (protein)

NP_001239476
NP_038809

Místo (UCSC)Chr 9: 127,74 - 127,78 MbChr 2: 32,72 - 32,76 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

SH2 doména obsahující 3C, také známý jako SH2D3C, je protein že u lidí je kódován SH2D3C gen.[5]

Funkce

Sh2d3c je gen na lidském chromozomu 9, který kóduje SH2 doména obsahující protein známý jako NSP3. Myší homolog se nachází na chromozomu 2. Rodina proteinů NSP (nový protein obsahující SH2) obsahuje tři členy, NSP1, NSP2 a NSP3 (tento protein), z nichž všechny mají podobnou architekturu, s N-terminál SH2 doména, oblast bohatá na prolin serin, která obsahuje konsensuální sekvence pro MAP kináza substráty a konzervované C-konec, který se váže na Cas rodina adaptorových proteinů a také ukazuje homologii k GEF domén.

NSP3 byl původně identifikován třemi nezávislými skupinami výzkumníků.[6][7][8] Ukázalo se, že myší homolog NSP3 má dvě odlišné izoformy generované alternativním sestřihem, které jsou exprimovány v různých tkáních. Kratší izoforma, známá jako Chat (Cas /Hef1 asociovaný signální měnič) je exprimován v mozku, plicích, srdci, ledvinách, svalech, játrech a střevech, zatímco větší izoforma, známá jako Chat-H (dále jen „H“ pro hematopoetiku), je exprimována ve slezině, brzlíku a lymfatické uzliny.[8] Tyto dvě izoformy se liší pouze svým N-koncem, což se ukázalo u jedné skupiny jako důležité pro lokalizaci membrány.[9]

Prostřednictvím jeho interakce s Hef1 Chat-H se ukázal jako důležitý regulátor adheze lymfocytů, působící proti proudu Rap1 v aktivační cestě integrinu.[9]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000095370 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000059013 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ „Entrez Gene: SH2D3C SH2 doména obsahující 3C“.
  6. ^ Lu Y, Brush J, Stewart TA (duben 1999). „NSP1 definuje novou rodinu adaptorových proteinů spojujících receptory integrinu a tyrosin kinázy se signální cestou c-Jun N-terminální kinázy / stresem aktivované protein kinázy“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (15): 10047–52. doi:10.1074 / jbc.274.15.10047. PMID  10187783.
  7. ^ Dodelet VC, Pazzagli C, Zisch AH, Hauser CA, Pasquale EB (listopad 1999). „Nový signalizační meziprodukt, SHEP1, přímo spojuje receptory Eph s R-Ras a Rap1A.“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (45): 31941–6. doi:10.1074 / jbc.274.45.31941. PMID  10542222.
  8. ^ A b Sakakibara A, Hattori S (březen 2000). „Chat, protein adaptéru asociovaný s Cas / HEF1, který integruje více signálních drah“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (9): 6404–10. doi:10.1074 / jbc.275.9.6404. PMID  10692442.
  9. ^ A b Regelmann AG, Danzl NM, Wanjalla C, Alexandropoulos K (prosinec 2006). „Hematopoetická izoforma signálního převodníku asociovaného s Cas-Hef1 reguluje chemokiny indukovanou signalizaci naruby a přenos T buněk“. Imunita. 25 (6): 907–18. doi:10.1016 / j.immuni.2006.09.014. PMID  17174122.

Další čtení

externí odkazy