SEPT2 - SEPT2

SEPTIN2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2QA5, 2QAG, 2QNR
Identifikátory
Aliasy	SEPTIN2, DIFF6, NEDD-5, NEDD5, Pnutl3, hNedd5, septin 2, SEPT2
Externí ID	OMIM: 601506 MGI: 97298 HomoloGene: 3243 Genové karty: SEPTIN2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	241,354,027 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	93,509,733 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • Vazba GTP; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • kadherinová vazba; • identická vazba na protein; • Aktivita GTPázy; • GO: Aktivita molekulárního adaptéru 0032947;
Buněčná složka	• cytoplazma; • kondenzovaný chromozomový kinetochor; • buněčná projekce; • membrána; • buněčná membrána; • vřeteno; • komplex septin; • chromozóm; • fotoreceptor spojující cilium; • buněčná kůra; • exocyst; • střední část těla; • jádro; • ciliární membrána; • aktinový cytoskelet; • perinukleární oblast cytoplazmy; • GO: 0035085 axoném; • dělící rýha; • chromozom, centromerická oblast; • cytoskelet; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • kinetochore; • cytosol; • spermie mezikruží; • nepohyblivé cilium; • cilium; • septinový prsten; • mikrotubulární cytoskelet; • pohyblivé cilium;
Biologický proces	• buněčné dělení; • buněčný cyklus; • vývoj neuronové projekce; • spermatogeneze; • diferenciace buněk; • vyhlazená signální dráha; • cilium morfogeneze; • cytokineze závislá na cytoskeletu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4735
	18000
	ENSG00000168385
	ENSMUSG00000116048
	Q15019
	P42208
NM_001008491; NM_001008492; NM_001282972; NM_001282973; NM_004404;
	NM_006155; NM_001321029; NM_001321030; NM_001321031; NM_001321032; NM_001321033; NM_001321034; NM_001321035; NM_001349287; NM_001349288; NM_001349289; NM_001349290; NM_001349291; NM_001349302; NM_001349304; NM_001349305; NM_001349306; NM_001349307; NM_001349308; NM_001349309; NM_001349310; NM_001349311; NM_001349312; NM_001349313; NM_001349314; NM_001349315
	NM_001159717; NM_001159718; NM_001159719; NM_010891
NP_001008491; NP_001008492; NP_001269901; NP_001269902; NP_001307958;
	NP_001307959; NP_001307960; NP_001307961; NP_001307962; NP_001307963; NP_001307964; NP_004395; NP_006146; NP_001336216; NP_001336217; NP_001336218; NP_001336219; NP_001336220; NP_001336231; NP_001336233; NP_001336234; NP_001336235; NP_001336236; NP_001336237; NP_001336238; NP_001336239; NP_001336240; NP_001336241; NP_001336242; NP_001336243; NP_001336244
	NP_001153189; NP_001153190; NP_001153191; NP_035021
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

2. září, také známý jako SEPT2, je protein který je u lidí kódován SEPT2 gen.^[5]^[6]

Funkce

SEPT2 může hetero-oligomerizovat s 6. ZÁŘÍ a 7. ZÁŘÍ za vzniku vláken.^[7] SEPT2 interagoval s SEPT6 prostřednictvím svého C-terminál svinutá cívka doména.^[7] Srazit SEPT2, SEPT6 a SEPT7 v příčinách aktin stresová vlákna se rozpadají a buňky ztrácejí polarita. Septins, SOCS7, a NCK1 jsou součástí signální dráhy, která spojuje regulaci reakce poškození DNA na cytoskelet.^[8]

