Rodina CsrC RNA - CsrC RNA family

Rodina CsrC RNA
RF00084.jpg
Identifikátory
SymbolCsrC
Alt. SymbolySraK
RfamRF00084
Další údaje
RNA typGen; sRNA
DoményBakterie
TAKSO: 0000655
PDB strukturPDBe

245 nukleotidových sRNA z Escherichia coliCsrC byl objeven pomocí genetického screeningu faktorů, které regulují biosyntézu glykogenu. CsrC RNA váže více kopií CsrA, protein, který post-transkripčně reguluje centrální tok uhlíku, tvorbu biofilmu a motilitu v E. coli. CsrC antagonizuje regulační účinky CsrA, pravděpodobně sekvestrací tohoto proteinu. Objev CsrC je zajímavý v tom, že podobná sRNA, CsrB, vykonává v podstatě stejnou funkci. Obě sRNA mají podobné nedokonalé opakující se sekvence (18 v CsrB, devět v CsrC), primárně lokalizované ve smyčkách předpovězených vlásenek, které mohou sloužit jako vazebné prvky CsrA. Transkripce csrC se zvyšuje, jak se kultura blíží stacionární fázi růstu, a je nepřímo aktivována CsrA prostřednictvím regulátoru odezvy UvrY [1]. Tato RNA byla také objevena v E-coli během velkoplošné obrazovky [2]. Gen zvaný SraK byl ve stacionární fázi velmi hojný, ale nízké hladiny bylo možné detekovat také v exponenciálně rostoucích buňkách [2].

Viz také

Reference

Další čtení

  • Weilbacher T, Suzuki K, Dubey AK, Wang X, Gudapaty S, Morozov I, Baker CS, Georgellis D, Babitzke P, Romeo T (květen 2003). "Nová sRNA složka regulačního systému ukládání uhlíku Escherichia coli". Molekulární mikrobiologie. 48 (3): 657–670. doi:10.1046 / j.1365-2958.2003.03459.x. PMID  12694612.
  • Argaman L, Hershberg R, Vogel J, Bejerano G, Wagner EG, Margalit H, Altuvia S (červen 2001). „Nové malé geny kódující RNA v intergenních oblastech Escherichia coli“. Aktuální biologie. 11 (12): 941–950. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00270-6. PMID  11448770.
  • Nuss AM, Schuster F, Kathrin Heroven A, Heine W, Pisano F, Dersch P (2. dubna 2014). „Přímé spojení mezi globálním regulátorem PhoP a regulonem Csr u Y. pseudotuberculosis prostřednictvím malé regulační RNA CsrC“. RNA Biology. 11 (5): 580–593. doi:10,4161 / rna.28676. PMID  24786463.

externí odkazy