RsmW sRNA - RsmW sRNA

RsmW sRNA
RF02809.svg
Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence malé RNA RsmW
Identifikátory
RfamRF02809
Další údaje
DoményBakterie
JÍTGO termín musí začínat GO:
TAKSO: 0000370
PDB strukturPDBe

RsmW je součástí rodiny Rsm / Csr nekódující RNA (ncRNA) objevené v Pseudomonas aeruginosa. Specificky se váže na protein RsmA in vitro, obnovuje produkci biofilmu (pravděpodobně kvůli interakci s RsmA) a částečně doplňuje ztrátu RsmY a RsmZ u dvojitých mutantů rsmY / rsmZ, pokud jde o jejich příspěvek k rojení. Ve srovnání s RsmY a RsmZ je jeho produkce indukována při vysokých teplotách a rsmW není transkripčně aktivován GacA.[1][2]

Viz také

Reference

  1. ^ Miller CL, Romero M, Karna SL, Chen T, Heeb S, Leung KP (červenec 2016). „RsmW, Pseudomonas aeruginosa malá nekódující RsmA-vazebná RNA upregulovaná v podmínkách biofilmu versus růst planktonu“. Mikrobiologie BMC. 16 (1): 155. doi:10.1186 / s12866-016-0771-r. PMC  4950607. PMID  27430253.
  2. ^ Wurtzel O, Yoder-Himes DR, Han K, Dandekar AA, Edelheit S, Greenberg EP, Sorek R, Lory S (září 2012). „Transkriptom jednoho nukleotidu s rozlišením Pseudomonas aeruginosa pěstovaný v tělesné teplotě“. PLoS patogeny. 8 (9): e1002945. doi:10.1371 / journal.ppat.1002945. PMC  3460626. PMID  23028334.