RANBP1 - RANBP1

RANBP1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1K5D, 1K5G
Identifikátory
Aliasy	RANBP1, HTF9A, RAN vazebný protein 1
Externí ID	OMIM: 601180 MGI: 96269 HomoloGene: 21600 Genové karty: RANBP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 22 (lidský)
Konec	20,127,355 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Proběhla vazba GTPázy; • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Aktivátor aktivity GTPázy; • Aktivita inhibitoru disociace GDP; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • kadherinová vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • jaderný obal; • buněčné jádro; • centrosome; • cytosol; • jaderný pór;
Biologický proces	• GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy; • intracelulární transport; • GO: virový proces 0022415; • signální transdukce; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • GO: 0048552 regulace katalytické aktivity; • import bílkovin do jádra; • GO: 0043146 organizace vřetena; • pozitivní regulace separace mitotických centrosomů; • Export RNA z jádra; • G1 / S přechod mitotického buněčného cyklu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5902
	19385
	ENSG00000099901
	ENSMUSG00000005732
	P43487
	P34022
	NM_001278639; NM_001278640; NM_001278641; NM_002882
	NM_011239
	NP_001265568; NP_001265569; NP_001265570; NP_002873
	NP_035369
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Ran-specifický vazebný protein 1 je enzym že u lidí je kódován RANBP1 gen.^[4]^[5]^[6]

Běžel / TC4-vazebný protein, RanBP1, interaguje specificky s GTP - nabitý RAN. RANBP1 kóduje protein 23 kD, který se váže na RAN v komplexu s GTP, ale ne HDP. RANBP1 se neaktivuje GTPáza aktivita RAN, ale výrazně zvyšuje hydrolýzu GTP proteinem aktivujícím RanGTPázu (RANGAP1 ). RANBP1 cDNA kóduje 201-aminokyselinový protein, který je z 92% podobný jeho myšímu homologu. V buňkách savců i v kvasinkách působí RANBP1 jako negativní regulátor RCC1 inhibicí uvolňování guaninového nukleotidu stimulovaného RCC1 z RAN.^[6]

Interakce

RANBP1 bylo prokázáno komunikovat s XPO1,^[7]^[8] KPNB1^[8]^[9] a Běžel.^[8]^[10]^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000099901 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Hayashi N, Yokoyama N, Seki T, Azuma Y, Ohba T, Nishimoto T (srpen 1995). „RanBP1, vazba jaderného G proteinu podobného Ras na Ran / TC4, inhibuje RCC1 prostřednictvím Ran / TC4“. Mol Gen Genet. 247 (6): 661–9. doi:10.1007 / BF00290397. PMID 7616957.
^ Kehlenbach RH, Dickmanns A, Kehlenbach A, Guan T, Gerace L (červenec 1999). „Role pro RanBP1 při uvolňování CRM1 z komplexu jaderných pórů v terminálním kroku jaderného exportu“. J Cell Biol. 145 (4): 645–57. doi:10.1083 / jcb.145.4.645. PMC 2133185. PMID 10330396.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RANBP1 RAN binding protein 1“.
^ Singh, B B; Patel H H; Roepman R; Schick D; Ferreira P A (prosinec 1999). „Doména clusteru se zinkovým prstem RanBP2 je specifickým dokovacím místem pro jaderný exportní faktor, exportin-1“. J. Biol. Chem. 274 (52): 37370–8. doi:10.1074 / jbc.274.52.37370. ISSN 0021-9258. PMID 10601307.
^ ^A ^b ^C Plafker, K; Macara I G (květen 2000). „Facilitated Nucleocytoplasmic Shuttling of the Ran Binding Protein RanBP1“. Mol. Buňka. Biol. 20 (10): 3510–21. doi:10.1128 / MCB.20.10.3510-3521.2000. ISSN 0270-7306. PMC 85643. PMID 10779340.
^ Yaseen, NR; Blobel G (září 1999). "GTP hydrolýza spojuje zahájení a ukončení jaderného importu na nukleoporinu nup358". J. Biol. Chem. 274 (37): 26493–502. doi:10.1074 / jbc.274.37.26493. ISSN 0021-9258. PMID 10473610.
^ Ren, M; Villamarin A; Shih A; Coutavas E; Moore MS; LoCurcio M; Clarke V; Oppenheim J D; D'Eustachio P; Rush M G (duben 1995). „Samostatné domény Ran GTPázy interagují s různými faktory, aby regulovaly import jaderných proteinů a zpracování RNA“. Mol. Buňka. Biol. 15 (4): 2117–24. doi:10.1128 / MCB.15.4.2117. ISSN 0270-7306. PMC 230439. PMID 7891706.
^ Steggerda, SM; Velikonoce B M (červenec 2000). „Savčí protein Mog1 je faktorem uvolňování guaninového nukleotidu pro Ran“. J. Biol. Chem. 275 (30): 23175–80. doi:10.1074 / jbc.C000252200. ISSN 0021-9258. PMID 10811801.

