STAMBP - STAMBP

STAMBP
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2XZE, 3RZU, 3RZV
Identifikátory
Aliasy	STAMBP, AMSH, MICCAP, STAM vazebný protein
Externí ID	OMIM: 606247 MGI: 1917777 HomoloGene: 4719 Genové karty: STAMBP
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	83,572,729 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• specifické vazby na proteinovou doménu; • vazba kovových iontů; • aktivita peptidázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • thiol-závislá ubiquitin-specifická proteázová aktivita; • aktivita hydrolázy; • aktivita metalopeptidázy; • Lys63 specifická deubiquitinázová aktivita;
Buněčná složka	• endozom; • membrána; • buněčná membrána; • nukleoplazma; • časný endosom; • dělící rýha; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• negativní regulace neuronového apoptotického procesu; • Kaskáda JAK-STAT; • mitotická cytokineze; • proteolýza; • negativní regulace přenosu signálu proteinu Ras; • negativní regulace signalizace fosfatidylinositol 3-kinázy; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • deubikvitinace bílkovin; • deubikvitinace spojená s proteinem K63;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10617
	70527
	ENSG00000124356
	ENSMUSG00000006906
	O95630
	Q9CQ26
	NM_006463; NM_201647; NM_213622
	NM_024239; NM_001362078; NM_001362079; NM_001362080
NP_006454; NP_964010; NP_998787; NP_001340896; NP_001340897;
	NP_001340898; NP_001340899; NP_001340900; NP_001340901; NP_001340902; NP_001340903; NP_001340904; NP_001340905
	NP_077201; NP_001349007; NP_001349008; NP_001349009
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein vázající STAM je protein že u lidí je kódován STAMBP gen.^[4]^[5]

Funkce

Cytokiny zprostředkovaná signální transdukce v kaskádě JAK-STAT vyžaduje zapojení molekul adaptéru. Jedna taková molekula adaptéru transdukující signál obsahuje doménu SH3, která je nutná pro indukci MYC a buněčného růstu. Protein kódovaný tímto genem se váže na doménu SH3 molekuly adaptéru transdukující signál a hraje klíčovou roli v cytokinem zprostředkované signalizaci pro indukci MYC a progresi buněčného cyklu. Pro tento gen bylo nalezeno několik alternativně sestříhaných variant transkriptu kódujících stejnou proteinovou izoformu.^[5]

Mutace v tomto genu byly spojeny s případy mikrocefalie (doi: 10,1038 / ng.2602)

Interakce

STAMBP bylo prokázáno komunikovat s RNF11,^[6] Molekula adaptéru transdukující signál^[4]^[7] a GRAP2.^[8]^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000006906 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Tanaka N, Kaneko K, Asao H, Kasai H, Endo Y, Fujita T, Takeshita T, Sugamura K (červenec 1999). „Možné zapojení nové molekuly„ AMSH “spojené se STAM do intracelulární signální transdukce zprostředkované cytokiny“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (27): 19129–35. doi:10.1074 / jbc.274.27.19129. PMID 10383417.
^ ^A ^b „Entrez Gene: STAMBP STAM binding protein“.
^ Li H, Seth A (březen 2004). „Komplex RNF11: Smurf2 zprostředkovává ubikvitinaci proteinu AMSH“. Onkogen. 23 (10): 1801–8. doi:10.1038 / sj.onc.1207319. PMID 14755250.
^ Kato M, Miyazawa K, Kitamura N (prosinec 2000). „Deubikvitinační enzym UBPY interaguje s doménou Src homologie 3 proteinu vázajícího se na Hrs prostřednictvím nového vazebného motivu PX (V / I) (D / N) RXXKP“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (48): 37481–7. doi:10,1074 / jbc.M007251200. PMID 10982817.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Asada H, Ishii N, Sasaki Y, Endo K, Kasai H, Tanaka N, Takeshita T, Tsuchiya S, Konno T, Sugamura K (květen 1999). „Grf40, nový člen rodiny Grb2, je zapojen do signalizace T buněk prostřednictvím interakce s SLP-76 a LAT“. The Journal of Experimental Medicine. 189 (9): 1383–90. doi:10.1084 / jem.189.9.1383. PMC 2193052. PMID 10224278.

