Rodina RsmY RNA - RsmY RNA family

Rodina RsmY RNA
	Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence RsmY
Identifikátory
Symbol	RsmY
Rfam	RF00195
Další údaje
RNA typ	Gen; sRNA
Domény	Bakterie
TAK	SO: 0000655
PDB struktur	PDBe

The rodina rsmY RNA je sada souvisejících nekódující RNA geny RsmZ, je regulován systémem transdukce signálu GacS / GacA v rostlinném organismu prospěšném pro půdní bakterii a biokontrolní organismus Pseudomonas fluorescens CHA0. Cílové geny GacA / GacS jsou translačně potlačovány malým proteinem RsmA vázajícím RNA. RNA RsmY a RsmZ se vážou RsmA zmírnit tuto represi a zvýšit tak sekundární metabolismus a vlastnosti biologické kontroly.^[1]

Studie v Legionella pneumophila prokázali, že ncRNA RsmY a RsmZ spolu s proteiny LetA a CsrA jsou zapojeni do regulační kaskády. Také se zdá, že tyto ncRNA jsou regulovány Sigma-faktor RpoS.^[2]

Viz také

Reference

^ Valverde C, Heeb S, Keel C, Haas D (listopad 2003). „RsmY, malá regulační RNA, je vyžadována ve shodě s RsmZ pro expresi biokontrolních znaků závislou na GacA v Pseudomonas fluorescens CHA0.“ Molekulární mikrobiologie. 50 (4): 1361–1379. doi:10.1046 / j.1365-2958.2003.03774.x. PMID 14622422.
^ Rasis M, Segal G (květen 2009). „Regulační kaskáda LetA-RsmYZ-CsrA společně s RpoS a PmrA reguluje post-transkripčně stacionární fázovou aktivaci Icm / Dot efektorů Legionella pneumophila“. Molekulární mikrobiologie. 72 (4): 995–1010. doi:10.1111 / j.1365-2958.2009.06705.x. PMID 19400807.

Další čtení

Brencic A, McFarland KA, McManus HR, Castang S, Mogno I, Dove SL, Lory S (srpen 2009). „Systém přenosu signálu GacS / GacA Pseudomonas aeruginosa působí výhradně prostřednictvím své kontroly nad transkripcí regulačních malých RNA RsmY a RsmZ“. Molekulární mikrobiologie. 73 (3): 434–445. doi:10.1111 / j.1365-2958.2009.06782.x. PMC 2761719. PMID 19602144.
Sorger-Domenigg T, Sonnleitner E, Kaberdin VR, Bläsi U (leden 2007). „Zřetelná a překrývající se vazebná místa proteinů Hfq a RsmA Pseudomonas aeruginosa na nekódující RNA RsmY“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 352 (3): 769–773. doi:10.1016 / j.bbrc.2006.11.084. PMID 17141182.
Valverde C, Lindell M, Wagner EG, Haas D (červen 2004). „Opakovaný GGA motiv je rozhodující pro aktivitu a stabilitu riboregulátoru RsmY Pseudomonas fluorescens“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (24): 25066–25074. doi:10,1074 / jbc.M401870200. PMID 15031281.

externí odkazy

Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[1] Valverde C, Heeb S, Keel C, Haas D (listopad 2003). „RsmY, malá regulační RNA, je vyžadována ve shodě s RsmZ pro expresi biokontrolních znaků závislou na GacA v Pseudomonas fluorescens CHA0.“ Molekulární mikrobiologie. 50 (4): 1361–1379. doi:10.1046 / j.1365-2958.2003.03774.x. PMID 14622422.

[pmid19400807-2] Rasis M, Segal G (květen 2009). „Regulační kaskáda LetA-RsmYZ-CsrA společně s RpoS a PmrA reguluje post-transkripčně stacionární fázovou aktivaci Icm / Dot efektorů Legionella pneumophila“. Molekulární mikrobiologie. 72 (4): 995–1010. doi:10.1111 / j.1365-2958.2009.06705.x. PMID 19400807.

[1]

[2]