Další čtení

Bischoff FR, Krebber H, Smirnova E a kol. (1995). "Koaktivace RanGTPázy a inhibice disociace GTP proteinem vázajícím Ran-GTP RanBP1". EMBO J.. 14 (4): 705–15. doi:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07049.x. PMC 398135. PMID 7882974.
Ren M, Villamarin A, Shih A a kol. (1995). „Samostatné domény Ran GTPázy interagují s různými faktory, aby regulovaly import jaderných proteinů a zpracování RNA“. Mol. Buňka. Biol. 15 (4): 2117–24. doi:10.1128 / MCB.15.4.2117. PMC 230439. PMID 7891706.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Coutavas E, Ren M, Oppenheim JD, et al. (1994). "Charakterizace proteinů, které interagují s regulačním proteinem buněčného cyklu Ran / TC4". Příroda. 366 (6455): 585–7. Bibcode:1993 Natur.366..585C. doi:10.1038 / 366585a0. PMID 8255297.
Zolotukhin AS, Felber BK (1997). „Mutace v nukleárním exportním signálu lidského proteinu vázajícího ran RanBP1 blokují reverzně zprostředkovanou posttranskripční regulaci viru lidské imunodeficience typu 1“. J. Biol. Chem. 272 (17): 11356–60. doi:10.1074 / jbc.272.17.11356. PMID 9111043.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Plafker K, Macara IG (2000). „Facilitated Nucleocytoplasmic Shuttling of the Ran Binding Protein RanBP1“. Mol. Buňka. Biol. 20 (10): 3510–21. doi:10.1128 / MCB.20.10.3510-3521.2000. PMC 85643. PMID 10779340.
Steggerda SM, Paschal BM (2000). „Savčí protein Mog1 je faktorem uvolňování guaninového nukleotidu pro Ran“. J. Biol. Chem. 275 (30): 23175–80. doi:10.1074 / jbc.C000252200. PMID 10811801.
Maynard TM, Haskell GT, Bhasin N a kol. (2002). „RanBP1, kandidátský gen pro velokardiofaciální / DiGeorgeův syndrom, je exprimován v místech mezenchymální / epiteliální indukce“. Mech. Dev. 111 (1–2): 177–80. doi:10.1016 / S0925-4773 (01) 00616-5. PMID 11804793.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Di Fiore B, Ciciarello M, Mangiacasale R a kol. (2004). „Savčí RanBP1 reguluje soudržnost centrozomu během mitózy“. J. Cell Sci. 116 (Pt 16): 3399–411. doi:10.1242 / jcs.00624. PMID 12840069.
Seewald MJ, Kraemer A, Farkasovsky M, et al. (2003). „Biochemická charakterizace systému Ran-RanBP1-RanGAP: Jsou pro reakci Ran-RanGAP GTPázy vyžadovány proteiny RanBP a kyselý ocas RanGAP?“. Mol. Buňka. Biol. 23 (22): 8124–36. doi:10.1128 / MCB.23.22.8124-8136.2003. PMC 262373. PMID 14585972.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Bohlson SS, Zhang M, Ortiz CE, Tenner AJ (2005). „CD93 interaguje s adaptorovým proteinem GIPC obsahujícím doménu PDZ: důsledky v modulaci fagocytózy“. J. Leukoc. Biol. 77 (1): 80–9. doi:10.1189 / jlb.0504305. PMID 15459234.
Collins JE, Wright CL, Edwards CA a kol. (2005). „Přístup ke klonování lidského ORFeome založený na anotaci genomu“. Genome Biol. 5 (10): R84. doi:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. PMC 545604. PMID 15461802.
Bruneel A, Labas V, Mailloux A a kol. (2006). „Proteomika lidských endoteliálních buněk z pupečníkové žíly aplikovaná na apoptózu vyvolanou etoposidem“. Proteomika. 5 (15): 3876–84. doi:10.1002 / pmic.200401239. PMID 16130169.
Takeda E, Hieda M, Katahira J, Yoneda Y (2006). „Fosforylace RanGAP1 stabilizuje jeho interakci s Ran a RanBP1“. Struktura buněk. Funct. 30 (2): 69–80. doi:10,1247 / csf.30.69. PMID 16428860.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000099901 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7616957-4] Hayashi N, Yokoyama N, Seki T, Azuma Y, Ohba T, Nishimoto T (srpen 1995). „RanBP1, vazba jaderného G proteinu podobného Ras na Ran / TC4, inhibuje RCC1 prostřednictvím Ran / TC4“. Mol Gen Genet. 247 (6): 661–9. doi:10.1007 / BF00290397. PMID 7616957.