Interakce

SEPT2 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000168385 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000116048 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: SEPT2 septin 2“.
^ Mori T, Miura K, Fujiwara T, Shin S, Inazawa J, Nakamura Y (1996). "Izolace a mapování lidského genu (DIFF6) homologního s kvasinkami CDC3, CDC10, CDC11 a CDC12 a myší Diff6". Cytogenetika a genetika buněk. 73 (3): 224–7. doi:10.1159/000134343. PMID 8697812.
^ ^A ^b Nízká C, Macara IG (říjen 2006). „Strukturní analýza komplexů septinu 2, 6 a 7“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (41): 30697–706. doi:10,1074 / jbc.M605179200. PMID 16914550.
^ Kremer BE, Adang LA, Macara IG (září 2007). „Septiny regulují organizaci aktinů a zadržování buněčného cyklu jadernou akumulací NCK zprostředkovanou SOCS7“. Buňka. 130 (5): 837–50. doi:10.1016 / j.cell.2007.06.053. PMC 2085444. PMID 17803907.
^ ^A ^b ^C Surka MC, Tsang CW, Trimble WS (říjen 2002). „MSF u savčích septinů se lokalizuje pomocí mikrotubulů a je nezbytný pro dokončení cytokineze“. Molekulární biologie buňky. 13 (10): 3532–45. doi:10,1091 / mbc.E02-01-0042. PMC 129964. PMID 12388755.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3: 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Další čtení

Nagase T, Seki N, Tanaka A, Ishikawa K, Nomura N (srpen 1995). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. IV. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0121-KIAA0160) odvozené analýzou cDNA klonů z lidské buněčné linie KG-1“. Výzkum DNA. 2 (4): 167–74, 199–210. doi:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID 8590280.
Mori T, Miura K, Fujiwara T, Shin S, Inazawa J, Nakamura Y (1996). "Izolace a mapování lidského genu (DIFF6) homologního s kvasinkami CDC3, CDC10, CDC11 a CDC12 a myší Diff6". Cytogenetika a genetika buněk. 73 (3): 224–7. doi:10.1159/000134343. PMID 8697812.
Kinoshita M, Kumar S, Mizoguchi A, Ide C, Kinoshita A, Haraguchi T, Hiraoka Y, Noda M (červen 1997). „Nedd5, savčí septin, je nová cytoskeletální složka interagující se strukturami založenými na aktinu“. Geny a vývoj. 11 (12): 1535–47. doi:10.1101 / gad.11.12.1535. PMID 9203580.
Hsu SC, Hazuka CD, Roth R, Foletti DL, Heuser J, Scheller RH (červen 1998). "Složení podjednotky, proteinové interakce a struktury savčího mozku sec6 / 8 komplexu a septinových vláken". Neuron. 20 (6): 1111–22. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80493-6. PMID 9655500. S2CID 10915358.
Kinoshita A, Kinoshita M, Akiyama H, Tomimoto H, Akiguchi I, Kumar S, Noda M, Kimura J (listopad 1998). „Identifikace septinů v neurofibrilárních spleti při Alzheimerově chorobě“. American Journal of Pathology. 153 (5): 1551–60. doi:10.1016 / S0002-9440 (10) 65743-4. PMC 1853406. PMID 9811347.
Sanger Center, The; Washington University Genome Sequencing Cente, The (listopad 1998). „Směrem k úplné sekvenci lidského genomu“. Výzkum genomu. 8 (11): 1097–108. doi:10.1101 / gr.8.11.1097. PMID 9847074.
Beites CL, Xie H, Bowser R, Trimble WS (květen 1999). „Septin CDCrel-1 váže syntaxin a inhibuje exocytózu“. Přírodní neurovědy. 2 (5): 434–9. doi:10.1038/8100. PMID 10321247. S2CID 5863477.
Hoja MR, Wahlestedt C, Höög C (srpen 2000). "Vizuální intracelulární klasifikační strategie pro necharakterizované lidské proteiny". Experimentální výzkum buněk. 259 (1): 239–46. doi:10,1006 / excr. 2000,4948. PMID 10942595.
Sakai K, Kurimoto M, Tsugu A, Hubbard SL, Trimble WS, Rutka JT (květen 2002). "Exprese Nedd5, savčího septinu, v lidských mozkových nádorech". Journal of Neuro-Oncology. 57 (3): 169–77. doi:10.1023 / A: 1015721801075. PMID 12125979. S2CID 20554212.
Surka MC, Tsang CW, Trimble WS (říjen 2002). „MSF u savčích septinů se lokalizuje pomocí mikrotubulů a je nezbytný pro dokončení cytokineze“. Molekulární biologie buňky. 13 (10): 3532–45. doi:10,1091 / mbc.E02-01-0042. PMC 129964. PMID 12388755.
Sheffield PJ, Oliver CJ, Kremer BE, Sheng S, Shao Z, Macara IG (leden 2003). „Interakce borg / septin a shromáždění heterodimerů, trimerů a vláken savčích septinů“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (5): 3483–8. doi:10,1074 / jbc.M209701200. PMID 12446710.
Vega IE, Hsu SC (leden 2003). „Protein septinu Nedd5 se asociuje jak s komplexem exocyst, tak s mikrotubuly a narušení jeho aktivity GTPasy podporuje aberantní růst neuritů v buňkách PC12“. NeuroReport. 14 (1): 31–7. doi:10.1097/00001756-200301200-00006. PMID 12544826. S2CID 22757290.
Koshelev YA, Kiselev SL, Georgiev GP (2004). „Interakce proteinu S100A4 (Mts1) se septiny 2. září, 6. září a 7. září in vitro“. Doklady Biochemistry and Biofhysics. 391: 195–7. doi:10.1023 / A: 1025149005902. PMID 14531065. S2CID 26291196.
Ona YM, Huang YW, Zhang L, Trimble WS (2004). „Fosforylace septinu 2: teoretické a hmotnostní spektrometrické důkazy o existenci jednoho fosforylačního místa in vivo“. Rychlá komunikace v hmotnostní spektrometrii. 18 (10): 1123–30. doi:10,1002 / rcm.1453. PMID 15150837.
Nagata K, Asano T, Nozawa Y, Inagaki M (prosinec 2004). „Biochemické a buněčné biologické analýzy komplexu savčích septinů, 7. září / 9b / 11“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (53): 55895–904. doi:10,1074 / jbc.M406153200. PMID 15485874.
Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (leden 2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Přírodní biotechnologie. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (leden 2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Spiliotis ET, Kinoshita M, Nelson WJ (březen 2005). „Pro kongres a segregaci savčích chromozomů je zapotřebí lešení mitotického septinu“. Věda. 307 (5716): 1781–5. doi:10.1126 / science.1106823. PMC 3368603. PMID 15774761.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000168385 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000116048 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: SEPT2 septin 2“.

