6. ZÁŘÍ - SEPT6

SEPTIN6
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2QAG
Identifikátory
Aliasy	SEPTIN6, SEP2, SEPT2, septin 6, SEPT6
Externí ID	OMIM: 300683 MGI: 1888939 HomoloGene: 62617 Genové karty: SEPTIN6
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	119,693,370 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	36,991,794 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • Vazba GTP; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita GTPázy; • GO: Aktivita molekulárního adaptéru 0032947;
Buněčná složka	• cytoplazma; • axonový konec; • kondenzovaný chromozomový kinetochor; • vřeteno; • střední část těla; • dělící rýha; • chromozom, centromerická oblast; • cytoskelet; • synaptický váček; • kinetochore; • chromozóm; • septinový prsten; • septinový límec; • komplex septin; • spermie mezikruží; • buněčná projekce; • pohyblivé cilium; • cilium; • presynapse; • mikrotubulární cytoskelet; • pole septinových vláken;
Biologický proces	• buněčný cyklus; • GO: virový proces 0022415; • buněčné dělení; • spermatogeneze; • diferenciace buněk; • mitotická cytokineze; • sestava septinového kruhu; • cilium morfogeneze; • cytokineze závislá na cytoskeletu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23157
	56526
	ENSG00000125354
	ENSMUSG00000050379
	Q14141
	Q9R1T4
	NM_015129; NM_145799; NM_145800; NM_145802
NM_001177323; NM_001177324; NM_001253706; NM_019942; NM_001359140;
	NM_001359141; NM_001359142
	NP_055944; NP_665798; NP_665799; NP_665801
NP_001170794; NP_001170795; NP_001240635; NP_064326; NP_001346069;
	NP_001346070; NP_001346071
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

6. září je protein že u lidí je kódován 6. ZÁŘÍ gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen je členem septin rodina GTPasy. Členové této rodiny jsou povinni pro cytokineze. Tento gen kóduje čtyři varianty transkriptu kódující tři odlišné izoformy. Byla identifikována další varianta transkriptu, ale její biologická platnost nebyla stanovena.^[7]

Klinický význam

Jedna verze pediatrické Akutní myeloidní leukémie je výsledkem a vzájemná translokace mezi chromozomy 11 a X, s hraničním bodem spojeným s geny kódujícími leukémii smíšené linie a proteiny septinu 2.^[7]

Interakce

SEPT6 bylo prokázáno komunikovat s SEPT2.^[8]^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000125354 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000050379 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nagase T, Seki N, Tanaka A, Ishikawa K, Nomura N (srpen 1995). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. IV. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0121-KIAA0160) odvozené analýzou cDNA klonů z lidské buněčné linie KG-1“. Výzkum DNA. 2 (4): 167–74, 199–210. doi:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID 8590280.
^ Xue J, Wang X, Malladi CS, Kinoshita M, Milburn PJ, Lengyel I, Rostas JA, Robinson PJ (duben 2000). „Fosforylace nového mozkového specifického septinu, G-septinu, pomocí cGMP-dependentní protein kinázy“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (14): 10047–56. doi:10.1074 / jbc.275.14.10047. PMID 10744683.
^ ^A ^b ^C „Entrez Gene: 6. září 6. září“.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
^ Surka MC, Tsang CW, Trimble WS (říjen 2002). „MSF u savčích septinů se lokalizuje pomocí mikrotubulů a je nezbytný pro dokončení cytokineze“. Molekulární biologie buňky. 13 (10): 3532–45. doi:10,1091 / mbc.E02-01-0042. PMC 129964. PMID 12388755.

