SH2D3C - SH2D3C

SH2D3C
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3T6G
Identifikátory
Aliasy	SH2D3C, Sh2d3c, Chat, Nsp3, Shep1, PRO34088, doména SH2 obsahující 3C
Externí ID	OMIM: 604722 MGI: 1351631 HomoloGene: 69145 Genové karty: SH2D3C
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	127,778,710 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	32,755,512 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita faktoru výměny guanyl-nukleotidů;
Buněčná složka	• cytoplazma; • membrána;
Biologický proces	• malá transdukce signálu zprostředkovaná GTPázou; • JNK kaskáda; • pozitivní regulace přenosu signálu; • pozitivní regulace fosforylace peptidyl-serinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10044
	27387
	ENSG00000095370
	ENSMUSG00000059013
	Q8N5H7
	Q9QZS8
NM_001142531; NM_001142532; NM_001142533; NM_001142534; NM_001252334;
	NM_005489; NM_170600
	NM_001252547; NM_013781
NP_001136003; NP_001136004; NP_001136005; NP_001136006; NP_001239263;
	NP_005480; NP_733745
	NP_001239476; NP_038809
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

SH2 doména obsahující 3C, také známý jako SH2D3C, je protein že u lidí je kódován SH2D3C gen.^[5]

Funkce

Sh2d3c je gen na lidském chromozomu 9, který kóduje SH2 doména obsahující protein známý jako NSP3. Myší homolog se nachází na chromozomu 2. Rodina proteinů NSP (nový protein obsahující SH2) obsahuje tři členy, NSP1, NSP2 a NSP3 (tento protein), z nichž všechny mají podobnou architekturu, s N-terminál SH2 doména, oblast bohatá na prolin serin, která obsahuje konsensuální sekvence pro MAP kináza substráty a konzervované C-konec, který se váže na Cas rodina adaptorových proteinů a také ukazuje homologii k GEF domén.

NSP3 byl původně identifikován třemi nezávislými skupinami výzkumníků.^[6]^[7]^[8] Ukázalo se, že myší homolog NSP3 má dvě odlišné izoformy generované alternativním sestřihem, které jsou exprimovány v různých tkáních. Kratší izoforma, známá jako Chat (Cas /Hef1 asociovaný signální měnič) je exprimován v mozku, plicích, srdci, ledvinách, svalech, játrech a střevech, zatímco větší izoforma, známá jako Chat-H (dále jen „H“ pro hematopoetiku), je exprimována ve slezině, brzlíku a lymfatické uzliny.^[8] Tyto dvě izoformy se liší pouze svým N-koncem, což se ukázalo u jedné skupiny jako důležité pro lokalizaci membrány.^[9]

Prostřednictvím jeho interakce s Hef1 Chat-H se ukázal jako důležitý regulátor adheze lymfocytů, působící proti proudu Rap1 v aktivační cestě integrinu.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000095370 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000059013 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: SH2D3C SH2 doména obsahující 3C“.
^ Lu Y, Brush J, Stewart TA (duben 1999). „NSP1 definuje novou rodinu adaptorových proteinů spojujících receptory integrinu a tyrosin kinázy se signální cestou c-Jun N-terminální kinázy / stresem aktivované protein kinázy“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (15): 10047–52. doi:10.1074 / jbc.274.15.10047. PMID 10187783.
^ Dodelet VC, Pazzagli C, Zisch AH, Hauser CA, Pasquale EB (listopad 1999). „Nový signalizační meziprodukt, SHEP1, přímo spojuje receptory Eph s R-Ras a Rap1A.“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (45): 31941–6. doi:10.1074 / jbc.274.45.31941. PMID 10542222.
^ ^A ^b Sakakibara A, Hattori S (březen 2000). „Chat, protein adaptéru asociovaný s Cas / HEF1, který integruje více signálních drah“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (9): 6404–10. doi:10.1074 / jbc.275.9.6404. PMID 10692442.
^ ^A ^b Regelmann AG, Danzl NM, Wanjalla C, Alexandropoulos K (prosinec 2006). „Hematopoetická izoforma signálního převodníku asociovaného s Cas-Hef1 reguluje chemokiny indukovanou signalizaci naruby a přenos T buněk“. Imunita. 25 (6): 907–18. doi:10.1016 / j.immuni.2006.09.014. PMID 17174122.