[pmid8697812-6] Mori T, Miura K, Fujiwara T, Shin S, Inazawa J, Nakamura Y (1996). "Izolace a mapování lidského genu (DIFF6) homologního s kvasinkami CDC3, CDC10, CDC11 a CDC12 a myší Diff6". Cytogenetika a genetika buněk. 73 (3): 224–7. doi:10.1159/000134343. PMID 8697812.

[pmid16914550-7] A ^b Nízká C, Macara IG (říjen 2006). „Strukturní analýza komplexů septinu 2, 6 a 7“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (41): 30697–706. doi:10,1074 / jbc.M605179200. PMID 16914550.

[pmid17803907-8] Kremer BE, Adang LA, Macara IG (září 2007). „Septiny regulují organizaci aktinů a zadržování buněčného cyklu jadernou akumulací NCK zprostředkovanou SOCS7“. Buňka. 130 (5): 837–50. doi:10.1016 / j.cell.2007.06.053. PMC 2085444. PMID 17803907.

[pmid12388755-9] A ^b ^C Surka MC, Tsang CW, Trimble WS (říjen 2002). „MSF u savčích septinů se lokalizuje pomocí mikrotubulů a je nezbytný pro dokončení cytokineze“. Molekulární biologie buňky. 13 (10): 3532–45. doi:10,1091 / mbc.E02-01-0042. PMC 129964. PMID 12388755.

[pmid16189514-10] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid17353931-11] Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3: 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]