RECQL4 - RECQL4

RECQL4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2 KMU
Identifikátory
Aliasy	RECQL4, RECQ4, RecQ jako helikáza 4
Externí ID	OMIM: 603780 MGI: 1931028 HomoloGene: 3144 Genové karty: RECQL4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	144,517,845 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	76,710,548 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• žíhací aktivita helikázy; • vazba nukleotidů; • GO: 0043140 3'-5 'aktivita DNA helikázy; • bublinková DNA vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita hydrolázy; • ATP vazba; • GO: Aktivita helikázy 0008026; • vazba nukleové kyseliny; • GO: 1990163 aktivita čtyřcestného spojení helikázy; • oxidovaná purinová vazba DNA; • vazba telomerické D-smyčky; • Vazba DNA; • jednořetězcová vazba DNA;
Buněčná složka	• membrána; • cytoplazma; • buněčné jádro; • chromozom, telomerická oblast; • chromozóm;
Biologický proces	• vývoj mnohobuněčných organismů; • Oprava DNA; • Renaturace řetězce DNA; • oprava základní excize; • oprava dvouvláknového zlomu pomocí homologní rekombinace; • DNA rekombinace; • replikace DNA; • Odvíjení duplexu DNA; • demontáž telomerické D-smyčky; • údržba telomer; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • pozitivní regulace přechodu G2 / M mitotického buněčného cyklu; • pozitivní regulace replikace DNA; • Odvíjení DNA zapojené do replikace DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9401
	79456
	ENSG00000160957
	ENSMUSG00000033762
	O94761
	Q75NR7
	NM_004260
	NM_058214
	NP_004251
	NP_478121
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

ATP-dependentní DNA helikáza Q4 je enzym že u lidí je kódován RECQL4 gen.^[5]^[6]^[7]

Mutace v RECQL4 jsou spojeny s autozomálně recesivním onemocněním Rothmund-Thomsonův syndrom porucha, která se vyznačuje předčasným stárnutím.^[8]^[9] Navíc k Rothmund-Thomsonův syndrom, RECQL4 mutace jsou také spojeny s RAPADILINO a Baller-Geroldovy syndromy.^[10] Existují dva typy syndromu Rothmunda Thomsona a je to typ 2, který se vyskytuje u pacientů nesoucích škodlivé mutace v obou kopiích RECQL4 gen. Tento stav je spojen s vysokým rizikem vývoje osteosarkom (maligní nádor kosti).^[11]RECQL4 získá své jméno z toho, že je homologní (sdílená sekvence) s ostatními členy RecQ helikáza rodina. Dvě další genetická onemocnění jsou způsobena mutacemi v jiných helikázách RECQ. Bloomův syndrom je spojen s mutacemi v BLM gen a Wernerův syndrom je spojen s mutacemi v WRN gen.^[12]