Další čtení

Blízko RI, Zhang Y, Makkinje A, Vanden Borre P, Lerner A (září 2007). „AND-34 / BCAR3 se liší od ostatních NSP homologů indukcí anti-estrogenové rezistence, aktivací promotoru cyklinu D1 a změnou morfologie buněk rakoviny prsu“. Journal of Cellular Physiology. 212 (3): 655–65. doi:10.1002 / jcp.21059. PMC 2640322. PMID 17427198.
Vervoort VS, Roselli S, Oshima RG, Pasquale EB (duben 2007). „Sestřihové varianty a vzorce exprese SHEP1, BCAR3 a NSP1, genové rodiny zapojené do signalizace integrinu a receptoru tyrosinkinázy“. Gen. 391 (1–2): 161–70. doi:10.1016 / j.gene.2006.12.016. PMC 1876674. PMID 17270363.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Dail M, Kalo MS, Seddon JA, Côté JF, Vuori K, Pasquale EB (říjen 2004). „Funkce SHEP1 v buněčné migraci je narušena jedinou aminokyselinovou mutací, která narušuje asociaci s proteinem CAS lešení, ale ne s Ras GTPázami“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (40): 41892–902. doi:10,1074 / jbc.M402929200. PMID 15272013.
Sakakibara A, Hattori S, Nakamura S, Katagiri T (únor 2003). „Nový protein hematopoetického adaptéru, Chat-H, pozitivně reguluje produkci interleukinu-2 zprostředkovanou receptorem T buněk buňkami Jurkat“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (8): 6012–7. doi:10,1074 / jbc.M207942200. PMID 12486027.
Sakakibara A, Hattori S (březen 2000). „Chat, adaptérový protein asociovaný s Cas / HEF1, který integruje více signálních drah“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (9): 6404–10. doi:10.1074 / jbc.275.9.6404. PMID 10692442.
Dodelet VC, Pazzagli C, Zisch AH, Hauser CA, Pasquale EB (listopad 1999). „Nový signalizační meziprodukt, SHEP1, přímo spojuje receptory Eph s R-Ras a Rap1A.“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (45): 31941–6. doi:10.1074 / jbc.274.45.31941. PMID 10542222.
Lu Y, Brush J, Stewart TA (duben 1999). „NSP1 definuje novou rodinu adaptorových proteinů spojujících receptory integrinu a tyrosin kinázy se signální cestou c-Jun N-terminální kinázy / stresem aktivované protein kinázy“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (15): 10047–52. doi:10.1074 / jbc.274.15.10047. PMID 10187783.
Regelmann AG, Danzl NM, Wanjalla C, Alexandropoulos K (prosinec 2006). „Hematopoetická izoforma signálního převodníku asociovaného s Cas-Hef1 reguluje chemokiny indukovanou signalizaci naruby a přenos T buněk“. Imunita. 25 (6): 907–18. doi:10.1016 / j.immuni.2006.09.014. PMID 17174122.

externí odkazy

SH2D3C umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
SH2D3C podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000095370 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000059013 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: SH2D3C SH2 doména obsahující 3C“.

[6] Lu Y, Brush J, Stewart TA (duben 1999). „NSP1 definuje novou rodinu adaptorových proteinů spojujících receptory integrinu a tyrosin kinázy se signální cestou c-Jun N-terminální kinázy / stresem aktivované protein kinázy“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (15): 10047–52. doi:10.1074 / jbc.274.15.10047. PMID 10187783.

[7] Dodelet VC, Pazzagli C, Zisch AH, Hauser CA, Pasquale EB (listopad 1999). „Nový signalizační meziprodukt, SHEP1, přímo spojuje receptory Eph s R-Ras a Rap1A.“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (45): 31941–6. doi:10.1074 / jbc.274.45.31941. PMID 10542222.

[pmid10692442-8] A ^b Sakakibara A, Hattori S (březen 2000). „Chat, protein adaptéru asociovaný s Cas / HEF1, který integruje více signálních drah“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (9): 6404–10. doi:10.1074 / jbc.275.9.6404. PMID 10692442.

[pmid17174122-9] A ^b Regelmann AG, Danzl NM, Wanjalla C, Alexandropoulos K (prosinec 2006). „Hematopoetická izoforma signálního převodníku asociovaného s Cas-Hef1 reguluje chemokiny indukovanou signalizaci naruby a přenos T buněk“. Imunita. 25 (6): 907–18. doi:10.1016 / j.immuni.2006.09.014. PMID 17174122.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]