Další čtení

Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (duben 1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Analytická biochemie. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (duben 1997). "Sekvenování cDNA ve velkém měřítku". Výzkum genomu. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Asada H, Ishii N, Sasaki Y, Endo K, Kasai H, Tanaka N, Takeshita T, Tsuchiya S, Konno T, Sugamura K (květen 1999). „Grf40, nový člen rodiny Grb2, je zapojen do signalizace T buněk prostřednictvím interakce s SLP-76 a LAT“. The Journal of Experimental Medicine. 189 (9): 1383–90. doi:10.1084 / jem.189.9.1383. PMC 2193052. PMID 10224278.
Endo K, Takeshita T, Kasai H, Sasaki Y, Tanaka N, Asao H, Kikuchi K, Yamada M, Chenb M, O'Shea JJ, Sugamura K (červenec 2000). „STAM2, nový člen rodiny STAM, vázající se na kinázy Janus“. FEBS Dopisy. 477 (1–2): 55–61. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01760-9. PMID 10899310. S2CID 31811757.
Itoh F, Asao H, Sugamura K, Heldin CH, ten Dijke P, Itoh S (srpen 2001). „Podpora signalizace kostního morfogenetického proteinu prostřednictvím negativní regulace inhibičních Smadů“. Časopis EMBO. 20 (15): 4132–42. doi:10.1093 / emboj / 20.15.4132. PMC 149146. PMID 11483516.
Ishii N, Owada Y, Yamada M, Miura S, Murata K, Asao H, Kondo H, Sugamura K (prosinec 2001). „Ztráta neuronů v hipokampu a mozkové kůře myší s deficitem AMSH“. Molekulární a buněčná biologie. 21 (24): 8626–37. doi:10.1128 / MCB.21.24.8626-8637.2001. PMC 100023. PMID 11713295.
Maytal-Kivity V, Reis N, Hofmann K, Glickman MH (2006). „MPN +, domnělý katalytický motiv nalezený v podskupině proteinů MPN domény z eukaryot a prokaryot, je kritický pro funkci Rpn11“. BMC biochemie. 3: 28. doi:10.1186/1471-2091-3-28. PMC 129983. PMID 12370088.
Ibarrola N, Kratchmarova I, Nakajima D, Schiemann WP, Moustakas A, Pandey A, Mann M (leden 2004). „Klonování nové signální molekuly AMSH-2, která potencuje signalizaci beta transformujícího růstového faktoru“. Buněčná biologie BMC. 5: 2. doi:10.1186/1471-2121-5-2. PMC 385422. PMID 14728725.
Ambroggio XI, Rees DC, Deshaies RJ (leden 2004). „JAMM: místo zinku podobné metaloproteázám v proteazomu a signalosomu“. PLOS Biology. 2 (1): E2. doi:10.1371 / journal.pbio.0020002. PMC 300881. PMID 14737182.
Li H, Seth A (březen 2004). „Komplex RNF11: Smurf2 zprostředkovává ubikvitinaci proteinu AMSH“. Onkogen. 23 (10): 1801–8. doi:10.1038 / sj.onc.1207319. PMID 14755250.
McCullough J, Clague MJ, Urbé S (srpen 2004). „AMSH je ubiquitin isopeptidáza spojená s endosomy“. The Journal of Cell Biology. 166 (4): 487–92. doi:10.1083 / jcb.200401141. PMC 2172215. PMID 15314065.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Row PE, Prior IA, McCullough J, Clague MJ, Urbé S (květen 2006). „Ubikvitin isopeptidáza UBPY reguluje dynamiku endosomálního ubikvitinu a je nezbytná pro down-regulaci receptoru“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (18): 12618–24. doi:10,1074 / jbc.M512615200. PMID 16520378.
Nakamura M, Tanaka N, Kitamura N, Komada M (červen 2006). „Clathrin ukotví deubikvitinační enzymy, AMSH a protein podobný AMSH, na časných endosomech“. Geny do buněk. 11 (6): 593–606. doi:10.1111 / j.1365-2443.2006.00963.x. PMID 16716190.
Tsang HT, Connell JW, Brown SE, Thompson A, Reid E, Sanderson CM (září 2006). „Systematická analýza interakcí humánního proteinu CHMP: další proteiny obsahující doménu MIT se vážou na více složek lidského komplexu ESCRT III.“ Genomika. 88 (3): 333–46. doi:10.1016 / j.ygeno.2006.04.003. PMID 16730941.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCm38Ensembl-1] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000006906 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10383417-4] A ^b Tanaka N, Kaneko K, Asao H, Kasai H, Endo Y, Fujita T, Takeshita T, Sugamura K (červenec 1999). „Možné zapojení nové molekuly„ AMSH “spojené se STAM do intracelulární signální transdukce zprostředkované cytokiny“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (27): 19129–35. doi:10.1074 / jbc.274.27.19129. PMID 10383417.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: STAMBP STAM binding protein“.

[pmid14755250-6] Li H, Seth A (březen 2004). „Komplex RNF11: Smurf2 zprostředkovává ubikvitinaci proteinu AMSH“. Onkogen. 23 (10): 1801–8. doi:10.1038 / sj.onc.1207319. PMID 14755250.

[pmid10982817-7] Kato M, Miyazawa K, Kitamura N (prosinec 2000). „Deubikvitinační enzym UBPY interaguje s doménou Src homologie 3 proteinu vázajícího se na Hrs prostřednictvím nového vazebného motivu PX (V / I) (D / N) RXXKP“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (48): 37481–7. doi:10,1074 / jbc.M007251200. PMID 10982817.

[pmid16189514-8] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid10224278-9] Asada H, Ishii N, Sasaki Y, Endo K, Kasai H, Tanaka N, Takeshita T, Tsuchiya S, Konno T, Sugamura K (květen 1999). „Grf40, nový člen rodiny Grb2, je zapojen do signalizace T buněk prostřednictvím interakce s SLP-76 a LAT“. The Journal of Experimental Medicine. 189 (9): 1383–90. doi:10.1084 / jem.189.9.1383. PMC 2193052. PMID 10224278.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]