[pmid10330396-5] Kehlenbach RH, Dickmanns A, Kehlenbach A, Guan T, Gerace L (červenec 1999). „Role pro RanBP1 při uvolňování CRM1 z komplexu jaderných pórů v terminálním kroku jaderného exportu“. J Cell Biol. 145 (4): 645–57. doi:10.1083 / jcb.145.4.645. PMC 2133185. PMID 10330396.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: RANBP1 RAN binding protein 1“.

[pmid10601307-7] Singh, B B; Patel H H; Roepman R; Schick D; Ferreira P A (prosinec 1999). „Doména clusteru se zinkovým prstem RanBP2 je specifickým dokovacím místem pro jaderný exportní faktor, exportin-1“. J. Biol. Chem. 274 (52): 37370–8. doi:10.1074 / jbc.274.52.37370. ISSN 0021-9258. PMID 10601307.

[pmid10779340-8] A ^b ^C Plafker, K; Macara I G (květen 2000). „Facilitated Nucleocytoplasmic Shuttling of the Ran Binding Protein RanBP1“. Mol. Buňka. Biol. 20 (10): 3510–21. doi:10.1128 / MCB.20.10.3510-3521.2000. ISSN 0270-7306. PMC 85643. PMID 10779340.

[pmid10473610-9] Yaseen, NR; Blobel G (září 1999). "GTP hydrolýza spojuje zahájení a ukončení jaderného importu na nukleoporinu nup358". J. Biol. Chem. 274 (37): 26493–502. doi:10.1074 / jbc.274.37.26493. ISSN 0021-9258. PMID 10473610.

[pmid7891706-10] Ren, M; Villamarin A; Shih A; Coutavas E; Moore MS; LoCurcio M; Clarke V; Oppenheim J D; D'Eustachio P; Rush M G (duben 1995). „Samostatné domény Ran GTPázy interagují s různými faktory, aby regulovaly import jaderných proteinů a zpracování RNA“. Mol. Buňka. Biol. 15 (4): 2117–24. doi:10.1128 / MCB.15.4.2117. ISSN 0270-7306. PMC 230439. PMID 7891706.

[pmid10811801-11] Steggerda, SM; Velikonoce B M (červenec 2000). „Savčí protein Mog1 je faktorem uvolňování guaninového nukleotidu pro Ran“. J. Biol. Chem. 275 (30): 23175–80. doi:10.1074 / jbc.C000252200. ISSN 0021-9258. PMID 10811801.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]