Oprava DNA

Dvouvláknové zlomy v DNA jsou potenciálně smrtelné pro buňku a je třeba je opravit. Oprava dvouvláknových zlomů homologní rekombinace (HR) je důležitý buněčný mechanismus, jak se této letalitě vyhnout. RECQL4 má klíčovou roli v prvním kroku HR, označovaném jako koncová resekce.^[13] Když je RECQL4 nedostatečný, sníží se koncová resekce a tím i HR. Důkazy naznačují, že jiné formy opravy DNA včetně nehomologní spojování konců, oprava nukleotidové excize a oprava základní excize také závisí na funkci RECQL4.^[9] U Rothmund-Thomsonova syndromu je asociace nedostatečné opravy DNA zprostředkované RECQL4 a předčasného stárnutí v souladu s Teorie poškození DNA stárnutí.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000160957 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033762 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Kitao S, Ohsugi I, Ichikawa K, Goto M, Furuichi Y, Shimamoto A (únor 1999). „Klonování dvou nových genů lidské helikázy rodiny RecQ: biologický význam více druhů u vyšších eukaryot“. Genomika. 54 (3): 443–52. doi:10.1006 / geno.1998.5595. PMID 9878247.
^ Sangrithi MN, Bernal JA, Madine M, Philpott A, Lee J, Dunphy WG, Venkitaraman AR (červen 2005). „Zahájení replikace DNA vyžaduje protein RECQL4 mutovaný v Rothmund-Thomsonově syndromu“. Buňka. 121 (6): 887–98. doi:10.1016 / j.cell.2005.05.015. PMID 15960976. S2CID 15064074.
^ „Entrez Gene: RECQL4 RecQ protein podobný 4“.
^ Lu H, Fang EF, Sykora P, Kulikowicz T, Zhang Y, Becker KG, Croteau DL, Bohr VA (2014). „Senescence vyvolaná dysfunkcí RECQL4 přispívá k rysům Rothmund-Thomsonova syndromu u myší“. Cell Death Dis. 5 (5): e1226. doi:10.1038 / cddis.2014.168. PMC 4047874. PMID 24832598.
^ ^A ^b Lu L, Jin W, Wang LL (2017). „Stárnutí u Rothmund-Thomsonova syndromu a souvisejících genetických poruch RECQL4“. Aging Res. Rev. 33: 30–35. doi:10.1016 / j.arr.2016.06.002. PMID 27287744. S2CID 28321025.
^ Shamanna RA, Singh DK, Lu H, Mirey G, Keijzers G, Salles B, Croteau DL, Bohr VA (2014). „RECQ helicase RECQL4 se podílí na nehomologním konci spojování a interakci s komplexem Ku“. Karcinogeneze. 35 (11): 2415–24. doi:10.1093 / carcin / bgu137. PMC 4216052. PMID 24942867.
^ Wang LL, Gannavarapu A, Kozinetz CA a kol. (2003). „Souvislost mezi osteosarkomem a škodlivými mutacemi v genu RECQL4 u Rothmund-Thomsonova syndromu“. J. Natl. Cancer Inst. 95 (9): 669–74. doi:10.1093 / jnci / 95.9.669. PMID 12734318.
^ Kitao S, Lindor NM, Shiratori M a kol. (2000). „Gen zodpovědný za Rothmund-thomsonův syndrom, RECQL4: genomová struktura a produkty“. Genomika. 61 (3): 268–76. doi:10.1006 / geno.1999.5959. PMID 10552928.
^ Lu H, Shamanna RA, Keijzers G, Anand R, Rasmussen LJ, Cejka P, Croteau DL, Bohr VA (2016). „RECQL4 podporuje resekci konce DNA při opravě dvojitých řetězců DNA“. Cell Rep. 16 (1): 161–73. doi:10.1016 / j.celrep.2016.05.079. PMC 5576896. PMID 27320928.

Další čtení

Kellermayer R (2006). „Všestranný RECQL4“. Genet. Med. 8 (4): 213–6. doi:10.1097 / 01.gim.0000214457.58378.1a. PMID 16617241.
Soukup T (1976). "Intrafuzální typy vláken ve svalových vřetenech potkaních končetin: morfologické a histochemické charakteristiky". Histochemie. 47 (1): 43–57. doi:10.1007 / BF00492992. PMID 133085. S2CID 23487130.
Kitao S, Shimamoto A, Goto M a kol. (1999). „Mutace v RECQL4 způsobují podmnožinu případů Rothmund-Thomsonova syndromu“. Nat. Genet. 22 (1): 82–4. doi:10.1038/8788. PMID 10319867. S2CID 195211275.
Yankiwski V, Marciniak RA, Guarente L, Neff NF (2000). "Jaderná struktura v buňkách normálního a Bloomova syndromu". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (10): 5214–9. doi:10.1073 / pnas.090525897. PMC 25808. PMID 10779560.
Kawabe T, Tsuyama N, Kitao S a kol. (2000). „Diferenciální regulace lidských helikáz rodiny RecQ v transformaci buněk a buněčném cyklu“. Onkogen. 19 (41): 4764–72. doi:10.1038 / sj.onc.1203841. PMID 11032027.
Wang LL, Worley K, Gannavarapu A a kol. (2002). „Omezení velikosti intronu jako mutační mechanismus u Rothmund-Thomsonova syndromu“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 71 (1): 165–7. doi:10.1086/341234. PMC 384974. PMID 12016592.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Roversi G, Beghini A, Zambruno G a kol. (2003). "Identifikace dvou nových SNQL RECQL4exonic a genomická charakterizace minisatelitu IVS12". J. Hum. Genet. 48 (2): 107–9. doi:10,1007 / s100380300016. PMID 12601557. S2CID 9960752.
Wang LL, Gannavarapu A, Clericuzio CL a kol. (2004). „Absence mutací RECQL4 u poikilodermy s neutropenií u pacientů s navajem a bez něj“. Dopoledne. J. Med. Genet. A. 118 (3): 299–301. doi:10,1002 / ajmg.a.10057. PMID 12673665. S2CID 36023058.
Beghini A, Castorina P, Roversi G a kol. (2004). "Poruchy zpracování RNA helikázového genu RECQL4 ve sloučenině heterozygotního pacienta Rothmund-Thomson". Dopoledne. J. Med. Genet. A. 120 (3): 395–9. doi:10.1002 / ajmg.a.20154. PMID 12838562. S2CID 25885145.
Siitonen HA, Kopra O, Kääriäinen H a kol. (2004). „Molekulární vada syndromu RAPADILINO rozšiřuje fenotypové spektrum chorob RECQL“. Hučení. Mol. Genet. 12 (21): 2837–44. doi:10,1093 / hmg / ddg306. PMID 12952869.
Brandenberger R, Wei H, Zhang S a kol. (2005). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Nat. Biotechnol. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
Nishijo K, Nakayama T, Aoyama T a kol. (2004). "Mutační analýza genu RECQL4 u sporadických osteosarkomů". Int. J. Cancer. 111 (3): 367–72. doi:10.1002 / ijc.20269. PMID 15221963. S2CID 20389854.
Yin J, Kwon YT, Varshavsky A, Wang W (2005). „RECQL4, mutovaný v Rothmund-Thomsonových a RAPADILINO syndromech, interaguje s ubikvitinovými ligázami UBR1 a UBR2 dráhy pravidla N-konce“. Hučení. Mol. Genet. 13 (20): 2421–30. doi:10,1093 / hmg / ddh269. PMID 15317757.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Sengupta S, Shimamoto A, Koshiji M a kol. (2005). „Nádorový supresor p53 potlačuje transkripci helikázy RECQ4“. Onkogen. 24 (10): 1738–48. doi:10.1038 / sj.onc.1208380. PMID 15674334.