Další čtení

Kinoshita A, Noda M, Kinoshita M (prosinec 2000). "Diferenciální lokalizace septinů v myším mozku". The Journal of Comparative Neurology. 428 (2): 223–39. doi:10.1002 / 1096-9861 (20001211) 428: 2 <223 :: AID-CNE3> 3.0.CO; 2-M. PMID 11064363.
Ono R, Taki T, Taketani T, Kawaguchi H, Taniwaki M, Okamura T, Kawa K, Hanada R, Kobayashi M, Hayashi Y (leden 2002). „SEPTIN6, lidský homolog s myší Septin6, je fúzován s MLL u kojenecké akutní myeloidní leukémie se složitými chromozomálními abnormalitami zahrnujícími 11q23 a Xq24“. Výzkum rakoviny. 62 (2): 333–7. PMID 11809673.
Slater DJ, Hilgenfeld E, Rappaport EF, Shah N, Meek RG, Williams WR, Lovett BD, Osheroff N, Autar RS, Ried T, Felix CA (červenec 2002). „Fúze MLL-SEPTIN6 se opakuje v nové translokaci chromozomů 3, X a 11 u kojenecké akutní myelomonocytické leukémie at (X; 11) u kojenecké akutní myeloidní leukémie a MLL genomický zlom v komplexním přeskupení MLL-SEPTIN6 je DNA topoizomeráza II. Místo štěpení ". Onkogen. 21 (30): 4706–14. doi:10.1038 / sj.onc.1205572. PMID 12096348.
Surka MC, Tsang CW, Trimble WS (říjen 2002). „MSF u savčích septinů se lokalizuje pomocí mikrotubulů a je nezbytný pro dokončení cytokineze“. Molekulární biologie buňky. 13 (10): 3532–45. doi:10,1091 / mbc.E02-01-0042. PMC 129964. PMID 12388755.
Sheffield PJ, Oliver CJ, Kremer BE, Sheng S, Shao Z, Macara IG (leden 2003). „Interakce borg / septin a shromáždění heterodimerů, trimerů a vláken savčích septinů“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (5): 3483–8. doi:10,1074 / jbc.M209701200. PMID 12446710.
Vega IE, Hsu SC (leden 2003). „Protein septinu Nedd5 se asociuje jak s komplexem exocyst, tak s mikrotubuly a narušení jeho aktivity GTPasy podporuje aberantní růst neuritů v buňkách PC12“. NeuroReport. 14 (1): 31–7. doi:10.1097/00001756-200301200-00006. PMID 12544826.
Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (květen 2003). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Přírodní biotechnologie. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801.
Koshelev YA, Kiselev SL, Georgiev GP (2004). „Interakce proteinu S100A4 (Mts1) se septiny 2. září, 6. září a 7. září in vitro“. Doklady Biochemistry and Biofhysics. 391: 195–7. doi:10.1023 / A: 1025149005902. PMID 14531065.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Kadkol SS, Bruno A, Oh S, Schmidt ML, Lindgren V (červenec 2006). "FLL transkript MLL-SEPT6 s novou sekvencí u kojenců s akutní myeloidní leukémií". Genetika a cytogenetika rakoviny. 168 (2): 162–7. doi:10.1016 / j.cancergency do 2006.02.020. PMID 16843108.
Nízká C, Macara IG (říjen 2006). „Strukturní analýza komplexů septinu 2, 6 a 7“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (41): 30697–706. doi:10,1074 / jbc.M605179200. PMID 16914550.
Kim CS, Seol SK, Song OK, Park JH, Jang SK (duben 2007). „Protein vázající RNA, hnRNP A1 a protein lešení, septin 6, usnadňují replikaci viru hepatitidy C“. Journal of Virology. 81 (8): 3852–65. doi:10.1128 / JVI.01311-06. PMC 1866118. PMID 17229681.
Sirajuddin M, Farkasovsky M, Hauer F, Kühlmann D, Macara IG, Weyand M, Stark H, Wittinghofer A (září 2007). "Strukturální vhled do tvorby vláken savčími septiny". Příroda. 449 (7160): 311–5. doi:10.1038 / nature06052. PMID 17637674.
Kremer BE, Adang LA, Macara IG (září 2007). „Septiny regulují organizaci aktinů a zadržování buněčného cyklu jadernou akumulací NCK zprostředkovanou SOCS7“. Buňka. 130 (5): 837–50. doi:10.1016 / j.cell.2007.06.053. PMC 2085444. PMID 17803907.

Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000125354 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000050379 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8590280-5] Nagase T, Seki N, Tanaka A, Ishikawa K, Nomura N (srpen 1995). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. IV. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0121-KIAA0160) odvozené analýzou cDNA klonů z lidské buněčné linie KG-1“. Výzkum DNA. 2 (4): 167–74, 199–210. doi:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID 8590280.

[pmid10744683-6] Xue J, Wang X, Malladi CS, Kinoshita M, Milburn PJ, Lengyel I, Rostas JA, Robinson PJ (duben 2000). „Fosforylace nového mozkového specifického septinu, G-septinu, pomocí cGMP-dependentní protein kinázy“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (14): 10047–56. doi:10.1074 / jbc.275.14.10047. PMID 10744683.

[entrez-7] A ^b ^C „Entrez Gene: 6. září 6. září“.

[pmid16189514-8] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.

[pmid12388755-9] Surka MC, Tsang CW, Trimble WS (říjen 2002). „MSF u savčích septinů se lokalizuje pomocí mikrotubulů a je nezbytný pro dokončení cytokineze“. Molekulární biologie buňky. 13 (10): 3532–45. doi:10,1091 / mbc.E02-01-0042. PMC 129964. PMID 12388755.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]