externí odkazy

GeneReviews / NCBI / NIH / UW záznam o Rothmund-Thomsonově syndromu

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000160957 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033762 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9878247-5] Kitao S, Ohsugi I, Ichikawa K, Goto M, Furuichi Y, Shimamoto A (únor 1999). „Klonování dvou nových genů lidské helikázy rodiny RecQ: biologický význam více druhů u vyšších eukaryot“. Genomika. 54 (3): 443–52. doi:10.1006 / geno.1998.5595. PMID 9878247.

[pmid15960976-6] Sangrithi MN, Bernal JA, Madine M, Philpott A, Lee J, Dunphy WG, Venkitaraman AR (červen 2005). „Zahájení replikace DNA vyžaduje protein RECQL4 mutovaný v Rothmund-Thomsonově syndromu“. Buňka. 121 (6): 887–98. doi:10.1016 / j.cell.2005.05.015. PMID 15960976. S2CID 15064074.

[entrez-7] „Entrez Gene: RECQL4 RecQ protein podobný 4“.

[pmid24832598-8] Lu H, Fang EF, Sykora P, Kulikowicz T, Zhang Y, Becker KG, Croteau DL, Bohr VA (2014). „Senescence vyvolaná dysfunkcí RECQL4 přispívá k rysům Rothmund-Thomsonova syndromu u myší“. Cell Death Dis. 5 (5): e1226. doi:10.1038 / cddis.2014.168. PMC 4047874. PMID 24832598.

[pmid27287744-9] A ^b Lu L, Jin W, Wang LL (2017). „Stárnutí u Rothmund-Thomsonova syndromu a souvisejících genetických poruch RECQL4“. Aging Res. Rev. 33: 30–35. doi:10.1016 / j.arr.2016.06.002. PMID 27287744. S2CID 28321025.

[pmid24942867-10] Shamanna RA, Singh DK, Lu H, Mirey G, Keijzers G, Salles B, Croteau DL, Bohr VA (2014). „RECQ helicase RECQL4 se podílí na nehomologním konci spojování a interakci s komplexem Ku“. Karcinogeneze. 35 (11): 2415–24. doi:10.1093 / carcin / bgu137. PMC 4216052. PMID 24942867.

[11] Wang LL, Gannavarapu A, Kozinetz CA a kol. (2003). „Souvislost mezi osteosarkomem a škodlivými mutacemi v genu RECQL4 u Rothmund-Thomsonova syndromu“. J. Natl. Cancer Inst. 95 (9): 669–74. doi:10.1093 / jnci / 95.9.669. PMID 12734318.

[12] Kitao S, Lindor NM, Shiratori M a kol. (2000). „Gen zodpovědný za Rothmund-thomsonův syndrom, RECQL4: genomová struktura a produkty“. Genomika. 61 (3): 268–76. doi:10.1006 / geno.1999.5959. PMID 10552928.

[pmid27320928-13] Lu H, Shamanna RA, Keijzers G, Anand R, Rasmussen LJ, Cejka P, Croteau DL, Bohr VA (2016). „RECQL4 podporuje resekci konce DNA při opravě dvojitých řetězců DNA“. Cell Rep. 16 (1): 161–73. doi:10.1016 / j.celrep.2016.05.079. PMC 5576896. PMID 27320928.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]